chr1	1793829	1793862	1793845	Y	CDK11B,CDK11A	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	26633	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	1840449	1840835	1840668	Y	SKI,ATAD3B,C1orf70,MIB2,MIB2,PRKCZ,GABRD	GNB1	NA	NA	NA	NA	GNB1	19954	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	2177615	2177829	2177732	Y	NADK,GNB1,TNFRSF14,SKI	C1orf86	NA	NA	NA	NA	C1orf86	35456	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	2246556	2246763	2246722	Y	SKI	NA	NA	NA	NA	NA	MORN1	74383	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	2477415	2477971	2477660	Y	NA	PANK4,TNFRSF14,FAM213B	NA	NA	NA	NA	TNFRSF14	7107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	6451759	6451831	6451795	Y	NA	ACOT7,HES2	NA	NA	NA	NA	ACOT7	620	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	6661008	6661639	6661311	Y	ZBTB48,KLHL21	NOL9,ZBTB48,PHF13,KLHL21,THAP3	NA	NA	NA	NA	PHF13	10106	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	7656791	7657175	7656983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAMP3	172154	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	8054249	8054565	8054423	Y	NA	PARK7,ERRFI1	NA	NA	NA	NA	ERRFI1	29803	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	8137301	8137521	8137361	Y	NA	NA	ERRFI1,PARK7,TNFRSF9,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERRFI1	52933	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	8262223	8262541	8262360	Y	ERRFI1	NA	ERRFI1,PARK7,SLC45A1,RERE	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC45A1	113345	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	8457012	8457408	8457307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC45A1	81126	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	9254228	9254398	9254313	Y	NA	RP3-510D11.2,H6PD	SLC2A7,SLC25A33,SPSB1,H6PD,TMEM201,MIR34A,GPR157,PIK3CD	IMR90	Hi-C	24141950	RP3-510D11.2	13965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	9488839	9489227	9489154	Y	NA	NA	SPSB1,SLC25A33,H6PD,MIR34A,GPR157	IMR90	Hi-C	24141950	SLC25A33	108314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr1	10127211	10127315	10127266	Y	KIF1B	UBE4B	NA	NA	NA	NA	UBE4B	36321	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	11968510	11969143	11969021	Y	MTHFR,CLCN6,VPS13D,MIIP	KIAA2013,PLOD1	NA	NA	NA	NA	KIAA2013	15342	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	14087510	14087640	14087574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDM2	62817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	16212759	16213091	16212941	Y	EFHD2,PLEKHM2,ZBTB17,SPEN	SPEN	NA	NA	NA	NA	SPEN	40400	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	16508402	16508642	16508565	Y	FBLIM1	EPHA2	NA	NA	NA	NA	EPHA2	27820	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	16825333	16826291	16825792	Y	NA	NA	SPATA21,NECAP2,CROCCP3,NBPF1,CROCC	IMR90	Hi-C	24141950	NECAP2	60166	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	17231253	17231704	17231392	Y	PADI4,PADI2	RP11-108M9.4	CROCC,NECAP2,CROCCP3,SPATA21,NBPF1,CROCCP2,MST1P2,ESPNP,MIR3675,ATP13A2,SDHB,PADI2,MFAP2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-108M9.4	17109	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	17240188	17240783	17240515	Y	NA	RP11-108M9.4	CROCC	K562	ChIA-PET	22265404	RP11-108M9.4	26044	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	17454855	17455288	17455072	Y	PADI4	PADI2	PADI2,PADI1,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	PADI2	10907	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	17494378	17494745	17494634	Y	NA	RP11-380J14.1	PADI2,PADI1,PADI3,PADI6	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	19533	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	17518130	17518260	17518142	Y	NA	RP11-380J14.1	NBPF1,PADI1,PADI2,PADI3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-380J14.1	3852	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	17867253	17867735	17867370	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	2923	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	17880613	17880854	17880734	Y	NA	ARHGEF10L	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10L	16283	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	19253034	19253391	19253292	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	ALDH4A1	IMR90	Hi-C	24141950	ALDH4A1	25759	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	19276270	19276542	19276361	Y	AKR7A2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	4638	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	19277155	19277462	19277361	Y	UBR4,IFFO2	ALDH4A1,IFFO2	NA	NA	NA	NA	IFFO2	3718	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	19703880	19704261	19704067	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC2	67060	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	19803913	19804113	19803998	Y	PLA2G2E,TMCO4,UBR4	CAPZB	NA	NA	NA	NA	CAPZB	5953	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	19839147	19839427	19839318	Y	NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,NBL1,AKR7A2,CAPZB	CAPZB	CAPZB,C1orf151-NBL1	IMR90	Hi-C	24141950	CAPZB	29081	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	20930711	20931037	20930891	Y	CDA	PINK1	PINK1	IMR90	Hi-C	24141950	PINK1	26911	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr1	22836447	22836690	22836500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB40	60103	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	23523350	23523682	23523502	Y	LUZP1,HTR1D	LUZP1	NA	NA	NA	NA	LUZP1	21049	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	23669506	23669991	23669712	Y	NA	HNRNPR,C1orf213,ZNF436	NA	NA	NA	NA	HNRNPR	677	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	23888678	23889201	23888997	Y	ID3	ID3	NA	NA	NA	NA	ID3	4393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	23912037	23912393	23912293	Y	PNRC2,RPL11	ID3	E2F2	IMR90	Hi-C	24141950	ID3	27752	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	24968619	24968979	24968799	Y	RUNX3,SRRM1	SRRM1	NA	NA	NA	NA	SRRM1	12412	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	25198155	25198203	25198179	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RUNX3	91409	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	26022319	26022793	26022555	Y	SEPN1	NA	NA	NA	NA	NA	SEPN1	101874	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	26120852	26121165	26120974	Y	NA	SEPN1	SEPN1	IMR90	Hi-C	24141950	SEPN1	3502	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	26947342	26948198	26947481	Y	SH3BGRL3,UBXN11,UBXN11,ZDHHC18,PIGV,GPATCH3,ARID1A,RPS6KA1	NA	RPS6KA1,ARID1A,ZDHHC18,GPATCH3,NR0B2,PIGV,SFN,GPN2,C1orf172,NUDC	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARID1A	72326	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	27527451	27527688	27527509	Y	NA	SLC9A1,WDTC1	WDTC1,SLC9A1,C1orf172	IMR90	Hi-C	24141950	WDTC1	31319	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	27625914	27626081	27626007	Y	TRNP1,MAP3K6,TMEM222	TMEM222,RP11-4K3__A.5	NA	NA	NA	NA	TMEM222	20570	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	27772061	27772370	27772216	Y	NA	WASF2	NA	NA	NA	NA	WASF2	42299	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	27924687	27925144	27924927	Y	NA	AHDC1	NA	NA	NA	NA	AHDC1	3798	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	27985480	27985709	27985578	Y	EYA3,STX12,C1orf38,FGR,FGR,FGR	IFI6	NA	NA	NA	NA	IFI6	11020	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	28098635	28098880	28098690	Y	SESN2,PTAFR,PTAFR,EYA3,FGR,FGR,FGR,STX12	FAM76A,STX12	NA	NA	NA	NA	STX12	941	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	28318645	28318992	28318812	Y	FAM76A	XKR8	NA	NA	NA	NA	XKR8	34672	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	28641770	28641993	28641852	Y	C1orf38,XKR8,EYA3,PTAFR,PTAFR,TAF12,GMEB1,SESN2,MED18	MED18	MED18	MCF7	ChIA-PET	22265404	MED18	11520	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	29563709	29564430	29563877	Y	PTPRU	MECR,PTPRU	NA	NA	NA	NA	PTPRU	2681	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	31627566	31627958	31627874	Y	SDC3,HCRTR1,NKAIN1	NA	SNRNP40,PUM1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	82443	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	31628220	31628457	31628359	Y	NA	NA	PUM1,NKAIN1,SERINC2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NKAIN1	81944	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	32253647	32254040	32253861	Y	LCK	BAI2,SPOCD1	NA	NA	NA	NA	BAI2	25153	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	32421622	32422096	32421696	Y	MARCKSL1,PEF1,PTP4A2,PTP4A2,KHDRBS1	PTP4A2	KHDRBS1,SPOCD1,PTP4A2,TINAGL1,COL16A1,PEF1,BAI2,TMEM39B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTP4A2	13165	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	33077721	33078012	33077949	Y	FNDC5	ZBTB8OS,RBBP4	NA	NA	NA	NA	ZBTB8OS	36492	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	33804359	33804743	33804679	Y	RNF19B,TRIM62,PHC2	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF362	84213	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	36103028	36103196	36103152	Y	NA	PSMB2	TFAP2E	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB2	2249	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	36616485	36616868	36616577	Y	STK40,SH3D21,CSF3R,EIF2C4,EIF2C1,EIF2C3,MAP7D1	COL8A2,TRAPPC3,MAP7D1	NA	NA	NA	NA	MAP7D1	2312	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	36849527	36849580	36849557	Y	EIF2C3,MAP7D1,THRAP3,SH3D21,STK40,CSF3R	STK40,LSM10	NA	NA	NA	NA	STK40	30	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	36866636	36866899	36866720	Y	LSM10	STK40,LSM10,OSCP1	NA	NA	NA	NA	LSM10	5143	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	38312444	38312820	38312535	Y	ZC3H12A,SNIP1,YRDC,MTF1	C1orf122,YRDC,MTF1	NA	NA	NA	NA	MTF1	10472	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	40081061	40081282	40081172	Y	BMP8A	PABPC4,HEYL	NA	NA	NA	NA	HEYL	22335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	40264988	40265120	40265045	Y	NA	NA	HEYL,PPIE,BMP8B,MFSD2A,MACF1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRIT1	82063	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	42127851	42128791	42128091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FOXO6	302257	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	42774668	42774801	42774679	Y	CCDC30,ZMYND12,RIMKLA,FOXJ3,FOXJ3,FOXJ3	FOXJ3	NA	NA	NA	NA	FOXJ3	24747	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	43388597	43388971	43388887	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	33559	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	43389220	43390772	43390027	Y	NA	SLC2A1,SLC2A1-AS1	NA	NA	NA	NA	SLC2A1	31758	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	44452990	44453115	44453039	Y	NA	IPO13,DPH2,ATP6V0B,B4GALT2,CCDC24,SLC6A9	NA	NA	NA	NA	CCDC24	1916	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	46102450	46102810	46102714	Y	NA	RP11-767N6.2,TMEM69,GPBP1L1	NA	NA	NA	NA	RP11-767N6.2	12688	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	50619908	50620155	50620032	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAF1	803780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	52173889	52173954	52173921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OSBPL9	133038	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	53092647	53093031	53092839	Y	NA	GPX7	NA	NA	NA	NA	GPX7	26603	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	55909250	55909597	55909489	Y	NA	NA	PPAP2B,PRKAA2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-466L17.1	135113	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	56795630	56795935	56795823	Y	NA	NA	PPAP2B	IMR90	Hi-C	24141950	PPAP2B	313039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	57042744	57043185	57043024	Y	C8B,C8A,C1orf168,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	65789	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	57043287	57044160	57043621	Y	PRKAA2,PPAP2B	NA	NA	NA	NA	NA	PPAP2B	64814	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	59228706	59229186	59229035	Y	NA	JUN,LINC01135	NA	NA	NA	NA	JUN	18599	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	59509588	59509786	59509693	Y	NA	NA	FGGY,MIR4711,LOC100131060,JUN,HSD52	IMR90	Hi-C	24141950	FGGY	250524	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	60598724	60598934	60598848	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NFIA	729997	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	62208815	62209373	62208933	Y	NA	TM2D1,INADL	NA	NA	NA	NA	INADL	2666	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	64051806	64051915	64051861	Y	NA	PGM1,ITGB3BP	NA	NA	NA	NA	PGM1	5032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	64254998	64255371	64255034	Y	ROR1	ROR1	NA	NA	NA	NA	ROR1	17305	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	65398951	65399446	65399123	Y	LEPROT,LEPROT,LEPR,JAK1	JAK1	NA	NA	NA	NA	JAK1	30741	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	66815726	66816360	66815919	Y	PDE4B	NA	NA	NA	NA	NA	SGIP1	180706	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	66881077	66881511	66881177	Y	PDE4B	NA	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	115555	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	66959447	66959772	66959623	Y	NA	SGIP1	PDE4B	IMR90	Hi-C	24141950	SGIP1	37294	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	68036173	68036524	68036291	Y	NA	NA	GADD45A,GNG12	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GADD45A	112220	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	68189225	68189635	68189533	Y	NA	GADD45A	NA	NA	NA	NA	GADD45A	40481	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	68257383	68257657	68257565	Y	NA	GNG12	NA	NA	NA	NA	GNG12	39493	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	35.3880566633816
chr1	70034819	70036254	70034877	Y	NA	LRRC7	NA	NA	NA	NA	LRRC7	2738	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	70238650	70238794	70238722	Y	LRRC7	NA	NA	NA	NA	NA	LRRC7	206569	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	72749220	72749791	72749447	Y	NEGR1	NEGR1	NA	NA	NA	NA	NEGR1	2803	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	77977128	77977445	77977326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZZZ3	169659	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	78404062	78404594	78404354	Y	NA	FUBP1,DNAJB4	NA	NA	NA	NA	FUBP1	38200	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	78557346	78557710	78557476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJB4	114487	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.74562508595202
chr1	82268420	82269588	82268555	Y	LPHN2	NA	NA	NA	NA	NA	ST13P20	83042	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	84710038	84710507	84710127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKACB	168293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	84970111	84970722	84970500	Y	NA	RPF1	NA	NA	NA	NA	GNG5	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	84971050	84971209	84971115	Y	MCOLN2,GNG5	RPF1,GNG5	NA	NA	NA	NA	GNG5	802	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	85034322	85034489	85034405	Y	CTBS	CTBS	NA	NA	NA	NA	CTBS	3674	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	85049005	85049203	85049109	Y	NA	CTBS	RPF1,GNG5	IMR90	Hi-C	24141950	CTBS	10842	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85791287	85791404	85791348	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	50514	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	85794698	85795078	85794848	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	53925	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	85796595	85797055	85796822	Y	CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	55822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85810010	85810182	85810130	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	69237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85816683	85816718	85816701	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	75910	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85836666	85837017	85836916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	95893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr1	85843881	85844049	85844014	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCL10	103108	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	85950230	85950550	85950520	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	91383	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85991291	85991622	85991523	Y	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	NA	DDAH1	50311	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	85992128	85992211	85992170	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	49722	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	85992810	85993270	85993105	Y	NA	DDAH1	NA	NA	NA	NA	DDAH1	48663	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	86010067	86010444	86010393	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	31489	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	86035824	86036171	86035900	Y	NA	DDAH1,CYR61	NA	NA	NA	NA	DDAH1	5762	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	86077578	86077925	86077749	Y	DDAH1,CYR61	DDAH1,CYR61	DDAH1,ZNHIT6,CYR61,COL24A1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CYR61	33134	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	87311891	87312243	87312067	Y	SH3GLB1	NA	NA	NA	NA	NA	SEP15	65864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	87800631	87801610	87800748	Y	NA	LMO4	NA	NA	NA	NA	LMO4	8480	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	89358212	89358439	89358316	Y	PKN2,CCBL2	GTF2B	NA	NA	NA	NA	GTF2B	2585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	89459818	89459853	89459836	Y	NA	CCBL2,RBMXL1,GBP3	NA	NA	NA	NA	RBMXL1	3175	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	90274070	90274340	90274210	Y	NA	LRRC8D	GEMIN8P4,ZNF326,LRRC8D	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRRC8D	10233	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	91472225	91472812	91472773	Y	NA	ZNF644	NA	NA	NA	NA	ZNF644	13017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	92048213	92048455	92048330	Y	NA	NA	TGFBR3,CDC7	IMR90	Hi-C	24141950	CDC7	83805	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	92198149	92198440	92198227	Y	TGFBR3	NA	NA	NA	NA	NA	TGFBR3	171452	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	93694062	93694249	93694102	Y	MTF2,CCDC18	TMED5	NA	NA	NA	NA	TMED5	49777	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	94038553	94038921	94038737	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1L	126865	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	94145547	94146118	94145739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCAR3	164588	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	94158601	94159338	94158654	Y	GCLM,DNTTIP2,BCAR3	NA	BCAR3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BCAR3	151368	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	94527681	94527931	94527843	Y	ARHGAP29	NA	NA	NA	NA	NA	GCLM	154715	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	97656052	97656450	97656352	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	352807	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	98011760	98012364	98012119	Y	NA	SEC63P1	NA	NA	NA	NA	SEC63P1	2503	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	98408796	98409171	98408982	Y	NA	DPYD	DPYD,MIR137HG	IMR90	Hi-C	24141950	DPYD	24191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	98425688	98426065	98426013	Y	NA	DPYD	NA	NA	NA	NA	DPYD	41083	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	98437572	98437739	98437700	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	52967	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	98479796	98480152	98480044	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYD	95191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	100140321	100140582	100140449	Y	NA	PALMD	NA	NA	NA	NA	PALMD	30822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	100858865	100858991	100858930	Y	SLC35A3,HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	50281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	100859593	100859940	100859621	Y	HIAT1,CDC14A	NA	NA	NA	NA	NA	CDC14A	51009	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	103475785	103476234	103476049	Y	COL11A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL11A1	95818	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	103572619	103572906	103572682	Y	COL11A1	COL11A1	NA	NA	NA	NA	COL11A1	567	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	109467804	109468470	109468110	Y	GPSM2,WDR47,SORT1,SORT1,PSRC1,CELSR2,CLCC1	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	35636	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	109499781	109500180	109500079	Y	NA	AKNAD1,CLCC1	NA	NA	NA	NA	AKNAD1	3926	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	109693905	109693990	109693948	Y	AKNAD1	NA	NA	NA	NA	NA	SCARNA2	53090	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	109784080	109784425	109784202	Y	NA	SARS,CELSR2,PSRC1	CELSR2	IMR90	Hi-C	24141950	CELSR2	6216	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	110548379	110548612	110548408	Y	NA	AHCYL1	NA	NA	NA	NA	AHCYL1	23071	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	111188051	111188448	111188135	Y	LRIF1,CD53	NA	KCNA3	IMR90	Hi-C	24141950	SLC16A4	256347	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	115713702	115714032	115713976	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	83581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	115732772	115733197	115732900	Y	NGF	NA	NGF	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN2	102651	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	115873164	115873576	115873409	Y	NGF	NGF	NA	NA	NA	NA	NGF	5281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	116520279	116520650	116520380	Y	ATP1A1,ATP1A1,ATP1A1,SLC22A15	SLC22A15	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	3160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	116588429	116588746	116588471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A15	71310	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	120530787	120531205	120531127	Y	NOTCH2,ZNF697	NA	NA	NA	NA	NA	NOTCH2	79035	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	144871122	144871347	144871255	Y	PDE4DIP,SEC22B,PDE4DIP,NOTCH2NL,NBPF10	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	61378	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	144941125	144941602	144941408	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NBPF9	131381	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	146764405	146764804	146764606	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	52114	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	146774989	146775112	146775013	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD1L	62698	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	149820361	149820952	149820609	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	9762	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	149821015	149821647	149821349	Y	NA	HIST2H2BF,HIST2H4A,HIST2H4B,HIST2H2BE,BOLA1,HIST2H2AB	NA	NA	NA	NA	HIST2H4B	9067	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	150510569	150510713	150510587	Y	NA	ECM1,LINC00568,ADAMTSL4,MCL1	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL4	9171	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	150577042	150577503	150577391	Y	CDC42SE1,PLEKHO1,PRPF3,FAM63A,CTSS,MCL1	MCL1,ENSA	NA	NA	NA	NA	ENSA	22585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	150800498	150800843	150800671	Y	NA	CTSK,ARNT	NA	NA	NA	NA	CTSK	21699	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	151172142	151172526	151172243	Y	FAM63A,GABPB2,SNX27,POGZ,LYSMD1,LYSMD1,TMOD4	SCNM1,LYSMD1,VPS72,PIP5K1A	NA	NA	NA	NA	PIP5K1A	3717	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	151960875	151961433	151961102	Y	S100A11,S100A10	S100A10	NA	NA	NA	NA	S100A10	3433	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	153762591	153763309	153762932	Y	NPR1	SLC27A3	NA	NA	NA	NA	SLC27A3	17761	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	153824989	153825297	153825210	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GATAD2B	68154	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	153929776	153930098	153929954	Y	NA	GATAD2B,DENND4B,CRTC2,CREB3L4,SLC39A1,JTB,RAB13,RPS27,RP11-422P24.9	NA	NA	NA	NA	CRTC2	675	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	154154606	154155027	154154830	Y	SLC27A3,DENND4B,CRTC2,IL6R,ADAR,ADAR,UBAP2L,UBAP2L,TPM3	TPM3,UBAP2L,C1orf43	NA	NA	NA	NA	TPM3	10097	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	155164183	155164959	155164537	Y	NA	TRIM46,KRTCAP2,MIR92B,MTX1,THBS3,GBAP1,GBA	NA	NA	NA	NA	MIR92B	1215	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	155945743	155946196	155946108	Y	C1orf182,ASH1L,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,GON4L,SLC25A44,RIT1,KIAA0907,ARHGEF2,ARHGEF2	KIAA0907,ARHGEF2,SSR2	RXFP4,KIAA0907	K562	ChIA-PET	22265404	ARHGEF2	28665	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	156074715	156075305	156075042	Y	YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,YY1AP1,LMNA	MEX3A,LMNA	LMNA,SLC25A44,PMF1-BGLAP,PAQR6,SMG5,C1orf182,CCT3,MEX3A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LMNA	24351	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	156541089	156541488	156541192	Y	NA	IQGAP3,APOA1BP,GPATCH4	MEF2D,C1orf61	IMR90	Hi-C	24141950	IQGAP3	693	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	156718467	156719136	156718868	Y	C1orf182,MEF2D,ETV3,ETV3,RRNAD1	CRABP2,RRNAD1,ISG20L2,MRPL24,PRCC,HDGF	NA	NA	NA	NA	PRCC	65	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	158146699	158147069	158146946	Y	NA	ELL2P1	NA	NA	NA	NA	ELL2P1	1154	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	159859603	159860031	159859945	Y	SLAMF9,COPA,SLAMF8,TAGLN2	C1orf204,CCDC19,TAGLN2	C1orf204,SLAMF8	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC19	7922	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	160203977	160204039	160204035	Y	NA	PEA15,DCAF8	NA	NA	NA	NA	PEA15	30850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	161170933	161171185	161171002	Y	ADAMTS4,NDUFS2	USP21,PPOX,B4GALT3,NDUFS2,ADAMTS4,TOMM40L	NA	NA	NA	NA	ADAMTS4	4087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	164734934	164735098	164735029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PBX1	212113	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	165345662	165345996	165345868	Y	NA	NA	LRRC52,LOC400794	IMR90	Hi-C	24141950	MGST3	252102	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	165823413	165823808	165823568	Y	NA	UCK2,TMCO1	NA	NA	NA	NA	TMCO1	28421	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	167192959	167193266	167193111	Y	NA	POU2F1	NA	NA	NA	NA	POU2F1	4893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	168149052	168149361	168149233	Y	NA	GPR161,TIPRL,RPL34P1,SFT2D2	NA	NA	NA	NA	TIPRL	2881	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	168368318	168368620	168368438	Y	TBX19	NA	NA	NA	NA	NA	TBX19	120040	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	169443033	169443373	169443298	Y	NA	SLC19A2	NA	NA	NA	NA	SLC19A2	9868	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	170633923	170634526	170634465	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	4054	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	170635008	170635144	170635076	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	5139	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	170636506	170636902	170636792	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	6637	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	170677232	170677374	170677311	Y	PRRX1	PRRX1	NA	NA	NA	NA	PRRX1	47363	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	171712214	171712716	171712399	Y	FMO4,PRRC2C	VAMP4,METTL13	NA	NA	NA	NA	VAMP4	2827	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	172863432	172863838	172863572	Y	TNFSF4,C1orf9,C1orf9,FASLG	NA	TNFSF4	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	154265	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	172878579	172879356	172878831	Y	TNFSF18	NA	TNFSF4,LOC100506023,TNFSF18,SNORD81,GAS5,SNORD75,SNORD47,SNORD79,LOC100506046,SNORD77,DARS2,SNORD78,SNORD80,ZBTB37,SNORD44,SNORD76	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	138747	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	172938789	172938985	172938853	Y	NA	NA	TNFSF4,TNFSF18	IMR90	Hi-C	24141950	TNFSF18	79118	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	172972573	172972790	172972603	Y	PRDX6	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	45313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.74562508595202
chr1	173008475	173008781	173008627	Y	TNFSF18	TNFSF18	NA	NA	NA	NA	TNFSF18	9322	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	173328578	173328674	173328661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRDX6	115731	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	178121154	178121309	178121232	Y	RASAL2	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	60290	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	178157578	178157966	178157615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	96714	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	178231351	178231525	178231428	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	170487	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	178235815	178236162	178236004	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASAL2	174951	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	178378072	178378430	178378251	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RALGPS2	313870	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	180185392	180185610	180185501	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	QSOX1	63423	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	181104473	181105818	181105427	Y	STX6,MR1,IER5	IER5	STX6,ACBD6,MR1,XPR1,KIAA1614,IER5	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IER5	48835	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	183526698	183527308	183526965	Y	SMG7,NCF2,NCF2,ARPC5	NA	NA	NA	NA	NA	ARPC5	75584	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	183594812	183595033	183594923	Y	NA	ARPC5,RGL1	NA	NA	NA	NA	ARPC5	7859	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	183846576	183846867	183846649	Y	NMNAT2,RGL1,GLT25D2	NA	NA	NA	NA	NA	TSEN15	171944	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	186090860	186091020	186090873	Y	HMCN1	NA	NA	NA	NA	NA	TPR	251805	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	186936898	186937303	186937025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	140813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr1	186964999	186965356	186965178	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLA2G4A	168914	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	193180704	193180924	193180776	Y	NA	B3GALT2	NA	NA	NA	NA	B3GALT2	26920	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	198087299	198087585	198087454	Y	NEK7	NEK7	PTPRC,NEK7,C1orf53,LHX9	IMR90	Hi-C	24141950	NEK7	36508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	198124316	198124670	198124458	Y	C1orf53,NEK7	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	198127475	198127965	198127580	Y	NA	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	3382	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	198128112	198128944	198128293	Y	PTPRC,DENND1B	NEK7	NA	NA	NA	NA	NEK7	4019	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	198590109	198590618	198590184	Y	NEK7,PTPRC	NA	NA	NA	NA	NA	NEK7	466016	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	200750000	200750140	200750089	Y	NA	CAMSAP2	NA	NA	NA	NA	CAMSAP2	43314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	201431088	201431253	201431176	Y	NA	PHLDA3,RP11-134G8.7,CSRP1	NA	NA	NA	NA	PHLDA3	5112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	201520953	201521395	201521173	Y	NA	RP11-134G8.7,CSRP1	NAV1,RPS10P7,IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	CSRP1	44369	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	201619383	201619798	201619705	Y	SHISA4,GPR37L1,NAV1	NAV1	NA	NA	NA	NA	NAV1	28972	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	201683757	201684240	201683949	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV1	93346	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	201717535	201717792	201717621	Y	NA	NA	IPO9	IMR90	Hi-C	24141950	IPO9	78477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	203481982	203482534	203482093	Y	BTG2,ATP2B4	PRELP	NA	NA	NA	NA	PRELP	39026	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr1	203524939	203525564	203525325	Y	NA	NA	ATP2B4,PRELP,LAX1,ZC3H11A,OPTC,FMOD	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	68125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	203541292	203541507	203541407	Y	NA	NA	ATP2B4,OPTC,PRELP,FMOD,ZC3H11A,LAX1	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B4	52182	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	203576404	203576703	203576575	Y	BTG2,LAX1	ATP2B4	ATP2B4,FMOD,PRELP,OPTC	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ATP2B4	16986	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	204800476	204800571	204800524	Y	PLEKHA6,PIK3C2B,LRRN2,TMCC2,NFASC,CNTN2,NFASC	NFASC	NA	NA	NA	NA	NFASC	4697	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	205265235	205265548	205265359	Y	TMEM81,KLHDC8A	NUAK2	NA	NA	NA	NA	NUAK2	23335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	206859136	206859493	206859328	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	2847	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	206859748	206860259	206859963	Y	IKBKE,RASSF5,FAIM3,FAIM3,MAPKAPK2	MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	3459	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	206926556	206926809	206926654	Y	IKBKE,RASSF5,RASSF5,DYRK3,IL19,MAPKAPK2	NA	NA	NA	NA	NA	MAPKAPK2	70267	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	207064076	207064429	207064213	Y	NA	IL24	NA	NA	NA	NA	IL24	4359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	211035320	211035533	211035504	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-543B16.1	309286	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	211500826	211501119	211501083	Y	TRAF5,TRAF5	TRAF5	NA	NA	NA	NA	TRAF5	2869	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	211988342	211989080	211989063	Y	PPP2R5A,PPP2R5A,LPGAT1	LPGAT1	NA	NA	NA	NA	LPGAT1	13034	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	212731490	212732709	212732386	Y	NA	ATF3	ATF3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	ATF3	3967	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	212811770	212812141	212812009	Y	NA	RP11-338C15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-338C15.3	24635	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr1	214512112	214512120	214512117	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMYD2	59667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	214601098	214601566	214601506	Y	PTPN14	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	122226	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	214614555	214614760	214614639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTPN14	109032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	215130656	215131050	215130800	Y	KCNK2,KCNK2	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	88579	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	215131172	215131425	215131280	Y	NA	NA	KCNK2	IMR90	Hi-C	24141950	GAPDHP24	89095	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	215198285	215198630	215198297	Y	KCNK2,KCNK2	NA	NA	NA	NA	NA	GAPDHP24	156208	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	218669910	218670282	218669996	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	152333	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	218671989	218672275	218672071	Y	NA	NA	TGFB2,LOC643723,LOC728463	IMR90	Hi-C	24141950	TGFB2	154412	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	221916049	221916599	221916319	Y	DUSP10,DUSP10	DUSP10	NA	NA	NA	NA	DUSP10	2531	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	221968806	221968942	221968913	Y	DUSP10,DUSP10	NA	NA	NA	NA	NA	DUSP10	55288	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	223914239	223914747	223914523	Y	TP53BP2,FBXO28,CAPN2	CAPN2	NA	NA	NA	NA	CAPN2	26944	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	224180261	224180516	224180350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO28	119273	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr1	225721902	225722011	225721957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LBR	107275	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	225843222	225843438	225843341	Y	NA	ENAH,RP11-145A3.1	NA	NA	NA	NA	ENAH	4378	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	226263544	226263865	226263697	Y	C1orf55	H3F3A	NA	NA	NA	NA	H3F3A	15992	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	226370122	226370365	226370224	Y	C1orf55,H3F3A,ACBD3	ACBD3	NA	NA	NA	NA	ACBD3	2066	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	228272073	228272409	228272248	Y	NA	ARF1,C1orf35,MRPL55	NA	NA	NA	NA	ARF1	3712	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	228651177	228651630	228651444	Y	HIST3H2A,HIST3H2BB	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	RNF187	IMR90	Hi-C	24141950	HIST3H2BB	7369	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	228678228	228678435	228678266	Y	NA	HIST3H2A,HIST3H2BB,RNF187	NA	NA	NA	NA	RNF187	5466	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	228782602	228782886	228782775	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	109840	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	228783962	228784250	228784107	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF187	111200	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	229699507	229699773	229699581	Y	NA	ABCB10	ABCB10	MCF7	ChIA-PET	22265404	ABCB10	7065	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	231002258	231002436	231002323	Y	C1orf198,C1orf198,C1orf198	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	899	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	231036878	231036937	231036909	Y	NA	C1orf198	NA	NA	NA	NA	C1orf198	33543	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	231531271	231531676	231531476	Y	NA	EGLN1	NA	NA	NA	NA	EGLN1	27114	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	232765644	232766127	232765957	Y	NA	NA	TSNAX-DISC1,DISC2,SIPA1L2,PCNXL2	IMR90	Hi-C	24141950	RNU1-74P	199806	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.66083344793603
chr1	234858843	234859287	234859154	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2BP2	115572	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	235114050	235115068	235114636	Y	IRF2BP2,ARID4B,ARID4B	NA	IRF2BP2,LOC100506810,LINC00184,LOC100506795,TARBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SNORA14B	174184	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	235151923	235152024	235152010	Y	ARID4B	NA	LINC00184,LOC100506795,IRF2BP2,LOC100506810	IMR90	Hi-C	24141950	SNORA14B	137228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	236430059	236430250	236430155	Y	NA	ERO1LB	NA	NA	NA	NA	ERO1LB	13069	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	240306412	240306787	240306695	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	24668	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr1	240306890	240307603	240307416	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23852	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	240307621	240308162	240308005	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	23293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	240308207	240308537	240308375	Y	NA	ADH5P3	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	22918	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	240437557	240437954	240437680	Y	FMN2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	106102	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	240476321	240476487	240476382	Y	GREM2	NA	NA	NA	NA	NA	ADH5P3	144866	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr1	243688123	243688227	243688212	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SDCCAG8	270803	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	644331	644586	644526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIP2C	89097	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	729218	729515	729367	Y	NA	DIP2C	NA	NA	NA	NA	DIP2C	4168	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	958233	958518	958406	Y	NA	LARP4B	DIP2C,GTPBP4,LARP4B	IMR90	Hi-C	24141950	LARP4B	17046	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	1240958	1241356	1241181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDR37	147480	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	3216614	3216797	3216708	Y	NA	PITRM1	NA	NA	NA	NA	PITRM1	3611	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	3856317	3856712	3856416	Y	NA	KLF6	LOC338588,LOC100216001,KLF6,AKR1E2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	30844	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	3929991	3930887	3930290	Y	KLF6	NA	LOC100216001,LOC338588,KLF6	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KLF6	104518	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	3984866	3985563	3985082	Y	KLF6	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	KLF6	159393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	4248628	4248744	4248686	Y	NA	LINC00702	LOC100216001	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	35360	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	4283808	4284356	4284092	Y	NA	NA	KLF6,LOC100216001,LOC338588	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00702	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr10	4705159	4705783	4705486	Y	NA	LINC00704	NA	NA	NA	NA	LINC00704	12563	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	5333644	5334212	5333929	Y	NA	NA	AKR1E2,tAKR	IMR90	Hi-C	24141950	NET1	118302	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	5638863	5639270	5639216	Y	NET1,CALML3	RP13-463N16.6	NET1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	RP13-463N16.6	2782	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	6171883	6172155	6171968	Y	IL15RA,RBM17,RBM17,PFKFB3,PFKFB3	RBM17,PFKFB3	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	12726	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	6298563	6298686	6298625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PFKFB3	113682	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	13908290	13908478	13908416	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	281363	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	14009769	14010162	14009916	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRPF18	382842	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	14083240	14083439	14083425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	418702	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	14624029	14624329	14624184	Y	DCLRE1C	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD4A	121888	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	15178441	15178844	15178745	Y	NA	ACBD7,RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	29848	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	15179834	15179919	15179877	Y	NA	RPP38,NMT2	NA	NA	NA	NA	NMT2	28773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	15481671	15481810	15481693	Y	NA	NA	ITGA8,FAM188A	IMR90	Hi-C	24141950	FAM171A1	70610	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	15575568	15575839	15575704	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM171A1	164507	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17044035	17044524	17044318	Y	VIM,TRDMT1,ST8SIA6	NA	NA	NA	NA	NA	RSU1	186508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17067559	17067950	17067759	Y	VIM	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	174103	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17068694	17069080	17068926	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	172973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17104584	17104750	17104681	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRDMT1	137303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17707752	17708081	17707913	Y	VIM,ST8SIA6,STAM	STAM	NA	NA	NA	NA	STAM	23628	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	17755362	17755412	17755398	Y	SLC39A12	NA	NA	NA	NA	NA	STAM	71238	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	21333319	21333508	21333415	Y	NEBL,C10orf113	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT10	487586	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	22625615	22626028	22625937	Y	DNAJC1,COMMD3,BMI1,SPAG6	COMMD3,BMI1	NA	NA	NA	NA	BMI1	17475	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	22725331	22726270	22725901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BMI1	117191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	24746901	24747210	24747047	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	263387	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr10	24754185	24754590	24754306	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	256007	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	24917417	24917574	24917542	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	93023	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	24925603	24925785	24925693	Y	ARHGAP21	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP21	84812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	26775885	26776759	26776046	Y	APBB1IP,ABI1	NA	NA	NA	NA	NA	APBB1IP	50753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	30471622	30471929	30471877	Y	KIAA1462	NA	KIAA1462,SVIL	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1462	69199	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	31805465	31805855	31805582	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB1-AS1	198089	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	31986692	31987073	31986913	Y	NA	NA	ARHGAP12,ZEB1,ZNF438	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	228669	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	32040213	32040692	32040500	Y	NA	NA	ZNF438,ZEB1	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGAP12	175050	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	32048872	32049424	32049213	Y	ZEB1,KIF5B	NA	ZNF438,ZEB1,ARHGAP12,LYZL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ARHGAP12	166318	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr10	32316515	32316560	32316538	Y	NA	KIF5B	NA	NA	NA	NA	KIF5B	26799	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	32438322	32438553	32438446	Y	NA	RPS4XP11	KIF5B,ARHGAP12,EPC1	IMR90	Hi-C	24141950	RPS4XP11	48101	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	32611846	32612286	32612204	Y	EPC1	NA	NA	NA	NA	NA	EPC1	53440	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	32735821	32736068	32735865	Y	NA	CCDC7	C10orf68	MCF7	ChIA-PET	22265404	CCDC7	2753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	33503049	33503394	33503286	Y	ITGB1	NA	NA	NA	NA	NA	NRP1	119796	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	35102675	35103059	35102787	Y	NA	PARD3	NA	NA	NA	NA	PARD3	422	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	38015584	38015624	38015604	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF248	129410	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	43633157	43633403	43633253	Y	RASGEF1A	CSGALNACT2	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT2	1223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr10	49814365	49814537	49814402	Y	ARHGAP22	ARHGAP22	NA	NA	NA	NA	ARHGAP22	47773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	50776206	50776746	50776485	Y	PGBD3,ERCC6,CHAT,SLC18A3	PGBD3,ERCC6,SLC18A3	NA	NA	NA	NA	ERCC6	30622	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	50787572	50787883	50787845	Y	NA	PGBD3,ERCC6,SLC18A3	NA	NA	NA	NA	SLC18A3	28464	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	52081951	52082279	52082036	Y	FAM21A	NA	NA	NA	NA	NA	DYNC1I2P1	59213	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	52751732	52752116	52752062	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	2787	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	52753196	52753414	52753311	Y	PRKG1	PRKG1	NA	NA	NA	NA	PRKG1	4251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	54078280	54078480	54078433	Y	NA	DKK1	NA	NA	NA	NA	DKK1	6224	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	54246557	54246950	54246727	Y	DKK1	NA	DKK1,LOC100506939,PRKG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DKK1	174501	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	61632760	61633170	61633000	Y	NA	CCDC6	NA	NA	NA	NA	CCDC6	31244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	61992765	61993042	61992980	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC6	328351	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	63842469	63842743	63842551	Y	ARID5B	NA	NA	NA	NA	NA	ARID5B	183410	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	64320064	64320236	64320175	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	242280	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr10	64342532	64342939	64342724	Y	EGR2,EGR2	NA	NA	NA	NA	NA	ADO	219577	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	65196810	65197156	65196994	Y	NA	JMJD1C	NA	NA	NA	NA	JMJD1C	26566	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	65389747	65390882	65390384	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	REEP3	110624	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	69854882	69855277	69855187	Y	HERC4	HERC4	ATOH7,HNRNPH3,PBLD,MYPN,HERC4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HERC4	21777	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	71655656	71655993	71655813	Y	COL13A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	96012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	71662112	71662205	71662157	Y	H2AFY2	NA	NA	NA	NA	NA	COL13A1	102468	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	72424506	72424875	72424691	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	KIAA1274,PRF1,ADAMTS14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ADAMTS14	5684	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	72433363	72433696	72433541	Y	ADAMTS14	ADAMTS14	NA	NA	NA	NA	ADAMTS14	2804	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	72973788	72974249	72973953	Y	UNC5B	UNC5B	NA	NA	NA	NA	UNC5B	3461	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	73568339	73568950	73568859	Y	NA	C10orf54,PSAP	NA	NA	NA	NA	C10orf54	37084	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	74080430	74080993	74080646	Y	PSAP,DDIT4,DNAJB12	DDIT4,DNAJB12	DDIT4,ANAPC16	IMR90	Hi-C	24141950	DNAJB12	31995	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	75648556	75649146	75648996	Y	ANXA7,NDST2	CAMK2G,PLAU	SEC24C,FUT11,LOC100507331,CAMK2G,NDST2,KIAA0913,VCL,PLAU,C10orf55,AP3M1,ADK	IMR90	Hi-C	24141950	CAMK2G	16213	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	75805462	75805520	75805491	Y	NA	VCL	NA	NA	NA	NA	VCL	49590	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	79176142	79176460	79176291	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	219893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	79265772	79266169	79265902	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	130184	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	79291885	79292096	79291976	Y	KCNMA1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMA1	104257	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	79685177	79685609	79685373	Y	NA	DLG5	NA	NA	NA	NA	DLG5	799	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	80626499	80626705	80626607	Y	NA	NA	LOC283050,ZMIZ1,RPS24,LOC100132987,POLR3A	IMR90	Hi-C	24141950	ZMIZ1	200087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	80732492	80734123	80733460	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	92669	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	80737664	80737999	80737882	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	ZMIZ1	88793	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	81001444	81002226	81001825	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	102999	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	81025991	81026714	81026492	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	78511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	81042130	81042560	81042322	Y	ZMIZ1,PPIF	NA	NA	NA	NA	NA	PPIF	62665	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	81059255	81059879	81059575	Y	ZMIZ1,PPIF	PPIF	NA	NA	NA	NA	PPIF	45346	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	81962798	81963579	81963388	Y	SH2D4B,ANXA11	EIF5AP4	NA	NA	NA	NA	ANXA11	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	88470805	88471213	88471023	Y	NA	LDB3,BMPR1A	NA	NA	NA	NA	BMPR1A	43194	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	90711253	90711764	90711560	Y	LIPF,CH25H,ACTA2	FAS,ACTA2	NA	NA	NA	NA	FAS	36650	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr10	92676361	92676755	92676735	Y	NA	RPP30,ANKRD1	NA	NA	NA	NA	ANKRD1	2278	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	92783161	92783490	92783369	Y	NA	RP11-236B18.2	PCGF5,ANKRD1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-236B18.2	30784	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	92921990	92922253	92922075	Y	HECTD2	NA	ANKRD1,PCGF5,RPP30,NUDT9P1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	55655	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	4.88111126391471
chr10	92923893	92924265	92924064	Y	NA	NA	RPP30,NUDT9P1,PCGF5	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PCGF5	53643	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	92928766	92928934	92928784	Y	NA	PCGF5	RPP30	IMR90	Hi-C	24141950	PCGF5	48974	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	93254153	93254526	93254340	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HECTD2	86057	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	93320562	93320757	93320661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	70054	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	93367671	93367850	93367762	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	22961	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	93373148	93373298	93373228	Y	NA	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	17513	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	93373465	93373915	93373562	Y	PPP1R3C	PPP1R3C	NA	NA	NA	NA	PPP1R3C	16896	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	5.18618071790938
chr10	95128871	95128891	95128880	Y	CYP26C1	NA	NA	NA	NA	NA	MYOF	111183	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	95195782	95196689	95196040	Y	MYOF	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	43385	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	95196959	95197603	95197264	Y	NA	MYOF	NA	NA	NA	NA	MYOF	42471	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	95222493	95222944	95222696	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	17130	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	95225325	95225770	95225711	Y	MYOF	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	14304	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr10	95226262	95226423	95226291	Y	NA	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	13651	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	95228207	95228553	95228471	Y	MYOF,CEP55,CEP55	MYOF,CEP55	NA	NA	NA	NA	MYOF	11521	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr10	98332019	98332237	98332217	Y	NA	TM9SF3	NA	NA	NA	NA	TM9SF3	12972	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	99302007	99302242	99302124	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	39889	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	99302907	99303185	99303057	Y	RRP12,PI4K2A	MMS19,UBTD1,PI4K2A	HOGA1,ANKRD2	IMR90	Hi-C	24141950	PI4K2A	38946	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	99401742	99402052	99401841	Y	C10orf28,RRP12,ZFYVE27,PI4K2A	MORN4,AVPI1	NA	NA	NA	NA	MORN4	10398	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	100019738	100019959	100019849	Y	C10orf28	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	6048	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	100020230	100020246	100020237	Y	NA	LOXL4	NA	NA	NA	NA	LOXL4	5761	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	100120877	100121283	100120897	Y	PYROXD2,LOXL4	NA	PYROXD2,C10orf28,LOXL4,HPS1	IMR90	Hi-C	24141950	PYROXD2	51658	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr10	101765990	101766360	101766233	Y	NA	DNMBP	NA	NA	NA	NA	DNMBP	1316	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr10	104401686	104402330	104401988	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM8	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	105456300	105456542	105456434	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2A	156759	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	110138864	110139232	110139127	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-163F15.1	180341	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	111766410	111766784	111766651	Y	ADD3	ADD3	NA	NA	NA	NA	ADD3	12284	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	111971446	111971590	111971518	Y	NA	MXI1	NA	NA	NA	NA	MXI1	6083	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	112263780	112264181	112263965	Y	SHOC2,PDCD4,BBIP1,BBIP1,DUSP5	DUSP5	NA	NA	NA	NA	DUSP5	8184	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	112668159	112668425	112668161	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	8607	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	112674359	112675211	112674854	Y	NA	PDCD4,PDCD4-AS1,BBIP1,SHOC2,RPL13AP6	NA	NA	NA	NA	BBIP1	1821	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	114531236	114531374	114531260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	176635	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	114853789	114854299	114853993	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	145780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	114859283	114859636	114859547	Y	TCF7L2	NA	NA	NA	NA	NA	TCF7L2	151274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	115033869	115034403	115034068	Y	NA	NA	TECTB,GUCY2GP,VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	TCF7L2	325860	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr10	115080756	115081288	115080948	Y	CASP7,TCF7L2	NA	VTI1A	IMR90	Hi-C	24141950	CASP7	355654	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	119113606	119113787	119113696	Y	NA	PDZD8	NA	NA	NA	NA	PDZD8	19191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	119294820	119294982	119294904	Y	EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2	4973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	119305717	119306203	119305928	Y	EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	3138	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	119311834	119312129	119311974	Y	RAB11FIP2,EMX2	EMX2,EMX2OS	NA	NA	NA	NA	EMX2OS	9255	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	120072477	120072945	120072874	Y	NA	FAM204A	NA	NA	NA	NA	FAM204A	26895	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	121829686	121829950	121829715	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NACAP2	74465	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	122963331	122963557	122963437	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-159H3.1	72094	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	123914446	123914761	123914722	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TACC2	167757	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	124254349	124254758	124254614	Y	NA	HTRA1	NA	NA	NA	NA	HTRA1	35308	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	125754916	125755682	125755196	Y	CHST15	NA	NA	NA	NA	NA	CPXM2	57133	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	125847012	125847291	125847256	Y	NA	CHST15	NA	NA	NA	NA	CHST15	3915	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	125990441	125990533	125990483	Y	NA	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	115012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	126021099	126021412	126021201	Y	CHST15	NA	CHST15	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	84133	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	126029584	126030073	126029818	Y	CHST15	NA	HMX3	IMR90	Hi-C	24141950	OAT	75472	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr10	126315526	126315929	126315823	Y	FAM53B	NA	NA	NA	NA	NA	FAM53B	114909	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	127916240	127916659	127916465	Y	ADAM12	NA	NA	NA	NA	NA	ADAM12	158365	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	127931562	127931630	127931605	Y	NA	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	143394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	127932254	127933051	127932680	Y	ADAM12	NA	FANK1	IMR90	Hi-C	24141950	ADAM12	141973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	129775759	129776314	129776065	Y	PTPRE,PTPRE	NA	NA	NA	NA	NA	MKI67	146335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	131819686	131819939	131819817	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EBF3	59581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	133776164	133776302	133776237	Y	NA	BNIP3	NA	NA	NA	NA	BNIP3	17133	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr10	133879247	133879524	133879406	Y	NA	NA	BNIP3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BNIP3	85812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	944711	944765	944751	Y	NA	CHID1,AP2A2	NA	NA	NA	NA	AP2A2	21817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	1241085	1241212	1241149	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TOLLIP	87672	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	2402008	2402516	2402305	Y	KCNQ1	RPL26P30,CD81,CD81-AS1,TSSC4	NA	NA	NA	NA	CD81-AS1	4786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	2669931	2670236	2670070	Y	INS,ASCL2,TRPM5	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	48988	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	2717684	2718130	2717946	Y	TSSC4,TRPM5,KCNQ1	KCNQ1OT1	NA	NA	NA	NA	KCNQ1OT1	1094	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	5647526	5647619	5647574	Y	OR51B2,OR51Q1,OR56B4,OR56A3,OR56A1,OR52N2,OR52E6,OR52N4,TRIM34,TRIM5,TRIM22	TRIM6,TRIM6-TRIM34,TRIM34,AC015691.13	NA	NA	NA	NA	AC015691.13	3400	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	6667820	6668268	6668018	Y	OR6A2,DCHS1	RRP8,ILK,TAF10,RP11-732A19.9,TPP1,DCHS1,MRPL17	NA	NA	NA	NA	DCHS1	6817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	9732058	9732249	9732166	Y	NA	SWAP70,SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	45590	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	9824167	9824574	9824403	Y	NA	SBF2-AS1	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	46328	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	10003812	10004242	10004040	Y	ADM	NA	NA	NA	NA	NA	SBF2-AS1	225973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	10404161	10404389	10404339	Y	ADM	NA	SWAP70,SBF2,LOC283104,MRVI1-AS1,AMPD3,MRVI1,MTRNR2L8,RNF141,LYVE1,ADM	IMR90	Hi-C	24141950	AMPD3	76301	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	10549004	10549441	10549205	Y	AMPD3,AMPD3,MRVI1,MRVI1,RNF141	MTRNR2L8,RNF141,MRVI1-AS1	NA	NA	NA	NA	RNF141	11336	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	12101706	12102070	12101803	Y	DKK3,DKK3,PARVA,MICALCL,MICAL2	RP13-631K18.5,MICAL2	MICAL2,DKK3,USP47,MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	RP13-631K18.5	4368	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	12146355	12146795	12146568	Y	NA	RP13-631K18.5,MICAL2	NA	NA	NA	NA	MICAL2	32812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	12181262	12181458	12181363	Y	MICALCL,MICAL2	NA	MICALCL	IMR90	Hi-C	24141950	MICAL2	67719	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	12186762	12187077	12186920	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MICAL2	73219	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	12309352	12309734	12309588	Y	TEAD1,DKK3,MICAL2,PARVA,MICALCL	NA	NA	NA	NA	NA	PARVA	86998	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	12697923	12698543	12698251	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	3954	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr11	12698857	12698926	12698896	Y	PARVA,TEAD1	TEAD1	NA	NA	NA	NA	TEAD1	4888	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	13405133	13405443	13405288	Y	ARNTL	NA	NA	NA	NA	NA	BTBD10	77401	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	14306265	14306627	14306419	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RRAS2	77425	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	17335831	17335998	17335921	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NUCB2	108131	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	18404883	18405218	18405078	Y	LDHA	LDHA,AC084117.3	NA	NA	NA	NA	LDHA	8717	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	19957110	19957424	19957380	Y	NAV2	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	425807	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	20016658	20016921	20016770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HTATIP2	366310	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	27682701	27682852	27682777	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BDNF	58753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	27693843	27694020	27693988	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	BDNF	NA	NA	NA	NA	BDNF	47585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	27956455	27956618	27956527	Y	BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF,BDNF	RP11-1033A18.1	BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-1033A18.1	45875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	28779294	28779601	28779473	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	651439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	28857853	28858464	28857991	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	729998	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr11	29207165	29207501	29207312	Y	NA	NA	BDNF,BDNF-AS1,KIF18A	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1079310	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	29321986	29322293	29322123	Y	NA	NA	BDNF-AS1,BDNF	IMR90	Hi-C	24141950	KIF18A	1194131	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	33096691	33097088	33096864	Y	NA	TCP11L1	NA	NA	NA	NA	TCP11L1	37728	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	33568178	33568383	33568283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-130L23.1	145416	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	33723473	33723762	33723676	Y	NA	CD59	NA	NA	NA	NA	CD59	32229	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	35052236	35052689	35052493	Y	CD44	NA	SLC1A2,CD44,PDHX	IMR90	Hi-C	24141950	CD44	105728	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	35187357	35188072	35187739	Y	NA	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	28940	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	35204984	35205337	35205050	Y	CD44	CD44	NA	NA	NA	NA	CD44	46567	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	45201958	45202605	45202216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TP53I11	231118	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	46094625	46094954	46094790	Y	NA	PHF21A	NA	NA	NA	NA	PHF21A	46031	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	46444740	46444848	46444831	Y	NA	MDK	NA	NA	NA	NA	MDK	44434	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	47208524	47208884	47208580	Y	PACSIN3,PACSIN3,NR1H3	ARFGAP2,PACSIN3,DDB2	NA	NA	NA	NA	PACSIN3	2530	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	47573563	47574025	47573747	Y	NR1H3,SPI1,PTPRJ,CELF1,CELF1,CELF1	NDUFS3,PTPMT1,CELF1,KBTBD4	NA	NA	NA	NA	NDUFS3	10863	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr11	58292918	58293075	58292951	Y	LPXN	NA	NA	NA	NA	NA	LPXN	50618	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	58340867	58341571	58341167	Y	OR5B21,ZFP91,LPXN,LPXN	LPXN,ZFP91,ZFP91-CNTF	NA	NA	NA	NA	LPXN	2122	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	61146248	61146454	61146376	Y	SLC15A3,VPS37C,DAGLA,CYBASC3,TMEM138,CYBASC3,SDHAF2,CPSF7,CPSF7	DAK,DDB1,TMEM138,TMEM216,CPSF7,SDHAF2	NA	NA	NA	NA	TMEM216	10705	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	61739990	61740514	61740301	Y	NA	FTH1	NA	NA	NA	NA	FTH1	6858	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	61781118	61781313	61781282	Y	DAGLA,FTH1	FTH1	FADS1,BEST1,FTH1,FADS3	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FTH1	47986	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	61872496	61872975	61872791	Y	DAGLA,FTH1	INCENP	FEN1,C11orf10,FADS3,BEST1,RAB3IL1,FADS2,C11orf9,DAGLA,DKFZP434K028,FADS1,FTH1,INCENP	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	INCENP	16470	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	62211626	62212261	62212170	Y	FTH1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	99210	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	62310227	62311393	62310863	Y	WDR74,UBXN1,STX5,SLC3A2,NXF1,EML3,AHNAK	RP11-864I4.4,AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	78	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	62311446	62311797	62311501	Y	WDR74,STX5,NXF1,AHNAK	AHNAK,EEF1G,MIR3654,TUT1	NA	NA	NA	NA	RP11-864I4.4	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	63639638	63639903	63639715	Y	NA	MARK2,RCOR2	NA	NA	NA	NA	MARK2	35238	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	63858567	63858836	63858756	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MACROD1	72742	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	64147622	64147982	64147957	Y	NA	RPS6KA4	NA	NA	NA	NA	RPS6KA4	23002	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	64427372	64427588	64427564	Y	BATF2	NA	NA	NA	NA	NA	SF1	116670	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65058176	65058598	65058417	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	21691	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65059737	65059988	65059827	Y	EHD1,BATF2,FAU,SLC25A45,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,CDC42EP2	POLA2,CDC42EP2,DPF2	NA	NA	NA	NA	CDC42EP2	20301	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	65185589	65187086	65186338	Y	NA	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	1159	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65187297	65188198	65187553	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,TIGD3,KCNK7,SIPA1,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	SLC25A45,FRMD8,NEAT1,AP000769.1	NEAT1	IMR90	Hi-C	24141950	NEAT1	47	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65238917	65239096	65239037	Y	CDC42EP2,RELA,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1	TIGD3	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18189	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65239550	65239870	65239751	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,KCNK7,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1	TIGD3,SCYL1	K562	ChIA-PET	22265404	AP000769.1	18822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	65244638	65245303	65245021	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,SIPA1,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	MALAT1	17930	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	65248969	65249218	65249208	Y	SNX32	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	FRMD8,SLC25A45,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1,MALAT1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	14015	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65259217	65259522	65259389	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3711	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65259637	65259913	65259840	Y	SNX32,EFEMP2,DRAP1,C11orf68	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	3320	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	65259930	65260851	65260542	Y	BATF2,FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198,SLC25A45,FRMD8	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	2382	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr11	65261229	65261625	65261527	Y	CDC42EP2	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	MALAT1,POLA2,DPF2,SLC25A45,FRMD8,TIGD3,NEAT1,MIR612,SCYL1	IMR90	Hi-C	24141950	MALAT1	1608	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr11	65261988	65262329	65262152	Y	FAU,CDC42EP2,RELA,MAP3K11,KAT5,EHBP1L1,DKFZp761E198	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	904	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65264635	65265953	65265057	Y	NA	AP000769.1,MALAT1,SCYL1	NA	NA	NA	NA	MALAT1	1402	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr11	65537213	65537543	65537499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNASEH2C	50795	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65666492	65667203	65666864	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,EHBP1L1,MAP3K11,RELA,KAT5,YIF1A,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,DKFZp761E198,CFL1,FIBP,CCDC85B	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	448	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	65670692	65670945	65670845	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,SF3B2,RAB1B,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	MUS81,CFL1,EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1	NA	NA	NA	NA	FOSL1	4648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65679250	65679576	65679373	Y	RIN1,BRMS1,SCYL1,SSSCA1,PCNXL3,RNASEH2C,CFL1,MUS81,FIBP,CCDC85B,YIF1A,RAB1B,KLC2,KLC2,KLC2,FOSL1,DRAP1,C11orf68,BANF1	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	5012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	65683105	65683625	65683322	Y	NA	EFEMP2,FIBP,CCDC85B,FOSL1,C11orf68,DRAP1,SART1	NA	NA	NA	NA	C11orf68	963	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.05069453994669
chr11	65782974	65783337	65783107	Y	FOSL1	BANF1,EIF1AD,CST6,CATSPER1,SF3B2	NA	NA	NA	NA	CST6	5662	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	66080826	66081241	66080906	Y	CD248	RAB1B,CNIH2,YIF1A,TMEM151A,CD248,RIN1,BRMS1,B3GNT1,RP11-867G23.8	NA	NA	NA	NA	CD248	1274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	67138852	67139479	67139267	Y	NA	POLD4,RAD9A,CARNS1,PPP1CA	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	67146992	67147327	67147282	Y	NA	POLD4,AP003419.11,RAD9A,CARNS1,PPP1CA,RPS6KB2	NA	NA	NA	NA	AP003419.11	7937	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	68121765	68121884	68121804	Y	ALDH3B1,C11orf24	LRP5	NA	NA	NA	NA	LRP5	43688	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	69453520	69454472	69453912	Y	NA	ORAOV1	NA	NA	NA	NA	CCND1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	72449101	72449742	72449392	Y	P2RY2,P2RY2,FCHSD2,ATG16L2,PDE2A,ARAP1,ARAP1	NA	NA	NA	NA	NA	ARAP1	52902	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	73014768	73014913	73014905	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	2421	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	73034605	73034942	73034774	Y	NA	ARHGEF17	NA	NA	NA	NA	ARHGEF17	17271	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	74578028	74578161	74578096	Y	OR2AT4,XRRA1,RNF169	NA	NA	NA	NA	NA	XRRA1	80084	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	75041361	75041638	75041486	Y	ARRB1	ARRB1	NA	NA	NA	NA	ARRB1	19235	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	77751153	77751354	77751183	Y	NA	INTS4,NDUFC2-KCTD14,NDUFC2	NA	NA	NA	NA	NDUFC2-KCTD14	37557	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	78798308	78798462	78798392	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	514389	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	79148505	79148822	79148543	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NARS2	864586	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	82961020	82961401	82961211	Y	NA	RP11-727A23.1,CCDC90B	NA	NA	NA	NA	CCDC90B	34049	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	85463912	85464270	85464111	Y	CREBZF,SYTL2,SYTL2,EED,SYTL2,SYTL2	NA	CCDC89	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL2	55914	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	85768953	85769276	85769115	Y	NA	PICALM	NA	NA	NA	NA	PICALM	9648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	86451588	86451883	86451813	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	48218	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	86454484	86454767	86454607	Y	NA	PRSS23	PRSS23,ME3,CCDC81	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PRSS23	45334	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	86631607	86631965	86631913	Y	ME3,ME3,ME3,TMEM135,FZD4	FZD4,RP11-736K20.6	ME3	IMR90	Hi-C	24141950	FZD4	32468	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	86642953	86643307	86643130	Y	NA	FZD4,RP11-736K20.6	NA	NA	NA	NA	FZD4	21126	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	86664236	86664677	86664307	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FZD4,RP11-736K20.6	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	87133739	87133898	87133788	Y	NA	NA	GRM5,FZD4,LOC100506368	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM135	386853	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	93863761	93864262	93864073	Y	MED17,FUT4,PANX1	PANX1	NA	NA	NA	NA	PANX1	3667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr11	94336010	94336194	94336103	Y	PANX1,ANKRD49,FUT4	NA	NA	NA	NA	NA	FUT4	60993	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	95557234	95557451	95557366	Y	NA	CEP57,FAM76B	NA	NA	NA	NA	FAM76B	35661	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	95888064	95888524	95888506	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAML2	185820	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	96040167	96040456	96040282	Y	MAML2	MAML2	NA	NA	NA	NA	MAML2	33888	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	100747572	100748094	100747776	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP42	191188	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	101386837	101386845	101386841	Y	TRPC6	NA	NA	NA	NA	NA	TRPC6	354448	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	102042993	102043398	102043047	Y	C11orf70,TMEM123,YAP1,YAP1	NA	NA	NA	NA	NA	YAP1	63801	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	102231981	102232209	102232014	Y	TMEM123,BIRC3,BIRC2	BIRC3,BIRC2	NA	NA	NA	NA	BIRC2	16039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	102678364	102678503	102678434	Y	NA	MMP1,MMP3	NA	NA	NA	NA	MMP1	11473	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	105115100	105115515	105115329	Y	CASP4,CASP5,CARD16,CARD17	NA	GRIA4	IMR90	Hi-C	24141950	CARD16,CASP1	144942	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	110220556	110220727	110220626	Y	ZC3H12C,FDX1,RDX	NA	C11orf53,RDX	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RDX	55109	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	111402540	111402739	111402658	Y	NA	LAYN	NA	NA	NA	NA	LAYN	6266	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	114224881	114225192	114225037	Y	NA	RBM7,C11orf71	FAM55B,REXO2,C11orf71,RBM7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RBM7	43560	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	114344821	114345220	114345021	Y	NA	REXO2	NA	NA	NA	NA	REXO2	36713	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	115945238	115945510	115945465	Y	NA	NA	CADM1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00900	315893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	118481750	118482023	118481896	Y	PHLDB1	ARCN1,IFT46,PHLDB1	NA	NA	NA	NA	PHLDB1	6595	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	118783640	118784096	118783954	Y	NA	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	10221	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	118784118	118784508	118784405	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	9809	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	118788249	118788453	118788294	Y	MLL,PHLDB1,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,C2CD2L,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	5864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	118793665	118793922	118793750	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	395	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr11	118794621	118795305	118795013	Y	MLL,DDX6,VPS11,RPS25,CBL,CCDC84	BCL9L	NA	NA	NA	NA	BCL9L	304	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	121699845	121700197	121699934	Y	BLID	NA	MIR100HG,MIR125B1,BLID	IMR90	Hi-C	24141950	MIR125B1	268355	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	121906863	121907080	121906924	Y	NA	NA	SORL1,MIR125B1,MIR100HG	IMR90	Hi-C	24141950	MIR125B1	61472	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	121915938	121916278	121916104	Y	NA	NA	MIR100HG,MIR125B1,BLID,SORL1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR125B1	52274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	121947541	121947705	121947629	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1	NA	NA	NA	NA	MIR125B1	20847	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	121983293	121983692	121983594	Y	NA	MIR125B1,RP11-166D19.1,MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	RP11-166D19.1	1339	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	122049218	122049681	122049522	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	28202	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	122063445	122063834	122063519	Y	NA	MIRLET7A2,MIR100	NA	NA	NA	NA	MIR100	42429	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	122586167	122586342	122586202	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	61784	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	122614600	122615453	122614815	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	90217	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	122616909	122617169	122616983	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBASH3B	92526	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	122888881	122889273	122889127	Y	NA	RPL34P23,HSPA8	NA	NA	NA	NA	RPL34P23	15302	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	125983623	125983738	125983673	Y	CDON	NA	HYLS1	IMR90	Hi-C	24141950	CDON	52393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	126189109	126189259	126189183	Y	HYLS1	TIRAP,DCPS,RP11-712L6.5,ST3GAL4	NA	NA	NA	NA	RP11-712L6.5	16896	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	126290424	126290762	126290592	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	66889	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	126449480	126449697	126449589	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	225945	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	126515042	126515485	126515173	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ST3GAL4	291507	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	128348079	128348401	128348240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	107052	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	128376891	128377234	128377096	Y	ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	78219	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	128387749	128388099	128387998	Y	FLI1,FLI1,ETS1	NA	NA	NA	NA	NA	ETS1	67354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	129781322	129781453	129781412	Y	APLP2	NFRKB	NA	NA	NA	NA	NFRKB	17837	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	130392180	130392594	130392285	Y	NA	NA	SNX19,ADAMTS15	IMR90	Hi-C	24141950	ADAMTS15	75311	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	130743628	130743895	130743754	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	40509	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	130767172	130767510	130767285	Y	NA	SNX19	NA	NA	NA	NA	SNX19	16894	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	131787624	131787840	131787727	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1003220	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	131902527	131902770	131902649	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1118123	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	131942118	131942474	131942248	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1157714	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	131942733	131942935	131942834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1158329	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	131995649	131996509	131995944	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1211245	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	132162679	132162975	132162706	Y	NTM	NA	NA	NA	NA	NA	SNX19	1378275	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr11	132502586	132503019	132502881	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	1397148	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr11	132774283	132774643	132774625	Y	OPCML	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-713P17.3	1125524	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1026879	1027238	1027070	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAD52	69981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1583254	1583583	1583419	Y	NA	NA	LOC100292680	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	53474	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1640952	1641788	1641475	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	3895	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1643252	1643620	1643470	Y	NA	WNT5B	ERC1,LOC100292680,FBXL14	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5B	6195	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	1698978	1699322	1699295	Y	NA	FBXL14	NA	NA	NA	NA	FBXL14	2009	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1759390	1759637	1759510	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	36103	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	1769144	1769497	1769318	Y	NA	ADIPOR2	NA	NA	NA	NA	ADIPOR2	26243	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	2364427	2364812	2364581	Y	LRTM2	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	252726	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	2374154	2374447	2374269	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	262453	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	2432824	2433067	2432925	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DCP1B	321123	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	2893281	2893436	2893294	Y	NRIP2	FKBP4,ITFG2,RP4-816N1.6	NRIP2,CACNA1C,FKBP4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FKBP4	8683	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	5542952	5543350	5543174	Y	NTF3,NTF3	NTF3	NA	NA	NA	NA	NTF3	3674	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr12	6404239	6404667	6404531	Y	NA	TNFRSF1A	VWF,PLEKHG6,TNFRSF1A,CD9,IFFO1,GAPDH,NCAPD2	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF1A	44613	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	6445143	6445640	6445507	Y	VAMP1,TAPBPL,CHD4,CD4,CD4,TNFRSF1A	TNFRSF1A,LTBR	NA	NA	NA	NA	TNFRSF1A	3640	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	6684613	6684668	6684641	Y	NA	GAPDH,IFFO1,NOP2,CHD4	NA	NA	NA	NA	NOP2	8756	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	7104040	7104360	7104246	Y	NA	EMG1,SCARNA12,PHB2,C1S,LPCAT3	NA	NA	NA	NA	C1S	9689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	7592182	7592797	7592685	Y	PEX5,NANOG	RP11-157G21.2,CD163L1	NA	NA	NA	NA	RP11-157G21.2	1596	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	8123169	8123746	8123395	Y	CLEC6A,NECAP1,FOXJ2,CLEC4A,C3AR1,SLC2A3	SLC2A3	SLC2A3,FOXJ2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC2A3	36298	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr12	9926148	9926473	9926272	Y	CLEC2A,CD69	NA	NA	NA	NA	NA	CLEC2B	94262	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	10794413	10794704	10794528	Y	NA	MAGOHB,STYK1	NA	NA	NA	NA	MAGOHB	30191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	10869298	10869573	10869459	Y	NA	STYK1	NA	NA	NA	NA	STYK1	44381	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	11950553	11950830	11950618	Y	ETV6,BCL2L14	NA	NA	NA	NA	NA	ETV6	149765	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	12185852	12185959	12185898	Y	ETV6,BCL2L14	NA	ETV6,LOC338817,CDKN1B,BCL2L14,MANSC1,LOH12CR2,LOH12CR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LRP6	231987	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	13025126	13025347	13025203	Y	NA	RPL13AP20,GPRC5A	NA	NA	NA	NA	RPL13AP20	1086	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	13145446	13145954	13145521	Y	DUSP16,EMP1	HTR7P1,HEBP1,KIAA1467	NA	NA	NA	NA	HTR7P1	4858	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	13251023	13251431	13251083	Y	EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	55805	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	13253893	13254547	13254171	Y	CDKN1B,EMP1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1467	58675	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	13376138	13376415	13376269	Y	HEBP1	EMP1	NA	NA	NA	NA	EMP1	28488	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	16554253	16554721	16554664	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MGST1	56177	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	20099675	20099840	20099742	Y	PDE3A	NA	LOC100506393,PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE3A	420339	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr12	20124309	20124606	20124452	Y	PDE3A	NA	PDE3A	IMR90	Hi-C	24141950	PDE3A	395573	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	20193417	20193449	20193433	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	326730	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	20197708	20198008	20197858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE3A	322171	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	25053045	25053436	25053335	Y	KRAS,BCAT1,BCAT1,BCAT1	BCAT1	NA	NA	NA	NA	BCAT1	46957	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	25539082	25539407	25539207	Y	NA	NA	BCAT1,LYRM5,CASC1,KRAS,RASSF8	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KRAS	137212	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr12	26130090	26130317	26130202	Y	NA	RASSF8,RASSF8-AS1	NA	NA	NA	NA	RASSF8-AS1	19392	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	27332593	27333057	27332936	Y	STK38L	NA	STK38L,MED21,TM7SF3,REP15,PPFIBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STK38L	61844	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	28179755	28179885	28179817	Y	PTHLH,PTHLH	NA	PTHLH	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC91	104297	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	32380941	32381343	32381040	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BICD1	123172	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	32738766	32738845	32738790	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNM1L	91289	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	39808802	39808894	39808882	Y	NA	KIF21A	NA	NA	NA	NA	KIF21A	26298	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	42825856	42826146	42826103	Y	YAF2,YAF2,YAF2	NA	NA	NA	NA	NA	ZCRB1	107936	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	42958967	42958984	42958976	Y	NA	PRICKLE1	NA	NA	NA	NA	PRICKLE1	23173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	45820263	45820702	45820515	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHA8P1	212439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	46603605	46603977	46603918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A1	57823	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	46824163	46824471	46824386	Y	NA	RP11-96H19.1	SLC38A2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-96H19.1	48701	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	46947043	46947401	46947166	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	171581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	46951455	46951753	46951519	Y	SLC38A2	NA	SLC38A2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-96H19.1	175993	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	47474423	47475249	47474825	Y	NA	AMIGO2	NA	NA	NA	NA	AMIGO2	2689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	48261486	48261659	48261573	Y	NA	HDAC7	NA	NA	NA	NA	HDAC7	36571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	48815092	48815327	48815161	Y	PFKM,C12orf68,ZNF641	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF641	71895	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	50339326	50339779	50339533	Y	NA	NA	AQP2,TMBIM6,LOC100286844,NCKAP5L,BCDIN3D,RACGAP1,FMNL3,KCNH3,MCRS1,LOC283332,FAIM2,AQP5,ACCN2,SMARCD1,COX14,CERS5,GPD1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RACGAP1	85140	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	51536826	51537135	51537116	Y	CSRNP2	RP11-416A17.1,TFCP2	NA	NA	NA	NA	TFCP2	27791	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	51787794	51788248	51788116	Y	SLC11A2,SLC11A2,SLC11A2,CSRNP2,DAZAP2,GALNT6	SLC4A8,GALNT6	NA	NA	NA	NA	GALNT6	3143	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	52557711	52558022	52557822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KRT86	83062	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	52596776	52597514	52597151	Y	NR4A1	KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	43570	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	52674655	52675081	52674843	Y	C12orf44,KRT80,KRT7	KRT86	NA	NA	NA	NA	KRT86	33571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	53229830	53230092	53229928	Y	PFDN5	NA	NA	NA	NA	NA	KRT18	110563	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	53612468	53612778	53612580	Y	TENC1,TENC1,TENC1,IGFBP6,RARG,C12orf10	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	11986	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	53615195	53615822	53615501	Y	CSAD,SP1,PRR13,PFDN5	ZNF740,CSAD,RARG,MFSD5,ESPL1	NA	NA	NA	NA	RARG	8942	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	54254611	54254885	54254855	Y	NA	NA	HOXC13,HOXC12,HOTAIR,LOC100240735,FLJ12825	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SNORD81	71522	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	54810296	54811355	54811225	Y	GPR84,ZNF385A,NCKAP1L,ITGA5	NA	ZNF385A	IMR90	Hi-C	24141950	ITGA5	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	56240862	56241188	56240984	Y	IL23A,ZC3H10,MMP19	SARNP,ORMDL2,TMEM198B,DNAJC14,MMP19	MMP19	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MMP19	6112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	57028610	57029302	57028864	Y	NA	BAZ2A,ATP5B	NA	NA	NA	NA	BAZ2A	10	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr12	59061940	59062339	59062197	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRIG3	249964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr12	63094069	63094114	63094085	Y	USP15,C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	99537	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	63124974	63125146	63125033	Y	C12orf61	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-631N16.2	130442	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	64310301	64310738	64310490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRGAP1	74228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	64544712	64545066	64544890	Y	SRGAP1	NA	NA	NA	NA	NA	C12orf66	69010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	64574864	64574988	64574911	Y	NA	C12orf66,RPS11P6	NA	NA	NA	NA	C12orf66	39088	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	65015023	65015259	65015145	Y	TBK1,RASSF3	RASSF3	NA	NA	NA	NA	RASSF3	12730	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	65997532	65998101	65997899	Y	HMGA2	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	2883	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66042799	66043321	66043056	Y	NA	RP11-221N13.3	RPSAP52,HMGA2,MSRB3	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-221N13.3	48150	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66135126	66135637	66135353	Y	HMGA2	NA	NA	NA	NA	NA	HMGA2	80274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66237933	66238219	66238043	Y	HMGA2	HMGA2,RPSAP52	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	19179	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66285844	66286273	66285967	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67090	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66286698	66286979	66286899	Y	IRAK3	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	67944	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	66292016	66292293	66292025	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPSAP52	73262	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	66628292	66629290	66628922	Y	TMBIM4,IRAK3,HELB	IRAK3	NA	NA	NA	NA	IRAK3	47633	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	69036661	69037118	69036873	Y	NA	RAP1B,RP11-254B13.3,NUP107	NA	NA	NA	NA	RP11-254B13.3	1888	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr12	70605032	70605426	70605086	Y	CNOT2,CNOT2,CNOT2	CNOT2,RP11-611E13.2	NA	NA	NA	NA	CNOT2	29348	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	71040722	71040853	71040780	Y	CNOT2,CNOT2,CNOT2,PTPRB	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	282666	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	71055637	71055848	71055742	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB4	297581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	72165791	72165958	72165868	Y	NA	RAB21	NA	NA	NA	NA	RAB21	19137	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	76373014	76373318	76373236	Y	GLIPR1,PHLDA1	NA	OSBPL8,PHLDA1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PHLDA1	52394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	76414369	76415079	76414685	Y	NA	PHLDA1	NA	NA	NA	NA	PHLDA1	10633	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	76942062	76942423	76942413	Y	NA	OSBPL8	NA	NA	NA	NA	OSBPL8	9166	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	77456593	77456922	77456786	Y	E2F7	E2F7	NA	NA	NA	NA	E2F7	438	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	78338246	78338645	78338266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	115561	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	78398192	78398473	78398333	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAV3	175507	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	79803401	79803717	79803562	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PAWR	279160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	83157091	83157416	83157138	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMTC2	78432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	88968059	88968366	88968242	Y	NA	KITLG	NA	NA	NA	NA	KITLG	4262	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	89845741	89845891	89845816	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POC1B	71910	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	90127113	90127954	90127635	Y	DUSP6,ATP2B1	ATP2B1	NA	NA	NA	NA	ATP2B1	26036	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	90353904	90354400	90354158	Y	ATP2B1	NA	ATP2B1,LOC338758,C12orf37	IMR90	Hi-C	24141950	ATP2B1	252827	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	91499594	91499827	91499730	Y	NA	LUM	NA	NA	NA	NA	LUM	3781	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	92517978	92518398	92518142	Y	BTG1	BTG1	NA	NA	NA	NA	BTG1	19275	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	93277124	93277496	93277306	Y	NA	EEA1	NA	NA	NA	NA	EEA1	43611	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	94179016	94179409	94179114	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRADD	109865	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	94817703	94818348	94818256	Y	NA	RBMS2P1,CCDC41	NA	NA	NA	NA	RBMS2P1	958	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	94919144	94919451	94919150	Y	NA	NA	PLXNC1	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC41	67380	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	96502190	96502534	96502487	Y	NA	NA	CDK17	IMR90	Hi-C	24141950	LTA4H	66892	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	96613519	96613922	96613765	Y	NA	ELK3	NA	NA	NA	NA	ELK3	27359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	96649758	96650321	96650168	Y	ELK3,CDK17	NA	NA	NA	NA	NA	ELK3	63598	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	96819131	96819446	96819342	Y	NA	CDK17	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr12	96819918	96820022	96819970	Y	NA	CDK17,RN7SKP11	CDK17,ELK3,LTA4H	IMR90	Hi-C	24141950	RN7SKP11	654	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	98818500	98818672	98818666	Y	NA	SLC9A7P1	LOC100128191,TMPO	MCF7	ChIA-PET	22265404	SLC9A7P1	30251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	99043983	99044295	99044139	Y	NA	IKBIP,APAF1	NA	NA	NA	NA	APAF1	7064	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	99103586	99103986	99103782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APAF1	66667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	102186333	102186570	102186556	Y	NA	GNPTAB	NA	NA	NA	NA	GNPTAB	36146	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	102283097	102283236	102283152	Y	NA	DRAM1	NA	NA	NA	NA	DRAM1	13968	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	104675995	104676292	104676137	Y	GLT8D2,TXNRD1	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	RP11-818F20.5	3495	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	104693849	104694220	104693862	Y	NA	RPL18AP3,RP11-818F20.5,EID3	NA	NA	NA	NA	EID3	1297	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	105284281	105284469	105284387	Y	CHST11,KIAA1033,SLC41A2	NA	NA	NA	NA	NA	SLC41A2	66053	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	105715924	105716167	105716100	Y	APPL2,C12orf75	RP11-474B16.1	C12orf75,APPL2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-474B16.1	2628	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	106328094	106328476	106328238	Y	CKAP4	NA	NUAK1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NUAK1	203335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	108699402	108699607	108699511	Y	CORO1C,SELPLG	CMKLR1	NA	NA	NA	NA	CMKLR1	31511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	108700100	108700298	108700252	Y	CORO1C,SELPLG	CMKLR1	NA	NA	NA	NA	CMKLR1	30820	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	109084686	109085066	109084867	Y	SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	38306	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	109117977	109118365	109118310	Y	SELPLG,SSH1,CORO1C	CORO1C	NA	NA	NA	NA	CORO1C	5007	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr12	109209396	109209677	109209591	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	39689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	109227089	109227462	109227320	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	21904	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	109232143	109232504	109232328	Y	FICD,SELPLG,CORO1C,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	16862	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	109249389	109249909	109249762	Y	CORO1C,SSH1,SSH1	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	23	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	109249958	109250678	109250397	Y	NA	SSH1	NA	NA	NA	NA	SSH1	592	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr12	109900993	109901418	109901152	Y	KCTD10	UBE3B,KCTD10	NA	NA	NA	NA	UBE3B	11789	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	110618684	110618848	110618757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT81	58544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	111028698	111029042	111028796	Y	ARPC3,PPTC7,HVCN1	PPTC7,TCTN1	PPTC7,GPN3,FAM216A,VPS29,RAD9B,PPP1CC,TCTN1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PPTC7	9573	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	111842634	111842962	111842759	Y	NA	FAM109A,SH2B3	NA	NA	NA	NA	SH2B3	882	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	116362516	116362609	116362584	Y	MED13L	NA	NA	NA	NA	NA	MED13L	350534	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	116701070	116701373	116701314	Y	MAP1LC3B2,MED13L	MED13L	NA	NA	NA	NA	MED13L	11770	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	116893494	116893818	116893640	Y	MED13L,MAP1LC3B2	NA	MED13L,LINC00173,MAP1LC3B2,MIR4472-2,C12orf49	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00173	75409	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	118123457	118123641	118123524	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RFC5	325752	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	120672500	120673016	120672699	Y	PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN,NME2P1	NA	NA	NA	NA	PXN	28558	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	120675783	120676003	120675893	Y	RAB35,RNF10,PXN	GCN1L1,RPLP0,PXN,NME2P1	GCN1L1,RPLP0,LOC100506649	K562	ChIA-PET	22265404	PXN	25571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	120912483	120912692	120912652	Y	NA	COX6A1,TRIAP1,GATC,SRSF9,DYNLL1	NA	NA	NA	NA	DYNLL1	6830	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr12	121282265	121283301	121283112	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPPL3	56873	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	121310801	121311113	121311060	Y	NA	SPPL3	NA	NA	NA	NA	SPPL3	29061	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	122227473	122227629	122227504	Y	CAMKK2,ORAI1,MLXIP,SETD1B,RHOF	RHOF,AC084018.1,SETD1B	NA	NA	NA	NA	RHOF	11680	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	123362987	123363145	123363088	Y	NA	HIP1R,VPS37B	NA	NA	NA	NA	VPS37B	15846	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	124907545	124908050	124907792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	142085	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr12	124982309	124982472	124982376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NCOR2	67663	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	125050856	125051375	125051213	Y	UBC,NCOR2	NCOR2	NA	NA	NA	NA	NCOR2	721	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr12	125165952	125166242	125166057	Y	UBC,NCOR2	NA	NCOR2,ZNF664-FAM101A,SCARB1	IMR90	Hi-C	24141950	NCOR2	115817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr12	127715364	127715787	127715548	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	66692	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr12	127754808	127755172	127754990	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC079949.1	106136	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	20693405	20693544	20693484	Y	CRYL1	GJA3	NA	NA	NA	NA	GJA3	39644	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	21241518	21241702	21241584	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IFT88	102933	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	24131522	24131823	24131734	Y	SACS	TNFRSF19	MIPEP,TNFRSF19	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF19	10686	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	30407984	30408178	30408116	Y	UBL3	UBL3	NA	NA	NA	NA	UBL3	14643	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	33744347	33744745	33744546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	178022	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	33841256	33841381	33841376	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	81386	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	33858244	33858802	33858357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STARD13	63965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	36918283	36918673	36918579	Y	NA	SPG20	NA	NA	NA	NA	SPG20	23644	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	37430942	37430957	37430950	Y	NA	RFXAP	NA	NA	NA	NA	RFXAP	39581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	38101314	38101456	38101387	Y	POSTN	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	69525	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr13	38105201	38105571	38105385	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POSTN	65410	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	41078224	41078580	41078410	Y	NA	NA	FOXO1,TTL	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FOXO1	160154	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	42137571	42138044	42137923	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NAA16	254230	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	42683498	42683540	42683519	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DGKH	71322	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	44303607	44303703	44303655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX1	55341	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	45288309	45288506	45288432	Y	KCTD4	NA	NUFIP1,TSC22D1,TSC22D1-AS1,SERP2,LINC00330	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D1	139026	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	45774024	45774110	45774098	Y	KCTD4	NA	NA	NA	NA	NA	GTF2F2	81374	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	45928010	45928281	45928087	Y	NA	TPT1-AS1,TPT1	NA	NA	NA	NA	TPT1	14505	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	46943616	46943890	46943786	Y	LCP1,C13orf18	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0226L	66435	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	48464437	48464519	48464469	Y	NA	NA	HTR2A	IMR90	Hi-C	24141950	NAP1L4P3	128842	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	49615947	49616340	49616144	Y	SETDB2,PHF11,PHF11,CAB39L,FNDC3A	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3A	67899	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	60580804	60581154	60581101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	154967	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	60736273	60736548	60736444	Y	NA	DIAPH3	NA	NA	NA	NA	DIAPH3	152	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	61157781	61157905	61157871	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TDRD3	189190	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	67461334	67461726	67461614	Y	PCDH9	NA	NA	NA	NA	NA	PCDH9	340742	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	73486233	73486587	73486410	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIS3	131999	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	74326809	74326882	74326846	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	379512	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	74706134	74706569	74706487	Y	KLF12	NA	NA	NA	NA	NA	KLF12	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	74709487	74710034	74709735	Y	KLF12	KLF12	NA	NA	NA	NA	KLF12	3093	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	76256605	76256814	76256659	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMO7	64035	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	77299321	77299673	77299497	Y	NA	NA	LMO7,KCTD12	IMR90	Hi-C	24141950	KCTD12	158867	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	96262046	96262201	96262124	Y	DZIP1	DZIP1	NA	NA	NA	NA	DZIP1	32756	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	98824155	98824526	98824341	Y	FARP1	FARP1	NA	NA	NA	NA	FARP1	31339	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	99629306	99629403	99629355	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC2-AS1	221561	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	99956842	99956954	99956899	Y	GPR183	GPR183	NA	NA	NA	NA	GPR183	705	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	100738422	100738621	100738542	Y	NA	PCCA	NA	NA	NA	NA	PCCA	648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	102105666	102105949	102105700	Y	ITGBL1	NALCN,ITGBL1	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	2700	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	102143126	102143433	102143292	Y	NA	ITGBL1	NA	NA	NA	NA	ITGBL1	40160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	102827333	102827727	102827645	Y	FGF14	NA	NA	NA	NA	NA	TPP2	419626	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	107026666	107026873	107026771	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARGLU1	191639	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	108520131	108520835	108520801	Y	LIG4,FAM155A	FAM155A	NA	NA	NA	NA	FAM155A	3048	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	110439676	110440079	110439929	Y	IRS2	IRS2	NA	NA	NA	NA	IRS2	2761	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	110806854	110807322	110807103	Y	RAB20	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	148837	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	110902548	110902879	110902758	Y	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A2	53280	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	110982194	110982608	110982413	Y	NA	COL4A2,COL4A1	NA	NA	NA	NA	COL4A1	24698	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111013776	111014136	111013979	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	56280	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111022548	111022884	111022711	Y	ING1	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	65052	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111053318	111053466	111053369	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	95822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111068169	111068419	111068294	Y	RAB20,ANKRD10	NA	NA	NA	NA	NA	COL4A1	110673	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111695990	111696309	111696026	Y	NA	NA	ING1,ARHGEF7,ANKRD10	IMR90	Hi-C	24141950	ARHGEF7	68597	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	111881085	111881388	111881198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF7	116179	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	114065698	114065892	114065794	Y	MCF2L,ADPRHL1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D2	77375	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	114270892	114271213	114271013	Y	DCUN1D2,TMCO3	TFDP1	NA	NA	NA	NA	TFDP1	33879	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	114565478	114566323	114565869	Y	GAS6,GAS6,GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	114600157	114600520	114600358	Y	GAS6	GAS6	NA	NA	NA	NA	GAS6	35111	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr13	114634569	114634891	114634593	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GAS6	69523	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr13	114876029	114876284	114876205	Y	RASA3	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	19802	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr13	114881275	114881557	114881414	Y	NA	RASA3	NA	NA	NA	NA	RASA3	14529	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	21339031	21339328	21339180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	METTL17	116601	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	30318632	30318957	30318868	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRKD1	340147	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	30663968	30664325	30664158	Y	PRKD1	PRKD1	PRKD1,FOXG1,C14orf23	IMR90	Hi-C	24141950	PRKD1	4864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	31101250	31101606	31101429	Y	NA	SCFD1	NA	NA	NA	NA	SCFD1	11932	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	32261719	32262250	32261957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5	281070	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	32597823	32598061	32597946	Y	NUBPL	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP5-AS1	53824	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	32941850	32942320	32942112	Y	NA	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	9686	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	32953597	32954289	32954012	Y	ARHGAP5,AKAP6,NPAS3	RP11-320M16.1	NA	NA	NA	NA	RP11-320M16.1	1591	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	34529400	34529785	34529476	Y	EGLN3	NA	EGLN3	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	SPTSSA	399777	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	35628271	35628433	35628369	Y	NA	PPP2R3C,KIAA0391	NA	NA	NA	NA	KIAA0391	38516	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr14	35854902	35855043	35854959	Y	NA	RP11-561B11.1,NFKBIA	NA	NA	NA	NA	RP11-561B11.1	1232	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	36277376	36277519	36277444	Y	NFKBIA,RALGAPA1	RALGAPA1,NUTF2P2,BRMS1L	NA	NA	NA	NA	RALGAPA1	866	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	50213261	50213687	50213459	Y	NA	KLHDC2	NA	NA	NA	NA	KLHDC2	18639	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	50329576	50329987	50329651	Y	NA	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,METTL21D,NEMF,ARF6,C14orf183,DNAAF2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	11655	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	50334846	50335244	50334992	Y	RPL36AL,MGAT2,NEMF,C14orf182,SOS2,METTL21D,ARF6	NEMF,ARF6	SOS2,C14orf182,NEMF,ARF6,METTL21D,C14orf183	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NEMF	16925	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr14	50467375	50468846	50468075	Y	RPS29,RPL36AL,ARF6,L2HGDH,ATP5S,METTL21D	C14orf182,RP11-58E21.3	NA	NA	NA	NA	C14orf182	3392	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	50648447	50648735	50648723	Y	NA	SOS2	NA	NA	NA	NA	SOS2	47541	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	51865642	51865984	51865869	Y	FRMD6	NA	LOC283553,FRMD6,FRMD6-AS1	IMR90	Hi-C	24141950	FRMD6	87834	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	52006399	52006758	52006578	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6	52581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	52104818	52105424	52105148	Y	NA	FRMD6-AS2	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	40148	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	52119936	52120349	52120008	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	55266	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	52163680	52163849	52163765	Y	FRMD6	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD6-AS2	99010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	52372298	52373220	52372436	Y	PTGER2,GNG2	NA	NA	NA	NA	NA	C14orf166	80973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	53361596	53362059	53361840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT2	55094	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55094268	55094954	55094583	Y	GMFB,MAPK1IP1L,GCH1	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	62453	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55116749	55117607	55117330	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	84934	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55144129	55144414	55144262	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	112314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55197259	55197652	55197332	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SAMD4A	165444	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55538737	55539349	55538846	Y	FBXO34,FBXO34,ATG14,MAPK1IP1L	WDHD1,SOCS4,MAPK1IP1L,LGALS3	NA	NA	NA	NA	MAPK1IP1L	22388	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55569033	55569319	55569207	Y	LGALS3,FBXO34,FBXO34,GCH1,MAPK1IP1L	LGALS3	LGALS3,DLGAP5,MAPK1IP1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LGALS3	19509	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55574465	55575376	55574639	Y	GCH1,MAPK1IP1L,FBXO34,FBXO34,LGALS3	LGALS3	MAPK1IP1L	IMR90	Hi-C	24141950	LGALS3	13452	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	55596570	55597156	55596587	Y	NA	LGALS3	NA	NA	NA	NA	LGALS3	7742	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	58544876	58545175	58545024	Y	C14orf37	NA	NA	NA	NA	NA	UBA52P3	60822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	59656513	59656908	59656842	Y	DAAM1	DAAM1	NA	NA	NA	NA	DAAM1	3149	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	59800555	59800809	59800631	Y	GPR135	NA	NA	NA	NA	NA	DAAM1	147191	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	61645426	61645731	61645594	Y	NA	PRKCH	SLC38A6,SIX1,MNAT1,TRMT5,SIX4	IMR90	Hi-C	24141950	PRKCH	6546	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	61809267	61809583	61809345	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM30B	62709	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	62015577	62015884	62015776	Y	PRKCH	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	144347	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	62040859	62041355	62041035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIF1A	118876	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	62157799	62158071	62157921	Y	HIF1A	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1	NA	NA	NA	NA	HIF1A	2160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	62170336	62170562	62170449	Y	NA	HIF1A,HIF1A-AS1,RP11-618G20.1,HIF1A-AS2	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS1	9795	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	62219407	62219640	62219496	Y	HIF1A,SNAPC1	RP11-618G20.1,HIF1A-AS2,SNAPC1	NA	NA	NA	NA	HIF1A-AS2	3592	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	63696416	63696592	63696504	Y	NA	RHOJ	NA	NA	NA	NA	RHOJ	27584	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	64185455	64185764	64185678	Y	PPP2R5E,SYNE2,WDR89,WDR89,SGPP1	SGPP1	NA	NA	NA	NA	SGPP1	6993	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	65717940	65718310	65718036	Y	NA	NA	LOC645431,FUT8	IMR90	Hi-C	24141950	MAX	150527	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	67478288	67478352	67478320	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MPP5	227474	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	69509495	69509713	69509605	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTN1	65338	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	70803999	70804244	70804143	Y	NA	COX16	NA	NA	NA	NA	COX16	20204	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	71164534	71164679	71164625	Y	MED6	NA	NA	NA	NA	NA	TTC9	58030	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr14	71710428	71710751	71710653	Y	NA	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	74415	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr14	71711284	71711362	71711294	Y	NA	NA	SIPA1L1	IMR90	Hi-C	24141950	SIPA1L1	73804	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	71797093	71797681	71797289	Y	PCNX	SIPA1L1,RP1-261D10.2	SIPA1L1,LOC145474	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-261D10.2	10562	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	73083921	73084271	73084094	Y	NA	NA	RGS6,DPF3,DCAF4,RBM25	IMR90	Hi-C	24141950	DPF3	274538	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	74140666	74140779	74140723	Y	FAM161B	DNAL1,PNMA1	NA	NA	NA	NA	DNAL1	31088	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	74949377	74949710	74949544	Y	NA	MIR4709,ISCA2,NPC2	NA	NA	NA	NA	MIR4709	4470	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	75063394	75063798	75063525	Y	NPC2,LTBP2	LTBP2,CTD-2207P18.2	NA	NA	NA	NA	LTBP2	13508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	75701379	75701456	75701414	Y	FOS	RP11-293M10.2,FOS	TMED10,NEK9,LOC731223,ZC2HC1C,FOS,BATF	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-293M10.2	22658	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	77384980	77385465	77385224	Y	VASH1	RP11-488C13.1,RP11-7F17.1	IRF2BPL,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,ZDHHC22	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-488C13.1	33887	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	77499482	77500543	77500476	Y	VASH1,C14orf166B,IRF2BPL	IRF2BPL	KIAA1737,POMT2,GSTZ1	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRF2BPL	6448	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	77640033	77640278	77640160	Y	NA	NA	C14orf166B,ZDHHC22,POMT2,GSTZ1,KIAA1737,TMEM63C,NGB,MIR1260A,TMED8	IMR90	Hi-C	24141950	GSTZ1,POMT2	144949	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	79941274	79941440	79941360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DIO2	910660	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	81440226	81440497	81440374	Y	CEP128,TSHR	CEP128	NA	NA	NA	NA	CEP128	16365	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	81685513	81686063	81685724	Y	GTF2A1,GTF2A1	DYNLL1P1	NA	NA	NA	NA	GTF2A1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	89493430	89493694	89493607	Y	NA	NA	EFCAB11,FOXN3,TDP1,LOC400236,PRO1768,EML5,TTC8	IMR90	Hi-C	24141950	TTC8	204933	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	89671493	89671906	89671673	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	84032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	89739645	89739700	89739695	Y	NA	CAP2P1	NA	NA	NA	NA	CAP2P1	16238	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	90378074	90378289	90378205	Y	FOXN3,FOXN3,TDP1	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	40832	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	90378938	90379536	90379158	Y	FOXN3,FOXN3,KCNK13	EFCAB11,TDP1	NA	NA	NA	NA	EFCAB11	39585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	92970203	92970533	92970302	Y	ATXN3,SLC24A4,SLC24A4,RIN3	RIN3	NA	NA	NA	NA	RIN3	7585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	94431614	94431935	94431778	Y	SERPINA1,ASB2	NA	NA	NA	NA	NA	OTUB2	58740	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	95239496	95239653	95239575	Y	SERPINA12	GSC	NA	NA	NA	NA	GSC	4934	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	99283105	99283111	99283108	Y	NA	NA	C14orf64	IMR90	Hi-C	24141950	SETD3	662105	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	99439262	99439638	99439565	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETD3	505578	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr14	100040610	100041006	100040947	Y	SETD3,CCDC85C	CCDC85C,RP11-543C4.1	NA	NA	NA	NA	CCDC85C	27357	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	102414226	102414964	102414565	Y	NA	DYNC1H1	NA	NA	NA	NA	DYNC1H1	13901	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr14	102836975	102837187	102837062	Y	NA	CINP,TECPR2	NA	NA	NA	NA	TECPR2	9675	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	103673427	103673966	103673589	Y	CDC42BPB	NA	LOC100131366,CDC42BPB,EXOC3L4,EIF5,TNFAIP2,MARK3,RCOR1	IMR90	Hi-C	24141950	TNFAIP2	85648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	103954462	103954719	103954539	Y	MARK3,KLC1	CKB,TRMT61A	NA	NA	NA	NA	CKB	32729	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	105439556	105439771	105439692	Y	INF2,KIAA0284,C14orf79,AHNAK2	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	PLD4	MCF7	ChIA-PET	22265404	AHNAK2	2923	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	105491233	105491512	105491453	Y	NA	AHNAK2,C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	5748	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr14	105493379	105493756	105493698	Y	NA	C14orf79,CDCA4	NA	NA	NA	NA	CDCA4	7894	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr14	105948139	105949025	105948432	Y	NA	CRIP2,CRIP1,C14orf80,TMEM121	NA	NA	NA	NA	CRIP1	2511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	25606189	25606253	25606221	Y	UBE3A	NA	NA	NA	NA	NA	UBE3A	75875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	26091537	26091912	26091608	Y	NA	ATP10A	NA	NA	NA	NA	ATP10A	16405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	32964268	32964677	32964326	Y	NA	SCG5,GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	SCG5	32391	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	33028073	33028475	33028235	Y	NA	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	18865	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	33028976	33029226	33029070	Y	GREM1	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	19768	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr15	33032997	33033143	33033070	Y	GREM1	GREM1,RP11-758N13.1	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	23789	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr15	33122479	33122828	33122652	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	113271	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	33123878	33123902	33123890	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	114670	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	33153988	33154297	33154060	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	144780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	33212194	33212596	33212424	Y	GREM1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-758N13.1	202986	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	34531616	34532056	34531745	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC12A6	96205	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	37398990	37399302	37399145	Y	C15orf41,MEIS2,MEIS2,MEIS2,MEIS2	RP11-128A17.1,MEIS2	NA	NA	NA	NA	MEIS2	7486	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	38751078	38751316	38751209	Y	NA	FAM98B	NA	NA	NA	NA	FAM98B	6750	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	38823791	38823961	38823868	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	31815	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	38827733	38827813	38827761	Y	NA	RASGRP1	NA	NA	NA	NA	RASGRP1	27963	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	39361992	39362177	39362006	Y	NA	NA	FSIP1,C15orf53	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	122333	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr15	39449850	39450075	39449963	Y	NA	RP11-265N7.1	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-265N7.1	34435	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	39553586	39553959	39553839	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	69076	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	39561378	39561942	39561743	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	76868	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	39563210	39563560	39563357	Y	THBS1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-265N7.1	78700	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	39593792	39594300	39594108	Y	THBS1	NA	FSIP1,C15orf53,THBS1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-265N7.1	109282	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	40210900	40211252	40211013	Y	GPR176	EIF2AK4	FSIP1	IMR90	Hi-C	24141950	GPR176	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr15	40391032	40391342	40391133	Y	PLCB2,C15orf57,BMF,BMF,BMF	BMF	NA	NA	NA	NA	BMF	7751	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	41456018	41456111	41456065	Y	NA	INO80	NA	NA	NA	NA	INO80	49466	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	43415014	43415563	43415337	Y	NA	UBR1,TMEM62	NA	NA	NA	NA	TMEM62	1537	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	44954800	44955080	44954968	Y	CTDSPL2,TRIM69,PATL2,B2M,SPG11	SPG11,PATL2,B2M	NA	NA	NA	NA	SPG11	924	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	45748469	45749175	45748989	Y	SPATA5L1,C15orf48,SQRDL,PLDN	C15orf48	NA	NA	NA	NA	C15orf48	27742	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	45938532	45938945	45938638	Y	NA	SQRDL	NA	NA	NA	NA	SQRDL	17186	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	48985825	48986062	48985871	Y	FBN1	FBN1	FBN1,CEP152,SHC4	IMR90	Hi-C	24141950	FBN1	49779	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	50634288	50634665	50634477	Y	NA	GABPB1	NA	NA	NA	NA	GABPB1	10940	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	50995097	50995499	50995351	Y	SPPL2A	TRPM7	NA	NA	NA	NA	TRPM7	18085	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr15	51172834	51173079	51172965	Y	USP8,TRPM7,SPPL2A	AP4E1	TRPM7,SPPL2A,USP50,ASB18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,19890323,22265404	AP4E1	25790	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	52385766	52385957	52385877	Y	DMXL2,MAPK6	NA	NA	NA	NA	NA	GNB5	95609	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	52684587	52684775	52684686	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO5A	134472	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	56127522	56127639	56127539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD4	156305	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	56513902	56514185	56514176	Y	NA	RFX7,TEX9	NA	NA	NA	NA	RFX7	19298	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	57261737	57262096	57261746	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	52916	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	57351586	57351958	57351646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF12	142765	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	59469975	59470287	59470131	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCNB2	74698	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	59587320	59587393	59587357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYO1E	75706	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	59649595	59649770	59649683	Y	NA	MYO1E	NA	NA	NA	NA	MYO1E	13329	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	61340586	61340641	61340614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RORA	178877	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	62130295	62130308	62130301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VPS13C	220364	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	62683990	62684402	62684060	Y	NA	TLN2	TLN2,MGC15885	IMR90	Hi-C	24141950	TLN2	3265	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	63368396	63368491	63368444	Y	NA	TPM1,LACTB	NA	NA	NA	NA	TPM1	35565	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	64601637	64601745	64601727	Y	NA	CSNK1G1	NA	NA	NA	NA	CSNK1G1	44697	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	64748172	64748426	64748322	Y	PLEKHO2,SNX1	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2515	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	64753700	64753985	64753784	Y	PLEKHO2	ZNF609	NA	NA	NA	NA	ZNF609	2759	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	65244919	65245418	65244949	Y	ZNF609,OAZ2,PLEKHO2,SPG21,SPG21,PARP16,ANKDD1A	SPG21	NA	NA	NA	NA	SPG21	35230	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	65951559	65951691	65951625	Y	NA	SLC24A1	NA	NA	NA	NA	SLC24A1	49855	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	66764584	66765048	66764851	Y	NA	SNAPC5,SNORD18A,ZWILCH,RPL4	NA	NA	NA	NA	SNAPC5	23103	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	67134448	67134928	67134631	Y	NA	NA	SMAD6,SNAPC5	IMR90	Hi-C	24141950	SMAD6	141882	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	67359902	67360303	67360058	Y	NA	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	5801	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr15	67401891	67402640	67402087	Y	SMAD3	SMAD3	NA	NA	NA	NA	SMAD3	47790	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	67423316	67423661	67423503	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	69215	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	67442347	67443164	67443030	Y	SMAD3	NA	NA	NA	NA	NA	SMAD3	88246	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	68589122	68589626	68589166	Y	ITGA11	CLN6,FEM1B	NA	NA	NA	NA	FEM1B	20981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	68632739	68632989	68632864	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEM1B	64598	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	68657439	68657730	68657635	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGA11	64771	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	71371688	71372044	71371801	Y	THSD4	NA	LRRC49,THSD4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	THAP10	188564	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	72824073	72824405	72824125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARIH1	59406	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	74222908	74223263	74222994	Y	LOXL1,STOML1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	6578	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	74223574	74223817	74223712	Y	LOXL1	LOXL1	NA	NA	NA	NA	LOXL1	7244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	74283683	74283945	74283706	Y	NA	STOML1,PML	NA	NA	NA	NA	STOML1	1018	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	74699762	74699966	74699869	Y	LOXL1,STOML1	SEMA7A	NA	NA	NA	NA	SEMA7A	24842	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	75747348	75747533	75747407	Y	RPP25,SIN3A	SIN3A	NA	NA	NA	NA	SIN3A	1165	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	76455838	76456047	76455943	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ETFA	145766	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	76543637	76543996	76543963	Y	NA	NA	C15orf27	IMR90	Hi-C	24141950	ETFA	57817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	78362503	78362904	78362579	Y	IREB2,DNAJA4,DNAJA4,DNAJA4,TBC1D2B	TBC1D2B,SNORA63	NA	NA	NA	NA	TBC1D2B	5162	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	80773280	80773702	80773515	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	78588	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	80783527	80783856	80783768	Y	ZFAND6	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	88835	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	80841630	80841706	80841692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARNT2	146938	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	81082693	81083043	81082764	Y	KIAA1199	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	13009	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	81156027	81156230	81156065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA1199	86343	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	81207632	81207924	81207778	Y	KIAA1199	NA	NA	NA	NA	NA	MESDC2	72295	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	81277111	81277444	81277389	Y	STARD5,MESDC1	MESDC2,MESDC1	NA	NA	NA	NA	MESDC2	2775	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	82339167	82339811	82339478	Y	MEX3B	MEX3B	NA	NA	NA	NA	MEX3B	2685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	82398110	82398459	82398277	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MEX3B	61628	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	83239509	83239741	83239625	Y	AP3B2,CPEB1	NA	NA	NA	NA	NA	CPEB1	75871	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	85227339	85227652	85227485	Y	PDE8A,ZNF592,SEC11A	WDR73,NMB,SEC11A	NA	NA	NA	NA	NMB	27545	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	86020857	86021180	86020870	Y	KLHL25	NA	NA	NA	NA	NA	AKAP13	99055	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	90277737	90277832	90277785	Y	NA	PEX11A,MESP1	NA	NA	NA	NA	MESP1	14709	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	90366635	90367145	90366908	Y	NA	ANPEP	NA	NA	NA	NA	ANPEP	10002	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	90419728	90419914	90419806	Y	ZNF710,SEMA4B,ANPEP,AP3S2	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	15660	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	90441878	90442278	90442169	Y	C15orf38	AP3S2,C15orf38-AP3S2,C15orf38	NA	NA	NA	NA	AP3S2	6304	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	92664917	92665299	92665108	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NPM1P5	161772	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	93344993	93345488	93345070	Y	CHD2	FAM174B	NA	NA	NA	NA	FAM174B	5626	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	93363497	93364154	93363735	Y	ST8SIA2,RGMA,RGMA,RGMA,RGMA,CHD2	FAM174B	ASB9P1,CHD2,LOC100507217	IMR90	Hi-C	24141950	FAM174B	12383	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	93374780	93375598	93375185	Y	NA	FAM174B,CHD2	CHD2,LOC100507217,ASB9P1	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	FAM174B	23666	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	93542371	93542660	93542397	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD2	117845	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	96886247	96886633	96886548	Y	NA	NR2F2,NR2F2-AS1,RP11-522B15.3	NA	NA	NA	NA	RP11-522B15.3	8833	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	99193577	99194531	99194069	Y	IGF1R	IGF1R	NA	NA	NA	NA	IGF1R	3377	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr15	99416036	99416369	99416103	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	220051	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr15	99489789	99490246	99490040	Y	IGF1R	NA	NA	NA	NA	NA	SYNM	146174	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	100209243	100209470	100209289	Y	NA	NA	LYSMD4	IMR90	Hi-C	24141950	LYSMD4	62296	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	100216338	100216615	100216373	Y	MEF2A,MEF2A	NA	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	55151	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	100243855	100244145	100244036	Y	NA	LYSMD4	NA	NA	NA	NA	LYSMD4	27621	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	101739961	101740273	101740216	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	49864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr15	101741612	101741900	101741753	Y	TM2D3,CHSY1	CHSY1	NA	NA	NA	NA	CHSY1	48237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr15	102202329	102202647	102202484	Y	OR4F15	TM2D3	NA	NA	NA	NA	TM2D3	11735	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr15	102213485	102213850	102213667	Y	NA	TM2D3,TARSL2	NA	NA	NA	NA	TM2D3	22891	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	578748	579156	578911	Y	LUC7L	PIGQ	NA	NA	NA	NA	PIGQ	35839	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	729341	729555	729445	Y	NA	C16orf13,FAM195A,AL022341.3,WDR90,RHOT2,RHBDL1,STUB1,JMJD8,WDR24,METRN,FAM173A,HAGHL	NA	NA	NA	NA	STUB1	1117	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	1581133	1581345	1581183	Y	C16orf42,GNPTG,TBL3,SLC9A3R2,RPS2,NUBP2,NME3,MRPS34,GFER,TMEM204	TELO2,TMEM204	NA	NA	NA	NA	TMEM204	4444	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	1585533	1585949	1585726	Y	NA	TELO2,TMEM204	NA	NA	NA	NA	TMEM204	8844	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	2057818	2059084	2058234	Y	TRAF7,ECI1,HN1L,EME2,ZNF598	RPS2,SNHG9,TBL3,GFER,SYNGR3,SLC9A3R2,TSC2,NTHL1	NA	NA	NA	NA	ZNF598,NPW	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	2557760	2557909	2557835	Y	SRRM2,PDPK1,CEMP1	C16orf59,TBC1D24,ATP6V0C,AMDHD2,PDPK1	NA	NA	NA	NA	ATP6V0C	3962	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	3237977	3238591	3238121	Y	NA	ZNF200	ZNF200	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF200	45630	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	3414643	3415237	3414919	Y	NA	ZNF174	NA	NA	NA	NA	ZNF174	33998	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr16	4424244	4424335	4424249	Y	CREBBP,UBN1,UBN1,MGRN1,CORO7,GLIS2	PAM16,VASN,CORO7,DNAJA3	NA	NA	NA	NA	VASN	4395	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	6353433	6353832	6353638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM86A	1207624	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	8852303	8852368	8852337	Y	NA	PMM2,TMEM186	PMM2,TMEM186	IMR90	Hi-C	24141950	PMM2	28312	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	9162231	9162510	9162397	Y	NA	C16orf72	USP7,C16orf72	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	C16orf72	20995	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	11590987	11591512	11591296	Y	NA	NA	SNN,TXNDC11,CLEC16A,LITAF	IMR90	Hi-C	24141950	LITAF	136725	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	12071486	12071797	12071761	Y	NA	RP11-166B2.1,SNX29	NA	NA	NA	NA	SNX29	2892	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	12761788	12762198	12762001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CPPED1	133676	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	15583408	15583655	15583541	Y	NDE1,C16orf45	NA	KIAA0430	IMR90	Hi-C	24141950	C16orf45	57256	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	15684514	15685137	15684868	Y	NDE1,NDE1,KIAA0430	KIAA0430,NDE1	NA	NA	NA	NA	KIAA0430	49886	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	17499199	17499488	17499485	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XYLT1	63250	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr16	22658333	22658705	22658519	Y	NA	NA	SLC7A5P2,THUMPD1,CRYM,ANKS4B,ZP2,COG7,DNAH3,CRYM-AS1,METTL9,TMEM159,OTOA,HS3ST2,LOC81691,DCUN1D3,MIR548AA2,MIR548D2	IMR90	Hi-C	24141950	CDR2	211847	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	23855109	23855743	23855120	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	168132	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	23968296	23968621	23968461	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLK1	281319	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	27338285	27338559	27338369	Y	KIAA0556,IL4R	IL4R	NA	NA	NA	NA	IL4R	15296	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	27546889	27546978	27546937	Y	NA	GTF3C1,KIAA0556	NA	NA	NA	NA	GTF3C1	12256	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	29283104	29283213	29283156	Y	SPNS1	NA	NA	NA	NA	NA	SPNS1	299562	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	30645556	30645885	30645776	Y	CORO1A,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ZNF48,ITGAL,ZNF646,SRCAP,RNF40,PHKG2,MYST1,C16orf93,ZNF747,ZNF764,ZNF688,ZNF689,PRR14	ZNF689,PRR14,FBRS	PPP4C,PRR14,ITGAL,ZNF785,TBC1D10B,FBRS,TBX6,GDPD3,YPEL3,MAPK3,ZNF48,SEPT1,MYLPF,DCTPP1,SEPHS2,ZNF771,ZNF764,ZNF688,ZNF689,SRCAP,ZNF768	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF689	12223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr16	30825606	30826012	30825883	Y	NA	ZNF629	ZNF629,RNF40,MIR4519	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF629	29083	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	30855963	30856257	30856110	Y	NA	MIR4519,BCL7C,CTF1	CTF1,BCL7C,MIR762,FBXL19,FBXL19-AS1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	MIR4519	28387	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	30994228	30994553	30994360	Y	VKORC1,HSD3B7	ORAI3,SETD1A,STX1B,STX4	NA	NA	NA	NA	HSD3B7	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr16	46823783	46824029	46823881	Y	NA	C16orf87	NA	NA	NA	NA	C16orf87	39294	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	48593216	48593689	48593553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	N4BP1	58370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	51186041	51186738	51186313	Y	NA	SALL1	NA	NA	NA	NA	SALL1	2763	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	53165497	53165808	53165602	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHD9	78552	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	55521029	55521357	55521152	Y	MMP2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	19553	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	55544017	55544378	55544293	Y	MMP2,LPCAT2	LPCAT2	NA	NA	NA	NA	LPCAT2	3107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	56641054	56641530	56641359	Y	MT2A,MT1E	MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	943	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	56644047	56644457	56644379	Y	NLRC5,HERPUD1	MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT2A	3936	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	56645516	56645845	56645554	Y	MT2A,MT1M,MT1E,MT1A	MT3,MT2A,MT1L,MT1E,MT1M,MT1A	NA	NA	NA	NA	MT1L	3543	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	62009181	62009277	62009229	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH8	59662	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr16	66906996	66907469	66907329	Y	SLC9A5,KIAA0895L,CMTM4,DYNC1LI2,CES4A,CES4A,CES3,CBFB,CA7,CA7,PDP2	NAE1,PDP2	NA	NA	NA	NA	NAE1	1837	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	66960903	66961306	66961106	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	RRAD	3356	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	66962213	66962449	66962329	Y	PLEKHG4,FHOD1,CBFB,RRAD	RRAD,FAM96B,CES2	NA	NA	NA	NA	FAM96B	3877	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	67561753	67561884	67561820	Y	HSF4,SLC9A5,TPPP3,FAM65A	ATP6V0D1,FAM65A,CTCF	NA	NA	NA	NA	FAM65A	11432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	67867011	67867153	67867060	Y	TPPP3,CENPT	RANBP10,TSNAXIP1,THAP11,NUTF2,CENPT,EDC4	NA	NA	NA	NA	THAP11	7060	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	69790577	69791500	69790768	Y	PDF,NIP7,NOB1	NQO1,NOB1,WWP2	NA	NA	NA	NA	WWP2	2709	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr16	70451023	70451476	70451223	Y	NA	ST3GAL2,FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	19664	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	70470997	70471281	70471214	Y	NA	FUK	NA	NA	NA	NA	ST3GAL2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	70771415	70771759	70771684	Y	EXOSC6	NA	NA	NA	NA	NA	MTSS1L	53446	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	70980057	70980287	70980181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	146993	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr16	71070712	71070940	71070844	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VAC14	237648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	72882732	72883050	72882991	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	208547	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	72897745	72898023	72897884	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	193574	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	73076128	73076469	73076445	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	15128	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	73084736	73084892	73084798	Y	NA	ZFHX3	NA	NA	NA	NA	ZFHX3	6705	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	73337860	73337902	73337872	Y	NA	NA	HPR,HP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFHX3	246263	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	74610751	74610842	74610827	Y	NA	GLG1	NA	NA	NA	NA	GLG1	28170	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	74991657	74991945	74991906	Y	NA	ZNRF1,WDR59	NA	NA	NA	NA	ZNRF1	38983	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	75278988	75279894	75279594	Y	CHST6,FA2H,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1,BCAR1	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	20057	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	75286788	75287025	75286897	Y	NA	BCAR1	NA	NA	NA	NA	BCAR1	12926	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	78565966	78565983	78565974	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWOX	434656	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	80401381	80401567	80401473	Y	NA	NA	WWOX	IMR90	Hi-C	24141950	DYNLRB2	171064	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	80971971	80972227	80972105	Y	CENPN	NA	NA	NA	NA	NA	CENPN	65876	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	81659418	81659741	81659491	Y	PLCG2,CMIP	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	182643	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	81693209	81693442	81693326	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMIP	216434	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	82661526	82661961	82661896	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	3118	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr16	82662605	82662975	82662756	Y	CDH13	CDH13	NA	NA	NA	NA	CDH13	4197	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	82686651	82686853	82686732	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28243	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	82687139	82687406	82687299	Y	NA	CDH13	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	CDH13	28731	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	83347246	83347320	83347283	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	492128	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	83399347	83399604	83399475	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	439844	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	83556013	83556380	83556197	Y	NA	NA	HSBP1	IMR90	Hi-C	24141950	HSBP1	283068	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	83715826	83716249	83715944	Y	HSBP1	NA	NA	NA	NA	NA	HSBP1	123199	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	84636685	84637090	84636875	Y	ZDHHC7,KIAA0513,HSDL1,CRISPLD2,COTL1	COTL1,KLHL36	NA	NA	NA	NA	COTL1	12593	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	84855927	84856178	84856013	Y	CRISPLD2	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	4337	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	84866015	84866457	84866298	Y	NA	CRISPLD2	NA	NA	NA	NA	CRISPLD2	14425	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	85202555	85203049	85202710	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0513	143180	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr16	86417419	86417805	86417701	Y	NA	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	169036	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	86421149	86421325	86421222	Y	FOXF1,FOXC2	NA	LOC400550,LOC732275,LOC146513,FOXF1	IMR90	Hi-C	24141950	MTHFSD	165516	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	86775121	86775409	86775225	Y	NA	NA	FOXC2,FOXL1	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	167147	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	86964858	86965748	86965178	Y	NA	NA	FOXL1,FOXC2,MTHFSD,FLJ30679,C16orf95	IMR90	Hi-C	24141950	FOXL1	356884	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr16	87428114	87428209	87428177	Y	NA	MAP1LC3B,FBXO31	NA	NA	NA	NA	FBXO31	4366	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	88337697	88337985	88337883	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179740	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr16	88338212	88338634	88338285	Y	ZNF469	NA	BANP	IMR90	Hi-C	24141950	ZFPM1	179091	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	88839181	88839507	88839410	Y	NA	PIEZO1,CDT1,APRT	NA	NA	NA	NA	PIEZO1	10112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	89268043	89268411	89268231	Y	NA	CDH15,ZNF778	NA	NA	NA	NA	ZNF778	13707	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr16	89573610	89573931	89573734	Y	NA	ANKRD11,SPG7	NA	NA	NA	NA	SPG7	18285	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	597415	597783	597745	Y	NA	RPS4XP17,VPS53,FAM57A	NA	NA	NA	NA	VPS53	25174	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	851603	851932	851829	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	29078	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	881812	881896	881869	Y	NA	NXN,TIMM22	NA	NA	NA	NA	NXN	802	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	1390195	1390341	1390268	Y	MYO1C,MYO1C,MYO1C	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	3765	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	1391218	1391783	1391434	Y	NA	CRK,MYO1C,INPP5K	NA	NA	NA	NA	MYO1C	2323	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr17	1992717	1993096	1992933	Y	SLC43A2,SCARF1,WDR81	OVCA2,HIC1	NA	NA	NA	NA	HIC1	37269	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	2302778	2303366	2303033	Y	SMG6,SMG6,RAP1GAP2,PAFAH1B1,METTL16,SGSM2,SGSM2,MNT	MNT	NA	NA	NA	NA	MNT	366	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	7381310	7382154	7381844	Y	KCTD11,TNK1,SOX15,KDM6B,ZBTB4,ZBTB4	TMEM102,FGF11,CHRNB1,ZBTB4,POLR2A	NA	NA	NA	NA	ZBTB4	3428	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr17	7738822	7740614	7739046	Y	ACAP1,ZBTB4,POLR2A,TNFSF12,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,WRAP53,VAMP2,PER1,CTC1,C17orf59,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	18450	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	7746991	7747556	7747325	Y	POLR2A,EIF4A1,CD68,CD68,SAT2,WRAP53,PER1,KDM6B	CYB5D1,CHD3,LSMD1	NA	NA	NA	NA	CYB5D1	11508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	8041932	8042438	8042328	Y	NA	HES7,PER1,VAMP2,SNORD118,TMEM107,C17orf59	NA	NA	NA	NA	PER1	15386	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	10039316	10039664	10039496	Y	GAS7,GAS7	NA	NA	NA	NA	NA	RPS27AP1	120415	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	11928413	11928725	11928507	Y	NA	ZNF18,MAP2K4	NA	NA	NA	NA	MAP2K4	6272	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	15849102	15849709	15849209	Y	ZSWIM7,TTC19,ADORA2B	ADORA2B	NA	NA	NA	NA	ADORA2B	2871	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	16948336	16948515	16948428	Y	ZNF287,ZNF624,PLD6,NT5M,MED9,FLCN,COPS3,COPS3,MPRIP	MPRIP	NA	NA	NA	NA	MPRIP	4477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	17655489	17655938	17655636	Y	DRG2,ALKBH5,COPS3,MED9	NA	NA	NA	NA	NA	RAI1	72702	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	21189600	21190105	21189864	Y	MAP2K3,MAP2K3	C17orf103,MAP2K3	NA	NA	NA	NA	MAP2K3	3616	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr17	25409900	25410125	25410078	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208977	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	25410571	25410806	25410743	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WSB1	208296	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	25858035	25858294	25858209	Y	WSB1,LGALS9	NA	NA	NA	NA	NA	KSR1	76365	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	26712546	26712820	26712749	Y	NA	POLDIP2,TMEM199,SARM1,SLC46A1	NA	NA	NA	NA	SLC46A1	19395	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	27273335	27273648	27273499	Y	PHF12	PHF12	NA	NA	NA	NA	PHF12	3141	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	27619094	27619880	27619581	Y	TAOK1	NA	NA	NA	NA	NA	NUFIP2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	27791459	27791862	27791696	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4523	75779	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	28050852	28051063	28050953	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CORO6	102927	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	28928053	28928382	28928251	Y	NA	SMURF2P1	NA	NA	NA	NA	SMURF2P1	2239	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	29210096	29210162	29210129	Y	NA	TEFM	NA	NA	NA	NA	TEFM	21676	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	29876692	29877391	29877039	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EVI2B	237562	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	31155018	31155230	31155072	Y	MYO1D	MYO1D	NA	NA	NA	NA	MYO1D	46965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	32581116	32581488	32581294	Y	NA	CCL2,CCL7,CCL11	NA	NA	NA	NA	CCL2	812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	33923571	33923796	33923685	Y	NA	AP2B1,PEX12	NA	NA	NA	NA	PEX12	19689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	36585417	36585600	36585486	Y	ARHGAP23	ARHGAP23	NA	NA	NA	NA	ARHGAP23	2755	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	37024501	37024874	37024707	Y	NA	CWC25,SNORA21,RPL23,LASP1	NA	NA	NA	NA	LASP1	389	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	37366071	37366159	37366135	Y	STAC2	CACNB1,RPL19	NA	NA	NA	NA	RPL19	11535	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	38085522	38085789	38085697	Y	ERBB2,IKZF3,ORMDL3	ORMDL3,PSMD3	NA	NA	NA	NA	ORMDL3	3668	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	38254249	38254664	38254597	Y	GRB7,WIPF2,RARA,RARA,NR1D1	THRA,MED24,NR1D1,MSL1,CASC3	NA	NA	NA	NA	NR1D1	314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	38440755	38440955	38440855	Y	NA	CDC6,RARA	NA	NA	NA	NA	CDC6	930	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	38619282	38619695	38619581	Y	TMEM99,TMEM99,TMEM99,KRT23,IGFBP4	TOP2A,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	IGFBP4	21580	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	38706778	38707153	38707073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	95607	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	38707495	38707811	38707586	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	94949	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr17	38708057	38709216	38708396	Y	KRTAP1-5,GJD3,IGFBP4	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	93544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr17	38713026	38713386	38713205	Y	KRTAP2-1	NA	NA	NA	NA	NA	SMARCE1	89374	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	39066622	39066986	39066860	Y	IGFBP4,KRTAP1-1,KRTAP1-5	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM99	93264	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	39110175	39110404	39110304	Y	KRTAP3-2	NA	NA	NA	NA	NA	KRTAP1-5	71050	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	40155760	40155995	40155877	Y	STAT5A	CNP,NKIRAS2,DNAJC7	NA	NA	NA	NA	NKIRAS2	5405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	41441650	41441788	41441734	Y	NA	ARL4D	NA	NA	NA	NA	ARL4D	32539	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	41686923	41687254	41687162	Y	NA	ETV4	DHX8,MEOX1,SOST	IMR90	Hi-C	24141950	ETV4	31935	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	42173050	42173151	42173101	Y	TMEM101,G6PC3	LSM12,G6PC3,HDAC5,C17orf53	NA	NA	NA	NA	HDAC5	25919	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	42276572	42276897	42276785	Y	TMEM101,G6PC3,HDAC5,GRN,TMUB2,TMUB2,ATXN7L3	TMUB2,ATXN7L3,UBTF	NA	NA	NA	NA	ATXN7L3	1091	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr17	42634020	42634172	42634095	Y	TMUB2,TMUB2,GRN,FZD2	FZD2	NA	NA	NA	NA	FZD2	1095	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr17	42797981	42798248	42798116	Y	CCDC43	CCDC43,DBF4B,RP11-1072C15.1	NA	NA	NA	NA	RP11-1072C15.1	2016	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	43170304	43170536	43170449	Y	ADAM11,HIGD1B,GFAP	NMT1,DCAKD,ACBD4,PLCD3	NA	NA	NA	NA	DCAKD	33831	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	44131950	44132178	44132002	Y	KIAA1267,KIAA1267	NA	NA	NA	NA	NA	PLEKHM1	565835	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	44344171	44344471	44344293	Y	NA	NA	KANSL1-AS1,KANSL1	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	RPS7P11	453062	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	44848812	44849347	44849259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS7P11	51279	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	45144155	45144236	45144196	Y	NA	NA	NPEPPS	IMR90	Hi-C	24141950	CDC27	120552	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	45317390	45317724	45317566	Y	TBKBP1	ITGB3	NA	NA	NA	NA	ITGB3	11539	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	48255388	48256117	48255676	Y	NA	PPP1R9B,SGCA,COL1A1	NA	NA	NA	NA	SGCA	15813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	48287695	48288075	48287880	Y	XYLT2,LRRC59,COL1A1	SGCA,COL1A1	PDK2,ITGA3,COL1A1,PPP1R9B,SGCA,HILS1,TMEM92,XYLT2	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A1	10702	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	48367346	48367814	48367643	Y	PPP1R9B	TMEM92	NA	NA	NA	NA	TMEM92	20579	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	55951789	55952442	55952113	Y	SRSF1,MKS1,MKS1,BZRAP1,MRPS23	MRPS23	NA	NA	NA	NA	MRPS23	26372	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	55977135	55977456	55977362	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS23	51718	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	56023350	56023692	56023525	Y	NA	CUEDC1,VEZF1	CUEDC1,VEZF1	IMR90	Hi-C	24141950	CUEDC1	6992	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	56064193	56064677	56064258	Y	NA	CUEDC1,VEZF1,SRSF1	NA	NA	NA	NA	VEZF1	573	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	56428194	56428499	56428372	Y	VEZF1,MTMR4,SUPT4H1	NA	NA	NA	NA	NA	SUPT4H1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57409690	57409997	57409875	Y	YPEL2	YPEL2	NA	NA	NA	NA	YPEL2	2640	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57502934	57503327	57503130	Y	YPEL2	NA	YPEL2	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	95884	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57504897	57505104	57505023	Y	NA	NA	YPEL2,GDPD1	IMR90	Hi-C	24141950	YPEL2	97847	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57831888	57832338	57832062	Y	VMP1,RNFT1	VMP1,PTRH2	NA	NA	NA	NA	PTRH2	48901	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57882537	57882682	57882623	Y	YPEL2,VMP1,RNFT1	MIR21	NA	NA	NA	NA	MIR21	33945	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	57962596	57962816	57962625	Y	NA	MIR21,TUBD1,RPS6KB1	NA	NA	NA	NA	TUBD1	5488	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	59018495	59018735	59018604	Y	NA	NA	TBX2,C17orf82	IMR90	Hi-C	24141950	BCAS3	265681	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	59939507	59939855	59939761	Y	BRIP1	BRIP1	NA	NA	NA	NA	BRIP1	625	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	60555037	60555507	60555099	Y	NA	NA	MRC2	IMR90	Hi-C	24141950	MRC2	147255	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	60868052	60868313	60868162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	165290	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	60970243	60970809	60970465	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	267481	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	61043121	61043648	61043243	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRC2	340359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	61127299	61127625	61127462	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CYB561	394114	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	61451328	61451417	61451341	Y	NA	NA	MIR548W,MARCH10	IMR90	Hi-C	24141950	CYB561	70322	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	61514078	61514307	61514301	Y	SMARCD2,DDX42,CYB561,CYB561	CYB561,ACE	NA	NA	NA	NA	CYB561	7432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	62526246	62526643	62526459	Y	NA	POLG2,MIR3064,CEP95,DDX5	NA	NA	NA	NA	DDX5	23929	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	62583721	62583959	62583840	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	72227	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	62586168	62586194	62586181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SMURF2	69992	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	63119249	63119621	63119552	Y	GNA13	RGS9	RGS9,GNA13,AMZ2P1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RGS9	11928	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	63639930	63640399	63640359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	84165	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr17	63646847	63647018	63646933	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AXIN2	91082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	63996608	63996849	63996729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CEP112	189353	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	65386872	65387224	65386898	Y	HELZ,BPTF,PITPNC1	PSMD12,PITPNC1	NA	NA	NA	NA	PITPNC1	15297	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	65897183	65897370	65897273	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BPTF	77543	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	66376984	66377775	66377396	Y	NA	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	73879	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	66379549	66379922	66379702	Y	SLC16A6,WIPI1	NA	WIPI1	IMR90	Hi-C	24141950	WIPI1	71732	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	66419326	66419636	66419592	Y	NA	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	32018	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	66452519	66452682	66452605	Y	SLC16A6,WIPI1	WIPI1	NA	NA	NA	NA	WIPI1	865	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	66509186	66509763	66509535	Y	SLC16A6,PRKAR1A,PRKAR1A	PRKAR1A	NA	NA	NA	NA	PRKAR1A	3265	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	72978355	72978661	72978434	Y	KIAA0195,RAB37,GRIN2C,KCTD2,FADS6,C17orf28,CDR2L	CDR2L,ICT1,KCTD2	CDR2L,ICT1,C17orf28,HN1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CDR2L	3066	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	73868951	73869202	73869040	Y	TRIM47	WBP2,TRIM47,TRIM65,MRPL38	NA	NA	NA	NA	TRIM47	3454	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	74341579	74341976	74341749	Y	NA	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	28689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr17	74368264	74368743	74368490	Y	SPHK1,SPHK1	SPHK1,PRPSAP1	NA	NA	NA	NA	SPHK1	1922	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	74526422	74526750	74526585	Y	CYGB	RHBDF2,CYGB	NA	NA	NA	NA	CYGB	18507	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	74692944	74693312	74693210	Y	NA	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	11786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	74705254	74705618	74705431	Y	MXRA7	MXRA7,JMJD6,METTL23,MFSD11,SRSF2	NA	NA	NA	NA	MXRA7	156	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75281811	75282557	75281917	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	7160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	75318206	75318391	75318316	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43555	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75318595	75318736	75318679	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	43944	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75319028	75319523	75319372	Y	SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	44377	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	75319670	75320031	75319742	Y	MGAT5B,SEPT9,SEPT9	SEPT9	NA	NA	NA	NA	SEPT9	45019	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr17	75387909	75388384	75388205	Y	SEPT9,SEPT9	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	113258	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75417194	75417582	75417357	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	142543	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75429541	75429800	75429625	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEPT9	154890	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	75954393	75954796	75954614	Y	NA	NA	TNRC6C,LOC100507351	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SYNGR2	207843	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.9659029019307
chr17	76320464	76321292	76320695	Y	CYTH1,SOCS3,PGS1	SOCS3	NA	NA	NA	NA	SOCS3	32866	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	77783959	77784243	77784073	Y	CBX2,CBX8	CBX2,CBX8,CBX4	NA	NA	NA	NA	CBX8	10477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	77967532	77967765	77967641	Y	CBX8,CBX4,RNF213,GAA,EIF4A3	TBC1D16,CCDC40	NA	NA	NA	NA	TBC1D16	39882	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr17	78428203	78429274	78428566	Y	NA	ENDOV,NPTX1	NA	NA	NA	NA	NPTX1	20369	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr17	78725388	78725609	78725479	Y	AATK	NA	NA	NA	NA	NA	RPTOR	208769	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	78830209	78830686	78830492	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHMP6	132712	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr17	79068878	79069252	79068906	Y	C17orf56	NA	NA	NA	NA	NA	BAIAP2	61930	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	79319325	79319648	79319507	Y	FAM195B,CHMP6,C17orf89,SLC38A10,MRPL12,HGS,C17orf90,C17orf70,ACTG1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	51978	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	79319812	79320225	79320116	Y	FAM195B,DYSFIP1,AATK,AZI1,TSPAN10,C17orf70,BAHCC1	NA	BAHCC1,SLC38A10,TMEM105,ACTG1,MIR4740,NPLOC4,LINC00482,MIR3186,FSCN2,C17orf70	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC38A10	52465	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	79360408	79361324	79361141	Y	ARHGDIA,ARHGDIA,TSPAN10	NA	NA	NA	NA	NA	SLC38A10	93061	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80052713	80052821	80052782	Y	MRPL12,SLC25A10,GCGR,PCYT2,ASPSCR1,HEXDC,FOXK2,LRRC45,DCXR,DUS1L,FASN	GPS1,RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	1387	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80056613	80056910	80056718	Y	C17orf90,CCDC137,HGS,MRPL12,SLC25A10,FAM195B,THOC4,ANAPC11,ANAPC11,PCYT2,SIRT7,ASPSCR1,NARF,HEXDC,FOXK2,CCDC57,C17orf62,C17orf101,STRA13,LRRC45,RAC3,GPS1,DUS1L,FASN	RFNG,DUS1L,FASN	NA	NA	NA	NA	FASN	2405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80188750	80189250	80189000	Y	NARF,CSNK1D,C17orf62,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3,SLC16A3	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	SLC16A3	4477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80216124	80216440	80216314	Y	NA	CCDC57,SLC16A3,CSNK1D	NA	NA	NA	NA	CSNK1D	13167	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80592968	80593241	80593234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB40B	61363	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	80655375	80655626	80655561	Y	RAB40B,FN3K	RAB40B,FN3KRP,FN3K	NA	NA	NA	NA	RAB40B	771	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	81038687	81040054	81039707	Y	B3GNTL1,METRNL	B3GNTL1,METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	3120	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr17	81058904	81059222	81058949	Y	METRNL	METRNL	NA	NA	NA	NA	METRNL	23337	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	394915	395311	395219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COLEC12	103411	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	2605641	2605936	2605854	Y	NA	METTL4,NDC80,CBX3P2,SMCHD1	NA	NA	NA	NA	NDC80	36131	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	2875334	2875786	2875693	Y	NA	EMILIN2	NA	NA	NA	NA	EMILIN2	30306	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	3251422	3251674	3251471	Y	MYOM1	MYL12A,MYL12B	NA	NA	NA	NA	MYL12A	5943	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	3446696	3446930	3446873	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	TGIF1	NA	NA	NA	NA	TGIF1	37090	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	3623872	3624258	3624140	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214266	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr18	3624338	3624601	3624482	Y	TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	214732	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	3624841	3625119	3625035	Y	MYL12A,MYL12B,MYL12B,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1,TGIF1	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	215235	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	4004554	4004687	4004639	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	594948	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	4328751	4329143	4328947	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TGIF1	919145	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	8704447	8704767	8704559	Y	NA	NA	CCDC165,NDUFV2	IMR90	Hi-C	24141950	RAB12	97004	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	8801229	8801479	8801315	Y	CCDC165	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	193786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	8803155	8803225	8803221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAB12	195712	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	8948545	8948913	8948824	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	151715	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	8949015	8949649	8949122	Y	TWSG1	NA	CCDC165	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFV2	150979	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	9138526	9138911	9138547	Y	ANKRD12,ANKRD12	NDUFV2,ANKRD12	NA	NA	NA	NA	ANKRD12	4300	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	10543130	10543398	10543236	Y	NAPG	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	19228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	10545349	10545498	10545424	Y	NA	NAPG	NA	NA	NA	NA	NAPG	21447	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	11849903	11850727	11850169	Y	MPPE1,CHMP1B	CHMP1B	NA	NA	NA	NA	CHMP1B	508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	11947272	11947721	11947412	Y	CHMP1B	MPPE1,IMPA2	IMPA2,GNAL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	IMPA2	31303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	12288068	12288497	12288213	Y	NA	TUBB6	TUBB6	IMR90	Hi-C	24141950	TUBB6	17171	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr18	12317654	12318000	12317871	Y	CHMP1B	TUBB6	NA	NA	NA	NA	TUBB6	11986	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	12330841	12331244	12331045	Y	NA	TUBB6,AFG3L2	NA	NA	NA	NA	TUBB6	25173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	13382338	13382799	13382497	Y	RNMT,PTPN2,CEP192	NA	NA	NA	NA	NA	RNMT	341860	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	13824016	13824345	13824089	Y	MC5R	NA	NA	NA	NA	NA	FAM210A	99354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	18942831	18943125	18942978	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GREB1L	122628	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	19373794	19374099	19373861	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIB1	90876	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	20046739	20046926	20046743	Y	GATA6	NA	GATA6,CTAGE1	IMR90	Hi-C	24141950	GATA6	299335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	20274994	20275099	20275066	Y	NA	NA	GATA6	IMR90	Hi-C	24141950	RBBP8	101125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr18	21165246	21165762	21165429	Y	C18orf8,NPC1	NPC1	NA	NA	NA	NA	NPC1	384	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	21417655	21417852	21417722	Y	NPC1,LAMA3	NA	NA	NA	NA	NA	TTC39C	152885	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr18	22864731	22865080	22865053	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF521	65074	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	26744101	26744374	26744185	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDH2	988691	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr18	29542474	29542964	29542885	Y	RNF138	TRAPPC8	NA	NA	NA	NA	TRAPPC8	11375	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	32829674	32829781	32829775	Y	ZNF397,ZSCAN30	ZNF397,ZSCAN30,ZNF271	NA	NA	NA	NA	ZNF397	10680	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	33876540	33877026	33876703	Y	NA	FHOD3	NA	NA	NA	NA	FHOD3	863	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	39520548	39520801	39520707	Y	NA	PIK3C3	PIK3C3	IMR90	Hi-C	24141950	PIK3C3	12370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	41345475	41345795	41345567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SETBP1	912343	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	42295257	42295574	42295401	Y	SETBP1,SETBP1	SETBP1	NA	NA	NA	NA	SETBP1	37119	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	43351602	43351892	43351629	Y	SLC14A1	NA	NA	NA	NA	NA	EPG5	193348	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	43382830	43382969	43382904	Y	NA	NA	EPG5,SLC14A2,SLC14A1,SIGLEC15	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	EPG5	162271	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46254756	46255278	46254982	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	191339	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46269539	46269878	46269723	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	206122	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46349762	46350033	46349891	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	286345	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46478230	46479206	46479122	Y	SMAD7,SMAD7	NA	NA	NA	NA	NA	CTIF	414813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr18	46482158	46482454	46482304	Y	SMAD7,SMAD7	NA	SMAD7	K562	ChIA-PET	22265404	CTIF	418741	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr18	46502180	46502412	46502333	Y	SMAD7	NA	SMAD7,CTIF	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	CTIF	438763	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46520518	46520924	46520659	Y	NA	NA	CTIF,SMAD7,DYM	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CTIF	457101	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	46598750	46599196	46598974	Y	DYM	NA	NA	NA	NA	NA	DYM	386521	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	53041931	53042230	53042160	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TCF4	287788	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	55267032	55267261	55267214	Y	NEDD4L	FECH,NARS	NA	NA	NA	NA	FECH	15028	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56032271	56032718	56032513	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	261471	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56159165	56159246	56159180	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	134943	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56193191	56193601	56193321	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	100588	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr18	56208933	56209328	56209119	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	84861	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56232351	56232608	56232443	Y	MALT1	NA	NA	NA	NA	NA	ALPK2	61581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56537923	56538093	56537956	Y	ZNF532	ZNF532	NA	NA	NA	NA	ZNF532	10091	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56631378	56631745	56631564	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	103546	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	56633214	56633485	56633410	Y	ZNF532	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF532	105382	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	58114055	58114449	58114252	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MC4R	76054	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	60189219	60189514	60189362	Y	TNFRSF11A,ZCCHC2	ZCCHC2	NA	NA	NA	NA	ZCCHC2	979	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	61350519	61350880	61350698	Y	SERPINB5,SERPINB12,SERPINB3,SERPINB11	NA	SERPINB10,SERPINB7	IMR90	Hi-C	24141950	SERPINB7	67289	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	61565801	61566233	61565950	Y	NA	SERPINB2,HMSD	NA	NA	NA	NA	SERPINB2	28875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr18	63434118	63434346	63434234	Y	CDH7	NA	NA	NA	NA	NA	DSEL	1747871	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	65945074	65945279	65945262	Y	NA	NA	LOC643542	IMR90	Hi-C	24141950	CCDC102B	435167	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	67442113	67442512	67442133	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOK6	375822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	67602194	67602356	67602256	Y	RTTN,CD226	NA	NA	NA	NA	NA	RTTN	268825	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	67957012	67957306	67957264	Y	NA	SOCS6	NA	NA	NA	NA	SOCS6	2875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	72919000	72919372	72919172	Y	NA	TSHZ1	NA	NA	NA	NA	ZADH2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	74195251	74195532	74195392	Y	NA	ZNF516,RP11-17M16.1	NA	NA	NA	NA	ZNF516	9614	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	74277239	74277430	74277301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-17M16.1	71762	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr18	74783964	74784198	74784017	Y	MBP	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	251401	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	74815308	74815668	74815588	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF236	282745	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr18	77016280	77016404	77016342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9B	188995	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	532930	533293	533259	Y	C19orf6,C19orf22,ARID3A	MADCAM1,TPGS1,CDC34,BSG	NA	NA	NA	NA	CDC34	3216	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	573434	573573	573481	Y	ODF3L2,C19orf22,CDC34,BSG	CDC34,BSG,HCN2	NA	NA	NA	NA	BSG	4137	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	925071	925217	925123	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A	NA	NA	NA	NA	ARID3A	1290	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	933164	933556	933549	Y	NA	MED16,R3HDM4,ARID3A,WDR18	NA	NA	NA	NA	ARID3A	9383	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	1266359	1266798	1266589	Y	NA	C19orf26,ATP5D,MIDN,CIRBP,C19orf24,MUM1	NA	NA	NA	NA	C19orf24	6228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr19	1408607	1408695	1408655	Y	CNN2,POLR2E,GPX4,GPX4,UQCR11,SCAMP4,FAM108A1,ADAT3,RPS15	NDUFS7,GAMT,DAZAP1,RPS15	NA	NA	NA	NA	DAZAP1	3039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	1855247	1855761	1855485	Y	SPPL2B,SF3A2,PLEKHJ1,LSM7,C19orf35,NDUFS7,C19orf25,TCF3,ATP8B3,ATP8B3,MOBKL2A,BTBD2,REXO1,SCAMP4,KLF16,CSNK1G2,ADAT3	ATP8B3,REXO1,KLF16,SCAMP4,ADAT3	NA	NA	NA	NA	KLF16	5806	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	2059605	2060167	2060113	Y	REXO1,FAM108A1,SCAMP4,ADAT3,BTBD2	BTBD2,MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MKNK2	10362	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	2095281	2095723	2095416	Y	NA	MKNK2,MOB3A	NA	NA	NA	NA	MOB3A	609	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	2330710	2331138	2330903	Y	NA	SPPL2B,LSM7	NA	NA	NA	NA	LSM7	4091	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr19	2524971	2525260	2525066	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	50851	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	2543618	2543970	2543682	Y	DOT1L,GADD45B	NA	NA	NA	NA	NA	GADD45B	69498	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	3404656	3404792	3404728	Y	TLE2,TLE2,PIP5K1C,ATCAY,NFIC,NFIC	NFIC	NA	NA	NA	NA	NFIC	47095	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	4059877	4060289	4060128	Y	SEMA6B,CCDC94,ZBTB7A,SIRT6	ZBTB7A	NA	NA	NA	NA	ZBTB7A	4654	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	4375735	4376107	4375790	Y	ZBTB7A,EBI3	STAP2,MPND,SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	22437	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	4393849	4394251	4394129	Y	NA	SH3GL1,CHAF1A	NA	NA	NA	NA	SH3GL1	4293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	4456385	4456784	4456737	Y	UBXN6,UBXN6	UBXN6,HDGFRP2	NA	NA	NA	NA	UBXN6	566	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr19	4812881	4813376	4813265	Y	SEMA6B,TICAM1	FEM1A,TICAM1	NA	NA	NA	NA	TICAM1	16340	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	6056849	6057757	6057360	Y	DENND1C,SAFB2,SAFB,VMAC,RFX2	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	80696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	6071128	6071397	6071200	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	94975	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr19	6076501	6076965	6076757	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RANBP3	100348	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr19	6271729	6272422	6272353	Y	NDUFA11,MLLT1	MLLT1	NA	NA	NA	NA	MLLT1	5537	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	8488784	8489136	8488939	Y	PRAM1,MYO1F	RAB11B,MARCH2,HNRNPM	NA	NA	NA	NA	MARCH2	12630	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	8674150	8674979	8674636	Y	ADAMTS10	ADAMTS10	NA	NA	NA	NA	ADAMTS10	530	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr19	9420483	9420931	9420837	Y	NA	ZNF559	NA	NA	NA	NA	ZNF559	11517	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	9748883	9749171	9749027	Y	OR7D4,OR7E24,ZNF559,ZNF559,ZNF559-ZNF177,ZNF177,ZNF177,ZNF426,ZNF846,OLFM2,ZNF562	ZNF561,ZNF562,RPS4XP22	NA	NA	NA	NA	ZNF561	18808	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	9974094	9974487	9974263	Y	NA	FBXL12,UBL5,PIN1	NA	NA	NA	NA	PIN1	30161	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	10024468	10024837	10024779	Y	OLFM2	OLFM2	PIN1	K562,MCF7	ChIA-PET	22265404	OLFM2	20391	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	10515339	10515636	10515481	Y	PDE4A,PDE4A	TYK2,MIR1181	NA	NA	NA	NA	MIR1181	3125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	11253262	11253482	11253341	Y	TMED1,CARM1,YIPF2,DOCK6	SPC24	NA	NA	NA	NA	SPC24	11002	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	11804467	11804940	11804795	Y	ZNF878,ZNF823,ZNF491	HNRNPA1P10,ZNF823	NA	NA	NA	NA	HNRNPA1P10	28622	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	12404552	12404928	12404719	Y	ZNF791,ZNF564,ZNF490,WDR83,JUNB,ZNF700,ZNF763,ZNF136,ZNF799,ZNF443,ZNF563,ZNF44	CTD-2666L21.3,ZNF44,ZNF563	NA	NA	NA	NA	ZNF44	850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	12888910	12889352	12889266	Y	NA	C19orf43,ASNA1,JUNB,PRDX2,RNASEH2A	NA	NA	NA	NA	JUNB	10958	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr19	13147424	13147812	13147700	Y	WDR83,FBXW9,TNPO2,TNPO2	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	43002	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	13153458	13153528	13153499	Y	NA	NFIX	NA	NA	NA	NA	NFIX	49036	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	13238145	13238217	13238180	Y	NA	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	NACC1	11228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	13262107	13262928	13262695	Y	MAN2B1,C19orf43,JUNB	TRMT1,NACC1,STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	2878	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	13278382	13278991	13278445	Y	BEST2,JUNB,LYL1,STX10	STX10,IER2	NA	NA	NA	NA	IER2	19153	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	13957204	13959386	13957586	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZSWIM4	52930	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	14732511	14733275	14733016	Y	SYDE1	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFB7	51637	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr19	15333627	15333747	15333631	Y	SYDE1,NOTCH3	NOTCH3	NA	NA	NA	NA	NOTCH3	23835	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	16188924	16190024	16189835	Y	TPM4	TPM4,RAB8A	NA	NA	NA	NA	TPM4	13093	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	16510195	16510544	16510471	Y	RAB8A,HSH2D,MED26,EPS15L1,KLF2	NA	NA	NA	NA	NA	EPS15L1	70352	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	17200078	17200517	17200217	Y	MED26,FAM129C,HAUS8,MYO9B	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	15487	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	17206039	17206296	17206201	Y	NA	HAUS8,MYO9B	NA	NA	NA	NA	MYO9B	21448	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	17791017	17791370	17791235	Y	MAP1S,IFI30,ARRDC2,ARRDC2	UNC13A,MAP1S	NA	NA	NA	NA	UNC13A	6031	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	18315989	18316123	18316056	Y	NA	IFI30,MPV17L2,RAB3A	NA	NA	NA	NA	RAB3A	3105	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	18415031	18416060	18415513	Y	JAK3,KCNN1,ARRDC2,ARRDC2,IL12RB1,SSBP4,KLHL26,ELL,C19orf60,JUND	KIAA1683,JUND,MIR3188,LSM4,PGPEP1	NA	NA	NA	NA	LSM4	16024	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	18631384	18632027	18631497	Y	ELL	ELL,FKBP8,KXD1,UBA52	NA	NA	NA	NA	ELL	447	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	19192588	19193136	19192878	Y	NA	SUGP2,SLC25A42	NA	NA	NA	NA	SLC25A42	19780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	19432680	19432782	19432710	Y	NA	MAU2,SUGP1	NA	NA	NA	NA	SUGP1	3027	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	30157267	30157499	30157417	Y	PLEKHF1,C19orf12,C19orf12	PLEKHF1,C19orf12	NA	NA	NA	NA	PLEKHF1	3304	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	31371885	31372199	31372043	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TSHZ3	466254	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	31618240	31618367	31618270	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	220086	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	31618618	31618806	31618712	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	219647	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	31705006	31705320	31705186	Y	NA	NA	TSHZ3	IMR90	Hi-C	24141950	TSHZ3	133133	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	34664379	34664787	34664699	Y	SCGBL,KIAA0355,LSM14A	LSM14A	NA	NA	NA	NA	LSM14A	2970	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	34992713	34992833	34992773	Y	NA	WTIP	NA	NA	NA	NA	WTIP	22839	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	36748454	36748637	36748519	Y	ARHGAP33,APLP1,CLIP3,CLIP3,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF461,ZNF382,ZFP82,ZFP14,ZNF565,ZNF565	ZNF146,ZNF565	NA	NA	NA	NA	ZNF565	13295	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	37408041	37408149	37408081	Y	ZNF527,HKR1,ZFP82,ZNF566,ZNF566,ZNF529,ZNF382,ZNF461,ZNF790,ZNF345,ZNF345,ZNF345,ZNF585B,ZNF420,ZNF383,ZNF829,ZNF568	ZNF829,ZNF568	NA	NA	NA	NA	ZNF568	2810	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	39148533	39148920	39148613	Y	C19orf33,FAM98C,PAPL,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	39149253	39149575	39149354	Y	SPINT2,C19orf33,PAK4,ACTN4	EIF3K,ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	12964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr19	39182594	39182977	39182723	Y	PAK4,ACTN4	ACTN4	NA	NA	NA	NA	ACTN4	46305	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	39863077	39863463	39863179	Y	NA	SAMD4B,PAF1,MED29,ZFP36,MIR4530,PLEKHG2	NA	NA	NA	NA	PAF1	16372	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	40315090	40315548	40315357	Y	NA	DYRK1B,FBL	NA	NA	NA	NA	DYRK1B	7293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	40823184	40823546	40823487	Y	NA	AKT2,PLD3,C19orf47	NA	NA	NA	NA	PLD3	28817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	40939716	40940068	40940022	Y	SERTAD1	PRX,SERTAD1,SERTAD3,BLVRB	NA	NA	NA	NA	SERTAD3	8544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	41729438	41729579	41729517	Y	ATP5SL,ATP5SL,AXL	AXL,HNRNPUL1	NA	NA	NA	NA	AXL	6330	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	41804006	41804567	41804366	Y	TGFB1,B9D2,HNRNPUL1	HNRNPUL1,CCDC97	NA	NA	NA	NA	CCDC97	9527	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42028325	42028365	42028354	Y	NA	NA	CEACAM7,LOC100505495,C19orf69,ATP5SL,CEACAM21	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	83703	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	42037922	42038313	42037990	Y	CCDC97,TGFB1,B9D2,TMEM91,CEACAM4,CEACAM21,ARHGEF1	NA	LOC100505495	IMR90	Hi-C	24141950	ATP5SL	93300	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42440713	42441005	42440837	Y	ZNF574,DEDD2,ARHGEF1,ARHGEF1	RABAC1	NA	NA	NA	NA	RABAC1	20537	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42514619	42514744	42514681	Y	ATP1A3	ATP1A3	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	14970	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42527414	42527647	42527531	Y	NA	ATP1A3,ZNF574	NA	NA	NA	NA	ATP1A3	27765	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr19	42772295	42772768	42772477	Y	NA	ZNF526,GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	1606	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr19	42772804	42773312	42773020	Y	CEACAM3,LYPD4,DMRTC2,ZNF574,DEDD2,LIPE	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	2115	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42774379	42774759	42774668	Y	CEACAM8,CEACAM3,ARHGEF1,ZNF574,POU2F2,DEDD2,ERF,CIC	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	POU2F2,LOC100505622,MIR4323	IMR90	Hi-C	24141950	CIC	3690	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	42775992	42776735	42776352	Y	NA	GSK3A,ERF,CIC,PAFAH1B3	NA	NA	NA	NA	CIC	5303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	43355116	43355369	43355287	Y	NA	PSG1	NA	NA	NA	NA	PSG1	26605	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	43525971	43526126	43526036	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSG2	59071	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	44138598	44138945	44138732	Y	ZNF575,ZNF284,ZNF224,ZNF223,ZNF221,LYPD5,LOC390940,CADM4	IRGQ,ZNF576,SRRM5,ZNF428,PLAUR	NA	NA	NA	NA	ZNF428	16572	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	44711538	44711905	44711597	Y	NA	ZNF226,ZNF227,ZNF233	NA	NA	NA	NA	ZNF227	1838	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	45129392	45129792	45129578	Y	PVRL2,GEMIN7,GEMIN7,PVR	PVR	NA	NA	NA	NA	PVR	15306	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	45240026	45240191	45240078	Y	RELB,CLASRP,BLOC1S3,BCL3	BCL3	BCL3	K562	ChIA-PET	22265404	BCL3	8771	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	45352107	45352544	45352311	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	4675	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	45352951	45353140	45353112	Y	NA	BCAM,PVRL2,TOMM40	NA	NA	NA	NA	PVRL2	5519	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	45931993	45932316	45932152	Y	GIPR,RELB,CLASRP,VASP,FOSB	CD3EAP,PPP1R13L,FOSB,ERCC1	NA	NA	NA	NA	PPP1R13L	24386	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	45959420	45959846	45959631	Y	GIPR,RELB,CLASRP,BLOC1S3,VASP,FOSB	FOSB,ERCC1,RTN2,VASP	FOSB	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	FOSB	9407	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	46683956	46684315	46684191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFL3	58025	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	47062362	47062544	47062453	Y	NA	GAPDHP38,CALM3	NA	NA	NA	NA	GAPDHP38	2464	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	47448240	47448462	47448420	Y	PNMAL1,PNMAL2,DACT3,ARHGAP35,MEIS3,NPAS1	NA	NA	NA	NA	NA	NPAS1	72615	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr19	47458912	47459233	47458939	Y	ZC3H4,CCDC9	NA	NPAS1	IMR90	Hi-C	24141950	NPAS1	61844	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	47746329	47746738	47746506	Y	SLC1A5,SLC1A5,SLC1A5,MEIS3,EHD2,BBC3,PRR24	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	CCDC9	10499	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr19	47776748	47776969	47776841	Y	GLTSCR2,ZC3H4,NAPA,GLTSCR1,DHX34,BBC3,CCDC9,GPR77,C5AR1	BBC3,CCDC9,PRR24	NA	NA	NA	NA	PRR24	606	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	47949356	47949644	47949521	Y	NA	MEIS3,KPTN	NA	NA	NA	NA	MEIS3	28576	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	48016024	48016351	48016088	Y	SULT2A1,CCDC9,GPR77,DHX34,NAPA	KPTN,NAPA	NA	NA	NA	NA	NAPA	146	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr19	48102180	48102576	48102418	Y	NA	NA	SLC8A2,MEIS3,NAPA,LOC100505681,KPTN,GLTSCR1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	NAPA	85683	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	48103581	48103982	48103689	Y	GLTSCR2,BBC3,PRR24,NAPA,GLTSCR1	NA	GLTSCR1,NAPA	MCF7	ChIA-PET	22265404	NAPA	87084	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	48642255	48642637	48642446	Y	NA	PLA2G4C,LIG1	NA	NA	NA	NA	LIG1	29223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	48903013	48903207	48903134	Y	PPP1R15A,EMP3,FUT1,IZUMO1	TMEM143,KDELR1,GRWD1	NA	NA	NA	NA	KDELR1	10203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	49092091	49092636	49092297	Y	BCAT2,TMEM143,KDELR1,KCNJ14,MAMSTR,SPHK2,SPHK2,DBP,CA11	SPHK2,RPL18,DBP	NA	NA	NA	NA	SPHK2	27912	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	49698080	49698342	49698211	Y	NA	TRPM4	NA	NA	NA	NA	TRPM4	39082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	51182448	51182932	51182864	Y	NA	C19orf81,SHANK1,CLEC11A	NA	NA	NA	NA	C19orf81	31746	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	52192085	52192767	52192400	Y	ZNF841,ZNF615,IGLON5,SIGLEC8,ZNF175,ZNF649,ZNF577,ZNF577	NA	NA	NA	NA	NA	FPR1	112596	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	53727403	53727861	53727738	Y	NA	ZNF665,ZNF677	NA	NA	NA	NA	ZNF677	28290	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	54411435	54411746	54411498	Y	MYADM,PRKCG,CACNG8,CACNG7	MYADM,AC008753.6	NA	NA	NA	NA	AC008753.6	41074	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	54714720	54715094	54714879	Y	NLRP12,NLRP12,MYADM,MYADM,MYADM,VSTM1,OSCAR,LILRB4,LILRB1,LILRB1,LILRB1,LILRA5,LILRA3,LILRA3,LILRA2,LILRA1,LENG8,LAIR1,MBOAT7,TSEN34,LILRB3,LILRB2,LILRA6	MBOAT7,TSEN34,RPS9	NA	NA	NA	NA	RPS9	12110	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	55627475	55627790	55627718	Y	LILRB1,LILRB1,LILRB4,FCAR,NCR1,GP6,ZNF865,TMEM86B,TMEM150B,SHISA7,PPP6R1,PPP1R12C	RDH13,PPP1R12C	NA	NA	NA	NA	PPP1R12C	548	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	55721470	55721547	55721521	Y	NA	PTPRH,PPP6R1	NA	NA	NA	NA	PTPRH	2596	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	55988531	55988605	55988568	Y	NAT14	ISOC2,ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	ZNF628	2832	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	56031210	56031577	56031512	Y	TMEM150B,SGK110	ZNF628,NAT14,SSC5D	NA	NA	NA	NA	SSC5D	33439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	56060798	56061018	56060898	Y	NA	ZNF579,ZNF524	SGK110	K562	ChIA-PET	22265404	ZNF579	29193	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	56116208	56117068	56116734	Y	NA	ZNF579,ZNF524,FIZ1,ZNF784,ZNF580,ZNF581,CCDC106,U2AF2	NA	NA	NA	NA	FIZ1	4872	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr19	56789143	56789486	56789342	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF542	87982	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	57020241	57020583	57020445	Y	ZNF582,ZNF583,ZNF583,ZNF583,ZNF667,ZNF835,ZIM2,PEG3,PEG3,LOC147670,ZNF471,ZNF71,ZNF470,ZFP28	ZNF667-AS1,ZNF667,ZNF471	NA	NA	NA	NA	ZNF471	3029	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	58912594	58912944	58912773	Y	ZNF417,ZNF418,ZNF256,ZSCAN1,ZNF135,ZSCAN18,ZNF329,ZNF544,ZNF8,MZF1,ZNF497,ZNF837,ZNF324B,ZNF324	A1BG,ZNF837,RPS5,ZNF584,ZNF132,ZNF324B	NA	NA	NA	NA	ZNF584	1723	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr19	59029635	59029989	59029796	Y	NA	ZBTB45,TRIM28,CHMP2A,UBE2M	SLC27A5	MCF7	ChIA-PET	22265404	ZBTB45	18289	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	1725652	1725860	1725698	Y	NA	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	20764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	1735614	1736022	1735851	Y	PXDN	PXDN	NA	NA	NA	NA	PXDN	10602	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	8190570	8190676	8190607	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ID2	626299	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	9641378	9641587	9641543	Y	NA	IAH1	NA	NA	NA	NA	IAH1	29591	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	9705660	9705808	9705714	Y	NA	ADAM17	NA	NA	NA	NA	ADAM17	11739	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	11352501	11352895	11352887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PQLC3	59177	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	11547236	11547448	11547321	Y	NA	NA	ROCK2,PQLC3,C2orf50	IMR90	Hi-C	24141950	E2F6	56849	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	12309855	12310149	12310048	Y	LPIN1	NA	TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	LPIN1	494134	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	12860025	12860219	12860122	Y	NA	TRIB2	NA	NA	NA	NA	TRIB2	5010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	12928047	12928351	12928221	Y	NA	NA	LPIN1,MIR4262,TRIB2,LOC100506474	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	73032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	12959326	12959589	12959403	Y	NA	NA	LPIN1	IMR90	Hi-C	24141950	TRIB2	104311	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	15700375	15700622	15700454	Y	DDX1,NBAS	NBAS,DDX1	NA	NA	NA	NA	NBAS	921	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	17824489	17824666	17824658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VSNL1	106096	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	18811449	18811776	18811476	Y	NA	NA	OSR1,NT5C1B-RDH14	IMR90	Hi-C	24141950	RDH14	71503	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	20249984	20250622	20250147	Y	TTC32,PUM2	MATN3,LAPTM4A	NA	NA	NA	NA	LAPTM4A	195	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	20491517	20491908	20491876	Y	NA	NA	SDC1	IMR90	Hi-C	24141950	PUM2	58087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	20811186	20811439	20811262	Y	NA	HS1BP3	NA	NA	NA	NA	HS1BP3	37410	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	28632075	28632521	28632225	Y	PPP1CB,PPP1CB,FOSL2	FOSL2,AC104695.3	NA	NA	NA	NA	AC104695.3	16536	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	30594059	30594375	30594217	Y	NA	NA	LBH,LCLAT1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LCLAT1	73717	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	30631915	30632243	30632028	Y	LBH	LCLAT1	LBH,LCLAT1	IMR90	Hi-C	24141950	LCLAT1	35849	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	33437244	33437520	33437371	Y	FAM98A,LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	221871	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	33439613	33439863	33439738	Y	LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	219528	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	33441691	33441836	33441744	Y	LTBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	217555	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	33596058	33596304	33596181	Y	RASGRP3	NA	NA	NA	NA	NA	RASGRP3	63087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36584242	36585529	36584872	Y	FEZ2,CRIM1	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	3173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	36603527	36603925	36603600	Y	NA	CRIM1	NA	NA	NA	NA	CRIM1	22458	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	36665586	36666219	36665918	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	84517	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36700444	36700711	36700553	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	119375	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36712578	36712925	36712822	Y	CRIM1,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	131509	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	36713753	36714120	36713762	Y	CRIM1,VIT,FEZ2	NA	NA	NA	NA	NA	CRIM1	132684	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36761840	36762400	36762263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	108830	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36790074	36790520	36790216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	80710	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36790527	36791707	36791646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79523	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	36791809	36792197	36792002	Y	CRIM1	NA	NA	NA	NA	NA	FEZ2	79033	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37103475	37103824	37103655	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRN	87791	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37603882	37604154	37604086	Y	QPCT	QPCT	NA	NA	NA	NA	QPCT	34165	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37853380	37853621	37853410	Y	EIF2AK2,EIF2AK2	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	109990	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37880894	37881162	37881056	Y	EIF2AK2,QPCT,CYP1B1,CDC42EP3	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	82449	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37884022	37884434	37884213	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDC42EP3	79177	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	37938546	37938819	37938725	Y	NA	CDC42EP3	CDC42EP3	IMR90	Hi-C	24141950	CDC42EP3	24792	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	38373682	38374230	38374188	Y	CDC42EP3,CYP1B1	CYP1B1	NA	NA	NA	NA	CYP1B1	38638	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	39722003	39722381	39722147	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4K3	59550	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	40608600	40608944	40608858	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLC8A1	227249	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	40677210	40677858	40677371	Y	NA	NA	LOC100128590	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	158335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	40946753	40946876	40946763	Y	NA	NA	LOC100128590,SLC8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SLC8A1	110560	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	42161610	42162017	42161892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PKDCC	111143	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	43037224	43037999	43037611	Y	NA	NA	THADA,ZFP36L2,LOC100129726,HAAO	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC025750.7	278642	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	47100841	47101015	47100907	Y	NA	TTC7A	NA	NA	NA	NA	TTC7A	40281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	47199058	47199402	47199110	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	32064	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	47213827	47213985	47213928	Y	NA	MCFD2	NA	NA	NA	NA	MCFD2	46833	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	47282124	47282371	47282214	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MCFD2	115130	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	47296749	47297008	47296937	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CALM2	104732	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	48737563	48737807	48737675	Y	STON1-GTF2A1L,STON1	STON1	NA	NA	NA	NA	STON1	16715	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	54801406	54802103	54801693	Y	SPTBN1	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	119984	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	54845847	54845943	54845895	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPTBN1	164425	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	55212013	55212317	55212165	Y	CCDC88A	NA	NA	NA	NA	NA	RTN4	125440	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	55450545	55450658	55450592	Y	CCDC88A,EML6,RTN4	RPS27A,MTIF2	NA	NA	NA	NA	RPS27A	6381	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	60696747	60696946	60696847	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	81756	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	60711222	60711498	60711369	Y	REL	NA	NA	NA	NA	NA	BCL11A	67204	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	62805190	62805410	62805295	Y	NA	NA	EHBP1	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM17	68161	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	64239166	64239247	64239208	Y	PELI1	VPS54	NA	NA	NA	NA	VPS54	4959	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	64352533	64352773	64352693	Y	NA	PELI1	NA	NA	NA	NA	PELI1	16815	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	64879120	64879608	64879340	Y	NA	NA	LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	96531	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	64957479	64957902	64957679	Y	NA	SERTAD2	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	IMR90	Hi-C	24141950	SERTAD2	18237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	64994926	64995226	64995021	Y	SLC1A4,RAB1A,ACTR2,AFTPH,SERTAD2	SERTAD2	SERTAD2	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SERTAD2	18787	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	65093958	65094266	65094153	Y	NA	NA	SERTAD2,AFTPH,LOC339807	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SERTAD2	117819	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	65657861	65658229	65658008	Y	SLC1A4,SPRED2,SPRED2	SPRED2	NA	NA	NA	NA	SPRED2	90	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	67625110	67625487	67625291	Y	ETAA1	ETAA1	NA	NA	NA	NA	ETAA1	2659	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	69481133	69481450	69481229	Y	ANTXR1	NA	NA	NA	NA	NA	GFPT1	130932	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	70144957	70145388	70145176	Y	PCBP1,GMCL1,MXD1,ASPRV1	SNRNP27,MXD1,ASPRV1	NA	NA	NA	NA	MXD1	22137	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	71944095	71944430	71944253	Y	NA	NA	DYSF	IMR90	Hi-C	24141950	DYSF	265243	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	72789461	72789923	72789792	Y	EXOC6B	NA	NA	NA	NA	NA	EXOC6B	261247	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	73338552	73338952	73338867	Y	RAB11FIP5	SFXN5,RAB11FIP5	NA	NA	NA	NA	SFXN5	37805	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	75103488	75103536	75103515	Y	LBX2,HK2	HK2,AC104135.3	NA	NA	NA	NA	AC104135.3	39739	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	85817703	85818016	85817819	Y	VAMP5	GGCX,VAMP5,RNF181,USP39,TMEM150A,C2orf68	NA	NA	NA	NA	RNF181	2832	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	85982713	85983043	85983025	Y	NA	RNU1-38P,ATOH8	NA	NA	NA	NA	ATOH8	6246	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	86225018	86225303	86225260	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	POLR1A	105975	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	86722974	86723324	86723287	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KDM3A	57204	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	87831317	87831559	87831445	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU2-63P	482507	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	91954549	91954973	91954634	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPIA	2965387	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	98822932	98823207	98823080	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM131	212544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	100630312	100630613	100630507	Y	AFF3	NA	NA	NA	NA	NA	CHST10	401505	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	101435496	101435968	101435616	Y	NPAS2	NPAS2	NA	NA	NA	NA	NPAS2	882	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	101922561	101923216	101923063	Y	NA	SNORD89	NA	NA	NA	NA	RNF149	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	102150811	102151152	102151053	Y	RNF149,MAP4K4,MAP4K4	NA	MAP4K4,RFX8,TBC1D8	IMR90	Hi-C	24141950	RFX8	61646	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	105973379	105973614	105973553	Y	NA	TGFBRAP1,C2orf49	NA	NA	NA	NA	C2orf49	21563	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	106008939	106009297	106009286	Y	NA	FHL2	NA	NA	NA	NA	FHL2	43673	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	106761137	106761371	106761251	Y	NCK2	UXS1	NA	NA	NA	NA	UXS1	47424	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	108841436	108841459	108841449	Y	NA	NA	SULT1C2P1	IMR90	Hi-C	24141950	GCC2	221558	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	109209973	109210484	109210252	Y	LIMS1,RANBP2,LIMS1,LIMS1	NA	NA	NA	NA	NA	LIMS1	61116	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	109789769	109790041	109789880	Y	NA	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	45965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	109864376	109864774	109864388	Y	SH3RF3	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	120572	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	110016494	110016637	110016500	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3RF3	272690	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	112251481	112251757	112251540	Y	BCL2L11	MIR4435-1HG	NA	NA	NA	NA	MIR4435-1HG	804	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	114469366	114469830	114469722	Y	SLC35F5	MIR4782,SLC35F5	NA	NA	NA	NA	MIR4782	7115	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	114649026	114649412	114649076	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	3489	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	114652011	114652405	114652035	Y	CBWD2,ACTR3	ACTR3	NA	NA	NA	NA	ACTR3	6474	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	118741787	118742055	118741993	Y	CCDC93	CCDC93	NA	NA	NA	NA	CCDC93	27654	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	121299175	121299329	121299252	Y	NA	NA	RALB,GLI2,INHBB,LOC84931	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLI2	191870	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	121495919	121496279	121496111	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	4720	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	121529153	121529256	121529206	Y	NA	GLI2	GLI2	IMR90	Hi-C	24141950	GLI2	37954	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	121624920	121625080	121625001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLI2	133721	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	128119420	128119722	128119576	Y	NA	MAP3K2	IWS1	IMR90	Hi-C	24141950	MAP3K2	24319	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	128598749	128599093	128599053	Y	IWS1,SFT2D3,AMMECR1L	WDR33,POLR2D	NA	NA	NA	NA	POLR2D	14638	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	131148815	131149203	131148908	Y	FAM123C,FAM123C,FAM123C,CCDC115,PTPN18	PTPN18	NA	NA	NA	NA	PTPN18	37235	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	131828545	131828813	131828794	Y	NA	FAM168B,PLEKHB2	NA	NA	NA	NA	FAM168B	20220	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	133433715	133433886	133433800	Y	NA	LYPD1	NA	NA	NA	NA	LYPD1	6563	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	139112246	139112514	139112380	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	144857	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	139260181	139260311	139260246	Y	SPOPL	SPOPL	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2810	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	139674784	139674842	139674810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	417413	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	141778689	141779072	141778931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOPL	2521318	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	145170356	145170596	145170411	Y	GTDC1,ZEB2	NA	NA	NA	NA	NA	GTDC1	82221	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	145203395	145203816	145203630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZEB2	76331	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	152700971	152701203	152701087	Y	FMNL2,CACNB4	ARL5A	NA	NA	NA	NA	ARL5A	17965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	152930991	152931406	152931212	Y	NA	CACNB4	NA	NA	NA	NA	CACNB4	22187	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	153057173	153057360	153057266	Y	FMNL2	STAM2	FMNL2	IMR90	Hi-C	24141950	STAM2	26667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	157190328	157191531	157191235	Y	GPD2,NR4A2	NR4A2	GPD2	IMR90	Hi-C	24141950	NR4A2	5329	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	158712267	158712700	158712451	Y	ACVR1,ACVR1	ACVR1	NA	NA	NA	NA	ACVR1	17674	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	159996824	159997456	159997123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WDSUB1	143854	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	161155946	161156394	161156280	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MIR4785	105999	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	161348201	161348679	161348535	Y	RBMS1	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	162197345	162197490	162197464	Y	NA	PSMD14,AC009299.5	NA	NA	NA	NA	AC009299.5	1508	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.9659029019307
chr2	163035525	163035776	163035654	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAP	63885	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	168858571	168859104	168858832	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK39	243547	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	171786835	171787228	171786978	Y	TLK1	GORASP2	NA	NA	NA	NA	GORASP2	3861	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	172961367	172961608	172961457	Y	DLX1,DLX2	DLX2	NA	NA	NA	NA	DLX2	4020	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	173116941	173117298	173117012	Y	NA	NA	ITGA6	IMR90	Hi-C	24141950	DLX2	151313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	174963658	174963852	174963755	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP3	135228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	175837054	175837318	175837218	Y	NA	CHN1	NA	NA	NA	NA	CHN1	30779	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	179728570	179728751	179728677	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TTN-AS1	344660	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	183876955	183877317	183877185	Y	NA	NCKAP1	NA	NA	NA	NA	NCKAP1	24269	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	189978697	189979080	189978901	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL5A2	63525	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	190043432	190043827	190043588	Y	DIRC1,COL3A1,COL5A2	COL5A2	NA	NA	NA	NA	COL5A2	827	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	190235497	190235832	190235693	Y	NA	NA	COL5A2,GULP1	IMR90	Hi-C	24141950	WDR75	68327	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191814146	191814507	191814301	Y	STAT1	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	41786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191815156	191815612	191815322	Y	GLS	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	40681	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191826753	191827142	191827070	Y	NA	AC067945.3	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	29151	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191861736	191862119	191861929	Y	NA	AC067945.3,STAT1	NA	NA	NA	NA	AC067945.3	5443	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191984586	191984681	191984634	Y	NA	STAT4	NA	NA	NA	NA	STAT4	29641	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	191992847	191993155	191993001	Y	STAT4	STAT4	NA	NA	NA	NA	STAT4	21167	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	192503383	192503649	192503532	Y	OBFC2A	NA	OBFC2A	K562,IMR90,MCF7	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	SDPR	206332	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	192544982	192545232	192545125	Y	OBFC2A	NA	NA	NA	NA	NA	SDPR	164749	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	196478695	196478993	196478847	Y	NA	SLC39A10	SLC39A10	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC39A10	39994	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	197004793	197005261	197004933	Y	NA	STK17B	NA	NA	NA	NA	STK17B	33966	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	197099483	197099689	197099603	Y	STK17B	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	60256	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	197195800	197196140	197196081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STK17B	156573	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	197466180	197466534	197466307	Y	NA	HECW2,CCDC150	CCDC150,HECW2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HECW2	9764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	200209653	200209909	200209897	Y	SATB2,SATB2,SATB2	NA	NA	NA	NA	NA	SATB2	124080	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	201172384	201172536	201172446	Y	NA	SPATS2L	NA	NA	NA	NA	SPATS2L	3780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	201652202	201652395	201652320	Y	NA	BZW1	BZW1	IMR90	Hi-C	24141950	BZW1	20922	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	201992378	201992654	201992500	Y	BZW1,BZW1,BZW1,CLK1,CLK1,CFLAR,CASP8,CFLAR,CFLAR,CFLAR,CASP10	AC007272.3,CFLAR	NA	NA	NA	NA	CFLAR	13551	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	202723656	202723936	202723797	Y	NA	UBE2V1P11	NA	NA	NA	NA	UBE2V1P11	36385	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	202898182	202898685	202898353	Y	TMEM237,FZD7	FZD7	NA	NA	NA	NA	FZD7	872	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	204311629	204311925	204311741	Y	NBEAL1,CYP20A1,ABI2	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	86208	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	204315265	204315638	204315451	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAPH1	82495	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	204499475	204499823	204499577	Y	NA	NA	ABI2,RAPH1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	101342	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	204548440	204549024	204548878	Y	NA	NA	RAPH1,CD28	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	150307	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	204646981	204647288	204647136	Y	NA	NA	CD28,RAPH1,ABI2,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	248848	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	204672850	204673169	204672900	Y	NA	NA	RAPH1,CD28,NBEAL1,CYP20A1	IMR90	Hi-C	24141950	RAPH1	274717	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	206005178	206005232	206005204	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NRP2	539482	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	207981292	207981447	207981370	Y	NA	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	48544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	208007936	208008436	208008192	Y	METTL21A,METTL21A,KLF7,CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	21555	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	208016492	208017045	208016857	Y	CREB1	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	12946	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	208027980	208028625	208028335	Y	CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	1366	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	208028732	208029438	208029179	Y	METTL21A,CREB1,KLF7	KLF7	NA	NA	NA	NA	KLF7	553	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	208198821	208199856	208199157	Y	KLF7	NA	KLF7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	AC007879.7	96447	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr2	208366657	208366920	208366770	Y	METTL21A,CREB1	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	25541	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	208378687	208378932	208378791	Y	CREB1	CREB1	KLF7,CREB1,METTL21A,CCNYL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CREB1	13529	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216222811	216223009	216222866	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48271	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216223263	216223304	216223303	Y	NA	ATIC	NA	NA	NA	NA	ATIC	48723	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	216290729	216290756	216290730	Y	FN1	FN1,AC012462.1	NA	NA	NA	NA	FN1	8139	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216489283	216489494	216489351	Y	FN1	NA	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	91272	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216522690	216522921	216522813	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	57845	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216558345	216558652	216558547	Y	NA	AC093850.2	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	22114	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	216614389	216614747	216614614	Y	NA	AC093850.2	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	33623	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	216636605	216637052	216636855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	55839	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	216695142	216695306	216695226	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC093850.2	114376	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	217106974	217107312	217107143	Y	TMEM169	NA	NA	NA	NA	NA	AC069155.1	58736	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	217214941	217215065	217215003	Y	NA	AC069155.1,MARCH4	NA	NA	NA	NA	MARCH4	19685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	217443055	217443423	217443239	Y	NA	PSMB3P2	IGFBP2,DIRC3,IGFBP5	IMR90	Hi-C	24141950	PSMB3P2	30259	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	217500633	217500954	217500700	Y	NA	PSMB3P2,IGFBP2	NA	NA	NA	NA	IGFBP2	5082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	217556283	217557311	217557110	Y	NA	IGFBP5	NA	NA	NA	NA	IGFBP5	937	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	218088198	218088590	218088283	Y	NA	NA	DIRC3,IGFBP5,IGFBP2	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP5	529950	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr2	218278062	218278387	218278165	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	587331	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	218736007	218736119	218736065	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	129599	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	218783465	218783740	218783603	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	81978	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	218785631	218785811	218785787	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNS1	79907	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	218839495	218839769	218839643	Y	NA	TNS1	RUFY4,TNS1	IMR90	Hi-C	24141950	TNS1	25949	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	219271996	219272374	219272308	Y	USP37	CTDSP1	NA	NA	NA	NA	CTDSP1	11017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	219434664	219435146	219434778	Y	USP37	USP37,RQCD1	NA	NA	NA	NA	RQCD1	3361	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	222826690	222827411	222827014	Y	NA	NA	EPHA4	IMR90	Hi-C	24141950	PAX3	334304	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	224804297	224804525	224804424	Y	WDFY1	WDFY1,MRPL44	NA	NA	NA	NA	WDFY1	3579	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	225747342	225747583	225747427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DOCK10	157579	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	225905656	225906528	225906251	Y	CUL3,DOCK10	DOCK10	NA	NA	NA	NA	DOCK10	494	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	228253438	228253721	228253534	Y	CCL20,AGFG1	NA	TM4SF20,AGFG1	IMR90	Hi-C	24141950	MFF	65571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	229922941	229923063	229923002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	210938	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	230015685	230015803	230015793	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	118198	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	230273013	230273684	230273347	Y	PID1	NA	NA	NA	NA	NA	PID1	139012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	231348028	231348161	231348095	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SP100	69371	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	232468888	232470128	232469532	Y	DIS3L2,PTMA,NMUR1	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	91838	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	232470282	232470477	232470427	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00471	93232	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	232526700	232527324	232527119	Y	DIS3L2	PTMA	COPS7B,PTMA	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PTMA	42281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	235198516	235198843	235198584	Y	ARL4C	NA	TRPM8,ARL4C	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	204854	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	235311738	235312040	235311967	Y	ARL4C	NA	NA	NA	NA	NA	ARL4C	91657	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	235336071	235336661	235336603	Y	ARL4C	NA	SPP2,TRPM8	IMR90	Hi-C	24141950	ARL4C	67036	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	235959667	235960159	235959834	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SH3BP4	101050	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	236547901	236548387	236548201	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGAP1	147168	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	237073092	237073409	237073337	Y	NA	AC079135.1,GBX2	NA	NA	NA	NA	AC079135.1	681	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.74562508595202
chr2	238018538	238018666	238018550	Y	NA	COPS8	NA	NA	NA	NA	COPS8	26583	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	238066036	238066584	238066320	Y	MLPH,COL6A3	NA	COL6A3,COPS8,MLPH,LRRFIP1	IMR90	Hi-C	24141950	COPS8	74081	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	238292882	238293292	238292932	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	27726	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	238299841	238300132	238300017	Y	COPS8,LRRFIP1,COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	20886	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr2	238317023	238317337	238317240	Y	COPS8,COL6A3	COL6A3,AC112721.1,AC112721.2	NA	NA	NA	NA	COL6A3	3681	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	238508822	238509122	238509050	Y	RAB17,LRRFIP1	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	25097	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr2	238596328	238596696	238596497	Y	LRRFIP1	NA	NA	NA	NA	NA	LRRFIP1	62109	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	238876433	238876638	238876539	Y	LRRFIP1,UBE2F	UBE2F	NA	NA	NA	NA	UBE2F	2964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	239758150	239758505	239758333	Y	NA	TWIST2	NA	NA	NA	NA	TWIST2	3477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr2	241313615	241314182	241313884	Y	NA	NA	GPC1	IMR90	Hi-C	24141950	GPC1	58906	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	241373489	241373922	241373594	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	401	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	241374162	241374480	241374229	Y	GPC1	GPC1	NA	NA	NA	NA	GPC1	1074	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	242267084	242267405	242267274	Y	MTERFD2	SEPT2,HDLBP,FARP2	NA	NA	NA	NA	HDLBP	12608	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr2	242484648	242485001	242484705	Y	NA	STK25,BOK	NA	NA	NA	NA	BOK	11135	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	321375	321752	321587	Y	NA	ZCCHC3,AL034548.1,SOX12,NRSN2,RP5-1103G7.4,TRIB3	NA	NA	NA	NA	NRSN2	3674	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	1332285	1332772	1332374	Y	C20orf46,SDCBP2	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	39034	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	1372355	1372517	1372472	Y	NA	FKBP1A	NA	NA	NA	NA	FKBP1A	549	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	1842464	1842590	1842566	Y	NA	SIRPA	NA	NA	NA	NA	SIRPA	30564	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	3155446	3155862	3155811	Y	EBF4,PTPRA,C20orf194	FASTKD5,UBOX5,DDRGK1,ITPA	NA	NA	NA	NA	UBOX5	16604	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	3200687	3201082	3200885	Y	NA	DDRGK1,ITPA,SLC4A11	NA	NA	NA	NA	ITPA	13173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4045309	4045541	4045432	Y	C20orf27,CENPB,C20orf29	FTLP3	RNF24,PANK2,MAVS	IMR90	Hi-C	24141950	FTLP3	42757	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4065883	4066158	4066005	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,MIR103B2,LOC728228	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SMOX	33469	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4070458	4070670	4070629	Y	PANK2,RNF24,RNF24	SMOX	RNF24,PANK2,MAVS,LOC728228,CDC25B,C20orf29,MIR103B2,SMOX,ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	SMOX	28957	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	4203123	4203484	4203336	Y	NA	ADRA1D	NA	NA	NA	NA	ADRA1D	24237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4443344	4443661	4443503	Y	NA	NA	ADRA1D,PRNP	IMR90	Hi-C	24141950	ADRA1D	215623	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4493607	4493844	4493709	Y	NA	NA	ADRA1D	IMR90	Hi-C	24141950	PRNP	171038	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	4792276	4792776	4792707	Y	SLC23A2,CDS2,RASSF2,RASSF2	RASSF2	NA	NA	NA	NA	RASSF2	9515	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	5589880	5590681	5590650	Y	CDS2,TRMT6,C20orf196,GPCPD1	GPCPD1	NA	NA	NA	NA	GPCPD1	208	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	6684913	6685132	6685035	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FERMT1	582722	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	8464613	8464952	8464618	Y	PLCB1	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB1	353789	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	9065873	9065924	9065899	Y	NA	PLCB4	NA	NA	NA	NA	PLCB4	18463	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	9254416	9254452	9254434	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	207006	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	9390788	9390859	9390825	Y	PLCB4,PLCB4,PLCB4	NA	NA	NA	NA	NA	PLCB4	343378	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	10585324	10585599	10585462	Y	NA	JAG1	NA	NA	NA	NA	JAG1	39415	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	14500869	14501154	14501002	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEL1L2	525780	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	17402450	17402801	17402626	Y	PCSK2,BANF2	NA	NA	NA	NA	NA	DSTN	145707	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	17557154	17557457	17557241	Y	NA	DSTN	NA	NA	NA	NA	DSTN	8646	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	17637776	17637930	17637851	Y	BANF2	RRBP1	NA	NA	NA	NA	RRBP1	23010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	19816564	19816804	19816639	Y	C20orf26	NA	RIN2	IMR90	Hi-C	24141950	RP1-122P22.2	80212	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	23121642	23121836	23121709	Y	THBD,CD93,GZF1,CST3	NA	LOC200261	IMR90	Hi-C	24141950	THBD	93264	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	25218471	25218756	25218634	Y	NA	ENTPD6,PYGB	NA	NA	NA	NA	PYGB	7949	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	25842208	25842444	25842317	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	112354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	25846181	25846562	25846485	Y	ZNF337	NA	NA	NA	NA	NA	RP13-401N8.1	116327	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	30109241	30109638	30109448	Y	HM13	REM1,HM13	NA	NA	NA	NA	HM13	9010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	30300504	30300973	30300648	Y	NA	BCL2L1,TPX2	NA	NA	NA	NA	BCL2L1	8819	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	31063072	31063625	31063366	Y	NA	NA	ASXL1	IMR90	Hi-C	24141950	C20orf112	107251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr20	31410946	31411262	31411169	Y	NA	MAPRE1	NA	NA	NA	NA	MAPRE1	5247	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	32690137	32690399	32690268	Y	NA	EIF2S2,RPS2P1	NA	NA	NA	NA	EIF2S2	7739	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	32803456	32803920	32803688	Y	NA	NA	ITCH,DYNLRB1,ASIP	IMR90	Hi-C	24141950	AHCY	93688	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	32989671	32989803	32989744	Y	NA	ITCH,CDC42P1	NA	NA	NA	NA	CDC42P1	1169	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	34357066	34357356	34357208	Y	NA	RBM39,PHF20	NA	NA	NA	NA	PHF20	540	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	34652590	34653055	34652672	Y	NA	EPB41L1	LOC647979,PHF20,SCAND1,C20orf152,EPB41L1	MCF7,K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	EPB41L1	24371	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	35305263	35305453	35305359	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDRG3	67028	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	36040005	36040428	36040132	Y	VSTM2L,NNAT	NA	NA	NA	NA	NA	SRC	68917	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	36132626	36132893	36132840	Y	NA	NNAT,BLCAP	NA	NA	NA	NA	NNAT	14724	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	37606792	37607147	37606919	Y	NA	DHX35	NA	NA	NA	NA	DHX35	17850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	39091983	39092134	39092059	Y	NA	NA	MAFB	MCF7	ChIA-PET	22265404	MAFB	223746	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	40210012	40210373	40210193	Y	NA	CHD6	NA	NA	NA	NA	CHD6	34760	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	43272135	43272561	43272438	Y	C20orf111,STK4	ADA	NA	NA	NA	NA	ADA	6313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	43689990	43690348	43690045	Y	NA	KCNS1	NA	NA	NA	NA	KCNS1	37405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	45946049	45946481	45946179	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	37086	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	45962816	45963214	45963054	Y	NA	ZMYND8	NA	NA	NA	NA	ZMYND8	20353	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	46653872	46653986	46653882	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	240512	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr20	46700957	46701130	46701044	Y	NA	NA	SULF2	MCF7	ChIA-PET	22265404	SULF2	287597	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	47893075	47893400	47893157	Y	B4GALT5,ZNFX1	ZNFX1	NA	NA	NA	NA	ZNFX1	112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	48190419	48190797	48190608	Y	PTGIS	PTGIS	KCNB1,PTGIS,SLC9A8,B4GALT5,ZNFX1-AS1,ZNFX1	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	7736	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48221158	48221415	48221229	Y	PTGIS	PTGIS	ZNFX1-AS1,ZNFX1,SLC9A8,KCNB1,PTGIS,B4GALT5,SPATA2	IMR90	Hi-C	24141950	PTGIS	38475	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48315836	48316073	48315912	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	12342	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48327368	48328064	48327696	Y	ZNFX1,TMEM189,SNAI1,SLC9A8,RNF114,CEBPB,B4GALT5	B4GALT5	NA	NA	NA	NA	B4GALT5	351	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48876301	48877479	48876571	Y	SLC9A8,RNF114,SNAI1,PTPN1,TMEM189,CEBPB	RP11-290F20.3	PTPN1,LOC284751,FAM65C,PARD6B,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	4544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48951795	48951969	48951898	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-290F20.3	69772	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	48995783	48996016	48995938	Y	NA	NA	LOC284751,PTPN1,MIR645,CEBPB	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-290F20.3	113760	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	49963208	49963745	49963374	Y	NFATC2	NA	KCNG1,ATP9A,NFATC2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNG1	325542	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	49982609	49983533	49983215	Y	KCNG1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNG1	344943	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	50180369	50180507	50180463	Y	NFATC2	NA	NA	NA	NA	NA	ATP9A	202666	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	51110889	51111034	51110969	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFP64	292042	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	52201463	52201802	52201714	Y	ZNF217	ZNF217	NA	NA	NA	NA	ZNF217	22644	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	52355086	52355238	52355182	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	130640	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	52391089	52391563	52391364	Y	NA	NA	ZNF217,BCAS1,SUMO1P1	IMR90	Hi-C	24141950	ZNF217	166643	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	52444580	52444892	52444748	Y	NA	NA	ZNF217,SUMO1P1,BCAS1,BMP7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF217	220134	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	52550838	52551665	52551067	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	270721	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	52565886	52566139	52565988	Y	ZNF217	NA	NA	NA	NA	NA	PFDN4	256247	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	61200879	61201219	61201079	Y	NA	NA	RPS21,C20orf151,CABLES2,C20orf166,C20orf166-AS1,NTSR1,COL9A3,OGFR,C20orf20	IMR90	Hi-C	24141950	CABLES2	220538	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	61267975	61268016	61267996	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OGFR	166171	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	61687989	61688195	61688101	Y	NA	HAR1B	NA	NA	NA	NA	HAR1B	43476	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr20	62150785	62151100	62150943	Y	CHRNA4,KCNQ2,STMN3,EEF1A2	EEF1A2,PPDPF	NA	NA	NA	NA	PPDPF	708	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr20	62494990	62495823	62495679	Y	NA	ZBTB46,TPD52L2,DNAJC5	NA	NA	NA	NA	TPD52L2	394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr21	9881917	9882087	9882000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TEKT4P2	84498	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	17656088	17656430	17656111	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	555744	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	17960667	17961305	17960883	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	USP25	860323	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	28336800	28337144	28336952	Y	ADAMTS1,ADAMTS5	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS5	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	29660800	29661042	29660922	Y	NA	NA	ADAMTS1,ADAMTS5	IMR90	Hi-C	24141950	AF131217.1	384128	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr21	29814932	29815277	29815168	Y	NA	NA	ADAMTS1	IMR90	Hi-C	24141950	AF131217.1	229893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	30374865	30375265	30375125	Y	C21orf7,N6AMT1,LTN1,USP16	LTN1,RPL23P2,RWDD2B,USP16	LTN1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RPL23P2	6511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr21	36174477	36174817	36174756	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	189036	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	36257911	36258724	36258067	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	272470	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	36281882	36282257	36282001	Y	KCNE1,RUNX1,RUNX1	NA	NA	NA	NA	NA	RCAN1	296441	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	37009808	37010026	37009922	Y	NA	NA	RUNX1,CLIC6,LINC00160,LOC100506385	IMR90	Hi-C	24141950	RUNX1	364939	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	38935728	38936411	38936235	Y	TTC3,DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	199636	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr21	38936686	38937128	38936852	Y	DYRK1A,DYRK1A	NA	DSCR3,DSCR9,DYRK1A,KCNJ6	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DYRK1A	200594	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	40393264	40393350	40393326	Y	NA	NA	ETS2,LINC00114	IMR90	Hi-C	24141950	PSMG1	160427	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	43188787	43189188	43188843	Y	RIPK4	RIPK4	NA	NA	NA	NA	RIPK4	3521	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	43372239	43372638	43372317	Y	C2CD2	C2CD2	NA	NA	NA	NA	C2CD2	240	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	43460613	43461088	43460825	Y	C2CD2,SLC37A1	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	88614	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr21	43477244	43477358	43477313	Y	NA	NA	ZNF295,UMODL1,C2CD2	MCF7	ChIA-PET	22265404	C2CD2	105245	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	43500906	43501194	43501017	Y	ABCG1,ABCG1,ABCG1,ABCG1,ZNF295	NA	NA	NA	NA	NA	C2CD2	128907	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	44395482	44395891	44395810	Y	NA	PKNOX1	NA	NA	NA	NA	PKNOX1	2862	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr21	44918002	44918401	44918083	Y	NA	NA	CRYAA,SIK1,HSF2BP,RRP1B	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SIK1	72994	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	45020604	45020960	45020754	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HSF2BP	56414	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr21	45566076	45566451	45566257	Y	TRAPPC10,ICOSLG,C21orf2	PWP2,C21orf33	NA	NA	NA	NA	C21orf33	14589	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	45627966	45628150	45628090	Y	NA	ICOSLG	NA	NA	NA	NA	ICOSLG	30699	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	46097395	46097576	46097539	Y	KRTAP10-7,KRTAP10-12	NA	NA	NA	NA	NA	UBE2G2	122358	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	46836537	46836812	46836569	Y	NA	COL18A1	NA	NA	NA	NA	COL18A1	13485	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	47480637	47481027	47480832	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	COL6A2,FTCD,C21orf56,MCM3AP-AS1,MCM3AP,COL6A1,LSS	IMR90	Hi-C	24141950	COL6A2	34984	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	47512247	47512670	47512489	Y	COL6A1,COL6A2	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	3341	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr21	47554885	47555152	47555043	Y	FTCD	COL6A2	NA	NA	NA	NA	COL6A2	38874	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	18551113	18551402	18551354	Y	NA	MICAL3,PEX26	BID,MICAL3,FLJ41941,PEX26	IMR90	Hi-C	24141950	PEX26	7287	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	19159081	19159242	19159165	Y	NA	DGCR14,SLC25A1	NA	NA	NA	NA	SLC25A1	5101	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr22	19564748	19565059	19564792	Y	CLDN5	NA	HIRA,CLDN5,LOC150185,CLTCL1,UFD1L	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC45	99766	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	19874514	19874924	19874610	Y	TRMT2A,C22orf29,GNB1L	C22orf29,GNB1L,AC000078.5	GNB1L	MCF7	ChIA-PET	22265404	AC000078.5	1702	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	20009239	20009629	20009574	Y	NA	ARVCF	NA	NA	NA	NA	ARVCF	6908	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	24795656	24796304	24795694	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPECC1L-ADORA2A	130790	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	25844657	25845002	25844694	Y	NA	LRP5L,CRYBB2P1	NA	NA	NA	NA	CRYBB2P1	2585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	26462921	26463001	26462961	Y	NA	NA	MYO18B,SEZ6L	IMR90	Hi-C	24141950	SEZ6L	100439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	27109967	27110337	27110138	Y	NA	CTA-211A9.5	MIAT	IMR90	Hi-C	24141950	CTA-211A9.5	43237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	28122669	28123242	28122949	Y	PITPNB,MN1	NA	NA	NA	NA	NA	MN1	72244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	28304832	28305219	28305193	Y	NA	TTC28-AS1,PITPNB	NA	NA	NA	NA	TTC28-AS1	8145	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	28475489	28475734	28475658	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PITPNB	161367	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	32928366	32928835	32928615	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO7	59703	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	33148789	33149121	33148966	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	46566	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	33199078	33199894	33199157	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	3391	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	33202971	33203258	33203149	Y	NA	TIMP3	NA	NA	NA	NA	TIMP3	7284	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	33248825	33249077	33248981	Y	SYN3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	5343	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr22	33265683	33265702	33265692	Y	TIMP3	Z98256.1	NA	NA	NA	NA	Z98256.1	11263	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	35708559	35708961	35708654	Y	APOL6,TOM1,TOM1,HMOX1	TOM1	NA	NA	NA	NA	TOM1	15291	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	36750973	36751374	36751265	Y	APOL3	MYH9,RP4-633O19__A.1	NA	NA	NA	NA	MYH9	30689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	37942064	37942352	37942192	Y	KCTD17,TRIOBP,POLR2F,MICALL1,LGALS1,ANKRD54,CARD10,CDC42EP1	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	12102	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	37942978	37943343	37943114	Y	NA	CARD10,CDC42EP1	ELFN2,CYTH4,CARD10,CDC42EP1,LGALS2,GGA1	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CDC42EP1	11111	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr22	38142899	38142964	38142949	Y	CDC42EP1,LGALS1,TRIOBP,POLR2F,GCAT,ANKRD54	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	51888	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	38143248	38143734	38143618	Y	LGALS1,TRIOBP,POLR2F	NA	NA	NA	NA	NA	TRIOBP	52237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	38148564	38148886	38148725	Y	CDC42EP1	NA	NA	NA	NA	NA	H1F0	50228	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	38599886	38600218	38600032	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	189	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	38601471	38601546	38601509	Y	NA	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	1774	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	38614588	38614867	38614785	Y	MICALL1,TMEM184B,TMEM184B,CSNK1E,MAFF,MAFF	MAFF,PLA2G6	NA	NA	NA	NA	PLA2G6	14891	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	39541576	39542088	39541730	Y	JOSD1,GTPBP1,SUN2,SUN2,APOBEC3G,CBX7	CBX7	NA	NA	NA	NA	CBX7	4591	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	39923809	39924011	39923907	Y	NA	ATF4,RPS19BP1	NA	NA	NA	NA	RPS19BP1	2849	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	40885973	40886127	40886071	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGSM3	121378	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	41048065	41048352	41048232	Y	EP300,MKL1	MKL1,GAPDHP37	ST13,MKL1,MCHR1,ADSL	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	MKL1	17359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr22	41840300	41840792	41840564	Y	NA	TOB2,PHF5A,ACO2	NA	NA	NA	NA	TOB2	235	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr22	43288479	43288908	43288801	Y	NFAM1,PACSIN2,PACSIN2	ARFGAP3	NA	NA	NA	NA	ARFGAP3	36367	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	44541394	44541995	44541679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PARVB	148303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	44705061	44705332	44705192	Y	PARVB,PARVG,PARVG	KIAA1644	NA	NA	NA	NA	KIAA1644	1399	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	44756999	44757252	44757125	Y	NA	NA	KIAA1644,PARVB,LINC00207,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	KIAA1644	50268	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	44947082	44947372	44947286	Y	PARVG,PARVG	NA	PARVB,KIAA1644,SAMM50,LINC00229	IMR90	Hi-C	24141950	LDOC1L	54904	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	45080339	45080681	45080664	Y	PRR5	PRR5,PRR5-ARHGAP8,ARHGAP8	PARVB,KIAA1644,SAMM50	IMR90	Hi-C	24141950	PRR5-ARHGAP8	15432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	46137558	46137905	46137731	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATXN10	71880	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	46464940	46465203	46464976	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	C22orf26	16916	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr22	46467914	46468476	46468052	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	C22orf26	19890	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	46470082	46470656	46470309	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	C22orf26	22058	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	46480881	46481264	46481017	Y	NA	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763,MIRLET7B	NA	NA	NA	NA	MIR4763	26182	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr22	46495432	46495673	46495573	Y	C22orf26	RP6-109B7.3,C22orf26,MIR4763,MIRLET7B,PPARA	NA	NA	NA	NA	MIR4763	11773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	46745093	46745309	46745201	Y	NA	TRMU	NA	NA	NA	NA	TRMU	20321	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	47149923	47150411	47150155	Y	NA	CERK,TBC1D22A	CERK	MCF7	ChIA-PET	22265404	TBC1D22A	6107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	47330872	47331057	47330965	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D22A	174354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	50608010	50608409	50608105	Y	MLC1,MOV10L1,MAPK8IP2,MAPK8IP2,FAM116B,SELO,PANX2	PANX2,TRABD,SELO	NA	NA	NA	NA	PANX2	850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr22	50743986	50744741	50744427	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,CHKB,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr22	50747003	50747284	50747232	Y	PIM3,TRABD,HDAC10,TYMP,TYMP,SCO2,SCO2,ODF3B,PLXNB2	MAPK12,MAPK11,PLXNB2,PPP6R2	NA	NA	NA	NA	PLXNB2	2947	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	4909917	4910799	4910503	Y	ITPR1,EDEM1,BHLHE40,ARL8B	AC018816.3	NA	NA	NA	NA	AC018816.3	16178	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	5036570	5037120	5036867	Y	NA	BHLHE40	NA	NA	NA	NA	BHLHE40	17769	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	8500443	8500771	8500604	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	40622	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	8524896	8525313	8525187	Y	LMCD1	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	16080	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	8544131	8544195	8544133	Y	NA	LMCD1	NA	NA	NA	NA	LMCD1	2738	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	8807929	8808317	8808062	Y	OXTR	OXTR	NA	NA	NA	NA	OXTR	997	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	9050336	9050687	9050476	Y	NA	RAD18	NA	NA	NA	NA	RAD18	46879	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	10157932	10158133	10158106	Y	NA	BRK1,VHL,IRAK2	NA	NA	NA	NA	BRK1	2656	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	10238203	10238635	10238546	Y	ARPC4,VHL,IRAK2,TATDN2	IRAK2,TATDN2	NA	NA	NA	NA	IRAK2	33654	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	11581408	11581480	11581447	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	VGLL4	178740	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	13035460	13035932	13035883	Y	CAND2,IQSEC1,HDAC11,HDAC11,IQSEC1	NA	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	76685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr3	13102024	13102205	13102123	Y	NA	IQSEC1	NA	NA	NA	NA	IQSEC1	10412	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	13493281	13493606	13493395	Y	NA	HDAC11	IQSEC1,NUP210	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HDAC11	25618	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	14167210	14167731	14167391	Y	TMEM43,XPC	CHCHD4,TMEM43	NA	NA	NA	NA	TMEM43	2770	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	15712856	15713111	15712984	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HACL1	71518	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	15780032	15780074	15780052	Y	SH3BP5,EAF1	NA	BTD	IMR90	Hi-C	24141950	ANKRD28	119204	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	16166035	16166390	16166293	Y	GALNTL2	NA	GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	138089	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	16171559	16171808	16171705	Y	GALNTL2	NA	GALNTL2,ANKRD28,BTD,DPH3,OXNAD1	IMR90	Hi-C	24141950	DPH3	132671	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	16351640	16351656	16351648	Y	RFTN1,OXNAD1	DPH3,OXNAD1	NA	NA	NA	NA	OXNAD1	46934	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	16552919	16553213	16553144	Y	NA	RFTN1	NA	NA	NA	NA	RFTN1	320	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	17661435	17661830	17661633	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	822479	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	17913596	17913897	17913750	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D5	570412	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	18580242	18580387	18580280	Y	NA	RAD23BP1	NA	NA	NA	NA	RAD23BP1	2077	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr3	22039046	22039346	22039196	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF385D	373466	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	26688087	26688474	26688152	Y	LRRC3B	NA	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	835437	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	27448460	27448581	27448568	Y	NA	NA	NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	75330	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	27524458	27524952	27524717	Y	NA	SLC4A7	NA	NA	NA	NA	SLC4A7	547	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	27595774	27595869	27595845	Y	NA	NA	SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	SLC4A7	71863	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	27674607	27674970	27674793	Y	NA	AC098614.2	SLC4A7,NEK10	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	2140	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	4.88111126391471
chr3	27719100	27719312	27719216	Y	NA	AC098614.2	NEK10,SLC4A7	IMR90	Hi-C	24141950	AC098614.2	46633	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	29496223	29496522	29496266	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	175750	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	29660032	29660218	29660060	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RBMS3	339559	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	32499535	32499861	32499683	Y	CCR4,CMTM7	CMTM6	NA	NA	NA	NA	CMTM6	43039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	33089398	33089551	33089467	Y	CCR4	SEC13P1,TMPPE,GLB1	NA	NA	NA	NA	SEC13P1	16043	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	38209266	38209592	38209336	Y	VILL,PLCD1,SLC22A14,ACAA1,MYD88,OXSR1	ACAA1,MYD88,OXSR1	NA	NA	NA	NA	OXSR1	4686	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	38568637	38569221	38568871	Y	SCN10A,SCN11A,SLC22A14,EXOG	EXOG	NA	NA	NA	NA	EXOG	33019	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	39193999	39194528	39194467	Y	NA	TTC21A,GORASP1	NA	NA	NA	NA	CSRNP1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	42067110	42067525	42067205	Y	ULK4	TRAK1	TRAK1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAK1	13816	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	43458781	43458976	43458878	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNRK	132777	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	44038399	44038801	44038781	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANO10	307313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	44040259	44040834	44040651	Y	NA	NA	ANO10	IMR90	Hi-C	24141950	ANO10	309173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	8.23687525785607
chr3	44621262	44622718	44622436	Y	NA	ZNF197	NA	NA	NA	NA	ZNF197	1662	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	45686431	45686643	45686512	Y	NA	SACM1L	SACM1L,LOC644714	IMR90	Hi-C	24141950	SACM1L	41905	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	46606309	46606464	46606411	Y	PRSS50,PRSS46,LRRC2	LRRC2	NA	NA	NA	NA	LRRC2	13125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr3	47203467	47203704	47203598	Y	NA	SETD2	NA	NA	NA	NA	SETD2	10	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	47420724	47420876	47420775	Y	NA	PTPN23	NA	NA	NA	NA	PTPN23	223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	47991974	47992099	47992083	Y	CCDC51,ATRIP,SMARCC1,CDC25A	NA	NA	NA	NA	NA	MAP4	136670	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	50664800	50665228	50664999	Y	GNAI2,MAPKAPK3	MAPKAPK3,CISH	NA	NA	NA	NA	CISH	17538	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	51573530	51573858	51573781	Y	VPRBP,RAD54L2	VPRBP	NA	NA	NA	NA	VPRBP	41520	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	53272912	53273168	53273085	Y	TMEM110,PRKCD,DCP1A	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	14900	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	53304049	53304491	53304265	Y	PRKCD,DCP1A,TKT	TKT	NA	NA	NA	NA	TKT	15981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	55178043	55178603	55178498	Y	NA	NA	WNT5A,CACNA2D3	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	343370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	55232673	55232906	55232681	Y	WNT5A	NA	WNT5A,CACNA2D3,ERC2,C3orf51	IMR90	Hi-C	24141950	WNT5A	289067	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	55516458	55517187	55517061	Y	NA	WNT5A	NA	NA	NA	NA	WNT5A	4786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	57960548	57960842	57960815	Y	FLNB	FLNB	ARF4,FLNB	IMR90	Hi-C	24141950	FLNB	31285	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	58035006	58035314	58035102	Y	FLNB	FLNB	NA	NA	NA	NA	FLNB	42879	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	58412465	58412623	58412544	Y	NA	PDHB	NA	NA	NA	NA	PDHB	4961	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	60715683	60716344	60716091	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FHIT	518789	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	61828479	61828865	61828501	Y	PTPRG	NA	NA	NA	NA	NA	RPL10AP6	101699	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	62052710	62052952	62052831	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C3orf14	249696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	64313187	64313399	64313330	Y	PRICKLE2	NA	PRICKLE2	IMR90	Hi-C	24141950	PRICKLE2	115753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	65744738	65744801	65744770	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAGI1	277708	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	66533474	66533812	66533569	Y	NA	LRIG1	NA	NA	NA	NA	LRIG1	15875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	69134869	69134938	69134904	Y	TMF1	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	2774	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	69135158	69135511	69135504	Y	NA	TMF1,UBA3,ARL6IP5	NA	NA	NA	NA	ARL6IP5	3063	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	72977666	72978074	72977791	Y	RYBP	GXYLT2,FTH1P23	NA	NA	NA	NA	FTH1P23	1471	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	73697614	73697785	73697708	Y	NA	PDZRN3	NA	NA	NA	NA	PDZRN3	25523	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	78934560	78934824	78934693	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ROBO1	880141	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	86999128	86999300	86999212	Y	CHMP2B	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	38969	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	87033428	87033764	87033572	Y	VGLL3	VGLL3	NA	NA	NA	NA	VGLL3	4505	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	88367245	88367614	88367269	Y	NA	ABCF2P1	NA	NA	NA	NA	ABCF2P1	2939	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	99235911	99236327	99236128	Y	NA	NA	MIR548G,COL8A1	IMR90	Hi-C	24141950	COL8A1	118992	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	99377938	99378211	99378054	Y	COL8A1	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	22619	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	99378918	99379310	99379024	Y	NA	COL8A1	NA	NA	NA	NA	COL8A1	23599	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	99575221	99575605	99575379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL8A1	219902	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	99944403	99944723	99944568	Y	NA	TBC1D23	C3orf26,MIR548G,TMEM30C,FILIP1L	IMR90	Hi-C	24141950	TBC1D23	33121	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	100244695	100244934	100244873	Y	NA	TMEM45A	NA	NA	NA	NA	TMEM45A	35232	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	100516379	100516430	100516403	Y	ABI3BP	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	90174	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	100519297	100519336	100519310	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFG	93092	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	100630207	100630226	100630217	Y	NA	RP11-301G23.1	NA	NA	NA	NA	RP11-301G23.1	1188	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	101444542	101444901	101444615	Y	FAM55C,FAM55C,CEP97	RPL24,CEP97	NA	NA	NA	NA	CEP97	3773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	105081269	105081374	105081321	Y	ALCAM	ALCAM	NA	NA	NA	NA	ALCAM	2379	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	105395533	105395739	105395657	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	190657	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	105716646	105717231	105716913	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CBLB	130250	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	107657296	107657394	107657308	Y	CD47	NA	NA	NA	NA	NA	CD47	150478	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	112315835	112316301	112316186	Y	NA	SLC35A5,ATG3	NA	NA	NA	NA	ATG3	36942	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr3	112390838	112391135	112390988	Y	CCDC80	CCDC80	NA	NA	NA	NA	CCDC80	24461	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	115503837	115504240	115504182	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	639719	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	115545713	115545826	115545800	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB20	681595	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	119023177	119023412	119023295	Y	NA	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	11957	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	119038073	119038376	119038095	Y	NA	ARHGAP31	NA	NA	NA	NA	ARHGAP31	26853	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	119120015	119120150	119120022	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	65527	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	119146429	119146829	119146680	Y	ARHGAP31,CD80,ADPRH	TMEM39A,POGLUT1	NA	NA	NA	NA	TMEM39A	38848	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	119809073	119809433	119809278	Y	NA	GSK3B,RP11-18H7.1	NA	NA	NA	NA	GSK3B	1831	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	120167583	120167922	120167648	Y	NA	FSTL1	NA	NA	NA	NA	FSTL1	178	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr3	120279186	120279582	120279384	Y	NA	NDUFB4	FSTL1,GPR156,LRRC58,NR1I2,NDUFB4,GTF2E1	IMR90	Hi-C	24141950	NDUFB4	33574	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123324068	123324437	123324253	Y	PTPLB	PTPLB,MYLK-AS1	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	21679	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123356199	123356268	123356234	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	53810	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123376969	123377163	123377136	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	74580	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123391718	123392030	123392015	Y	ADCY5,MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	89329	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123407272	123407514	123407399	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK-AS1	104883	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	123476863	123477567	123477241	Y	MYLK	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	123611	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	123511285	123511578	123511394	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MYLK	89600	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	124535064	124535375	124535191	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	82890	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	124553626	124554125	124554004	Y	KALRN	NA	NA	NA	NA	NA	ITGB5	64140	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	124605050	124605342	124605178	Y	ITGB5	ITGB5	NA	NA	NA	NA	ITGB5	12923	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	124708345	124708776	124708566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HEG1	64026	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	124773884	124774020	124773942	Y	NA	HEG1	NA	NA	NA	NA	HEG1	1082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	126701397	126702091	126701497	Y	PLXNA1	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	280334	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	126702933	126703224	126703109	Y	NA	NA	CHCHD6,PLXNA1	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	CHCHD6	281870	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	126721076	126721245	126721142	Y	PLXNA1	NA	NA	NA	NA	NA	CHCHD6	300013	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	128336521	128336831	128336572	Y	DNAJB8	NA	NA	NA	NA	NA	RPN1	61087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	129436791	129437287	129437073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLXND1	113130	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	134047160	134047394	134047241	Y	ANAPC13,ANAPC13,ANAPC13,AMOTL2	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	16742	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	134051149	134051359	134051254	Y	NA	RP11-200A1.1,RPL39P5,AMOTL2	NA	NA	NA	NA	RP11-200A1.1	20731	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	134181248	134181600	134181434	Y	NA	CEP63,ANAPC13	NA	NA	NA	NA	CEP63	20985	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	139909278	139909663	139909338	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CLSTN2	257251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	141102647	141102881	141102782	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZBTB38	61592	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	141175186	141175511	141175311	Y	NA	RASA2	NA	NA	NA	NA	RASA2	28378	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	141693372	141693614	141693574	Y	TFDP2,TFDP2	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-343B5.1	67426	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	148704982	148705163	148705084	Y	NA	GYG1	HLTF,GYG1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GYG1	1965	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	149265788	149265935	149265852	Y	WWTR1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-278L15.6	55341	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	150089534	150090066	150089791	Y	NA	TSC22D2	TSC22D2,LOC646903,RNF13,PFN2	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TSC22D2	34056	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	152030036	152030551	152030147	Y	MBNL1,MBNL1	MBNL1-AS1	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	44692	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	152091128	152091426	152091240	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MBNL1-AS1	105784	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	156106230	156106626	156106471	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SSR3	164347	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	156506058	156506346	156506123	Y	SSR3	PA2G4P4,LINC00886,LEKR1	NA	NA	NA	NA	PA2G4P4	20175	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	159540179	159540477	159540438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	164060	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	159542121	159542517	159542198	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IL12A	162020	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	167769401	167769602	167769443	Y	NA	GOLIM4	NA	NA	NA	NA	GOLIM4	42161	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	170444418	170445820	170444586	Y	CLDN11,CLDN11,RPL22L1,EIF5A2	NA	CLDN11,SLC7A14,SKIL,PRKCI	IMR90	Hi-C	24141950	RPL22L1	140452	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	170979718	170979982	170979850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	196215	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	171002565	171002750	171002646	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TNIK	173447	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	171820468	171820770	171820540	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FNDC3B	65050	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	171954526	171954782	171954635	Y	FNDC3B,FNDC3B	NA	NA	NA	NA	NA	BZW1P1	188097	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	172377276	172377377	172377327	Y	NA	NCEH1	NA	NA	NA	NA	NCEH1	49631	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	174157357	174157932	174157609	Y	NA	NAALADL2	NAALADL2	IMR90	Hi-C	24141950	NAALADL2	2994	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	177315732	177315915	177315819	Y	NA	NA	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	LINC00578	158023	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	177520137	177520518	177520224	Y	NA	RP11-91K9.1	TBL1XR1	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-91K9.1	12135	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	178978348	178978737	178978528	Y	PIK3CA,MFN1,GNB4	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF639	60042	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr3	179182237	179182507	179182372	Y	NA	GNB4	GNB4	IMR90	Hi-C	24141950	GNB4	14859	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	182645862	182646115	182645990	Y	MCF2L2,MCCC1	NA	NA	NA	NA	NA	DCUN1D1	55626	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	185463229	185463551	185463382	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGF2BP2	77293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	187980692	187981197	187980748	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	111620	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	187983465	187984215	187983993	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	114393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	187984257	187984703	187984570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPP	115185	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	188663292	188663701	188663364	Y	NA	NA	LPP-AS2,LPP,BCL6	IMR90	Hi-C	24141950	LPP	794220	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	188995616	188995876	188995738	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LEPREL1	842350	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	190062904	190063381	190063085	Y	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	CLDN1	LEPREL1,CLDN1,CLDN16	IMR90	Hi-C	24141950	CLDN1	24640	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	190251387	190251779	190251471	Y	CLDN1	IL1RAP	NA	NA	NA	NA	IL1RAP	21547	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	192634153	192634990	192634777	Y	MB21D2	MB21D2	NA	NA	NA	NA	MB21D2	203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	192873675	192873788	192873739	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MB21D2	239725	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	193851636	193853009	193852912	Y	ATP13A3,HES1	NA	NA	NA	NA	NA	HES1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr3	194296552	194296878	194296640	Y	HES1,ATP13A3	TMEM44-AS1	ATP13A3,FLJ34208	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM44-AS1	5862	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr3	194561866	194562021	194561957	Y	FAM43A	NA	LOC100507391,XXYLT1,ACAP2	IMR90	Hi-C	24141950	FAM43A	157244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr3	194925332	194925664	194925571	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XXYLT1	64232	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	1339592	1340250	1339850	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAEA	57953	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	1874737	1875082	1874826	Y	WHSC1	LETM1,WHSC1	NA	NA	NA	NA	WHSC1	3586	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	2537711	2538436	2538089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF4	75764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	3709851	3710272	3710103	Y	NA	NA	LOC100133461	IMR90	Hi-C	24141950	LRPAP1	177565	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	4577048	4577566	4577357	Y	NA	STX18-AS1,STX18	NA	NA	NA	NA	STX18	34975	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	6989470	6989868	6989678	Y	TBC1D14	NA	NA	NA	NA	NA	TADA2B	51758	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	7833117	7833393	7833178	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	106260	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	7846072	7846237	7846145	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	93416	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	7858938	7859554	7859231	Y	AFAP1	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	80099	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	7877911	7878253	7878055	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AFAP1	61400	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	7905982	7906260	7906100	Y	AFAP1	AFAP1	NA	NA	NA	NA	AFAP1	33393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	10182678	10183260	10182921	Y	WDR1	NA	WDR1,CLNK,ZNF518B	K562,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	WDR1	66105	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	12642016	12642195	12642111	Y	NA	RP11-352E6.2	NA	NA	NA	NA	RP11-352E6.2	1755	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	13920582	13920969	13920807	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	288359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	13922430	13922925	13922628	Y	NA	NA	LOC441009,CPEB2,C1QTNF7	IMR90	Hi-C	24141950	AC006445.7	290207	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr4	15488697	15488958	15488934	Y	NA	CC2D2A	NA	NA	NA	NA	CC2D2A	19208	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	15684115	15684561	15684231	Y	FBXL5,FAM200B,BST1	FAM200B,FBXL5,BST1,RP11-115L11.1	NA	NA	NA	NA	FBXL5	2813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	15915213	15915572	15915412	Y	FGFBP1	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-115L11.1	183963	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	16629750	16630155	16629855	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDB2	268277	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	25402341	25402497	25402460	Y	NA	ANAPC4	NA	NA	NA	NA	ANAPC4	25506	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	28621646	28621809	28621725	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-293A21.1	1761425	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	38859134	38859762	38859410	Y	KLF3,KLHL5,TLR1,TLR6	FAM114A1	NA	NA	NA	NA	FAM114A1	7536	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr4	39354929	39355678	39355646	Y	NA	RFC1	WDR19	IMR90	Hi-C	24141950	RFC1	10317	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	40992630	40993044	40992776	Y	APBB2	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	223687	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	40998550	40998604	40998585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	218127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	41100025	41100220	41100123	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	APBB2	116511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	44727575	44727855	44727678	Y	KCTD8,GNPDA2	GUF1,GNPDA2	NA	NA	NA	NA	GNPDA2	963	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	52725801	52726193	52725998	Y	NA	DCUN1D4	NA	NA	NA	NA	DCUN1D4	18635	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	53985720	53986039	53985931	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	244203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	54172916	54173263	54173102	Y	SCFD2	NA	NA	NA	NA	NA	SCFD2	56979	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	54338842	54339193	54339023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FIP1L1	97032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	54794044	54794386	54794192	Y	NA	NA	SCFD2,PDGFRA,CHIC2,FIP1L1,LNX1,RPL21P44,GSX2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	134471	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	54886131	54886730	54886449	Y	GSX2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	42127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	54929171	54929915	54929573	Y	CHIC2	CHIC2	NA	NA	NA	NA	CHIC2	314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	54958023	54958135	54958077	Y	NA	CHIC2	SCFD2,CHIC2	IMR90	Hi-C	24141950	CHIC2	29166	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.05069453994669
chr4	55097338	55097659	55097499	Y	PDGFRA	PDGFRA	NA	NA	NA	NA	PDGFRA	4074	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	57908977	57909199	57909089	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	64729	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	57947514	57947824	57947684	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	26104	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	57960936	57961321	57961171	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7-AS1	12607	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	57985605	57985849	57985767	Y	NA	IGFBP7-AS1,IGFBP7	NA	NA	NA	NA	IGFBP7	11054	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	75183618	75183847	75183685	Y	CXCL3,CXCL2,MTHFD2L,EREG	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	11428	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr4	75187079	75187238	75187159	Y	EPGN	EPGN,EREG	NA	NA	NA	NA	EPGN	14889	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.66083344793603
chr4	77041502	77041599	77041551	Y	NA	NUP54	NA	NA	NA	NA	NUP54	26069	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	78014068	78014466	78014356	Y	CCNG2	CCNI	SHROOM3,CCNG2	IMR90	Hi-C	24141950	CCNI	18910	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	78708574	78708903	78708795	Y	CNOT6L	CNOT6L	NA	NA	NA	NA	CNOT6L	29866	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr4	86684588	86684743	86684670	Y	ARHGAP24	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP24	290321	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	88128179	88128500	88128218	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30966	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	88128695	88128755	88128733	Y	NA	KLHL8	NA	NA	NA	NA	KLHL8	30711	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	89455158	89455345	89455247	Y	NA	HERC3,PIGY	NA	NA	NA	NA	PIGY	14218	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	101977991	101978172	101977999	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EMCN	178708	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	102200557	102200885	102200839	Y	PPP3CA	NA	NA	NA	NA	NA	AP001816.1	66052	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114023484	114023505	114023495	Y	ANK2,ANK2	NA	NA	NA	NA	NA	ANK2	286219	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114355245	114355627	114355568	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	325456	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114367129	114367387	114367298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	313696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114369024	114369155	114369101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	311928	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114390310	114390498	114390393	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	290585	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	114554794	114555018	114554909	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAMK2D	126065	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	117519495	117520605	117520296	Y	NA	ACTN4P1	NA	NA	NA	NA	ACTN4P1	2178	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr4	119756174	119756657	119756269	Y	NA	SEC24D	NA	NA	NA	NA	SEC24D	1181	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr4	119857071	119857382	119857110	Y	SYNPO2	SYNPO2	NA	NA	NA	NA	SYNPO2	49075	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	121010657	121011025	121010845	Y	NA	MAD2L1	NDNF	IMR90	Hi-C	24141950	MAD2L1	24428	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	122611926	122612330	122612120	Y	ANXA5	ANXA5	NA	NA	NA	NA	ANXA5	3938	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	123685251	123685615	123685333	Y	FGF2	CETN4P,BBS12	NA	NA	NA	NA	BBS12	33394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	123776087	123776259	123776177	Y	NA	FGF2	NA	NA	NA	NA	FGF2	30224	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	124621616	124621886	124621708	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPRY1	305666	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	130012970	130013118	130013063	Y	PHF17,SCLT1,C4orf33	C4orf33,SCLT1	NA	NA	NA	NA	SCLT1	206	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	138585739	138585945	138585825	Y	PCDH18	NA	PCDH18	IMR90	Hi-C	24141950	PCDH18	134091	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr4	139173167	139173319	139173175	Y	NA	SLC7A11	SLC7A11	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	SLC7A11	11664	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	140321405	140321719	140321434	Y	ELF2,NAA15,RAB33B	NA	NA	NA	NA	NA	RAB33B	50667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	142196982	142197372	142197125	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF330	56941	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	143186679	143186969	143186824	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	579616	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	143488504	143488630	143488569	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	277955	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	143608710	143609035	143608873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	INPP4B	157550	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	145956046	145956369	145956259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ABCE1	60715	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	146655718	146656086	146655845	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	146656396	146656737	146656614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MMAA	118981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	146725275	146725660	146725360	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	132127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr4	146729401	146729770	146729628	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF827	128017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	148754528	148754793	148754631	Y	PRMT10	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP10	103314	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	152117073	152117218	152117121	Y	FAM160A1,SH3D19	NA	NA	NA	NA	NA	RPS3A	98348	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	154548347	154548481	154548383	Y	KIAA0922,TLR2	NA	NA	NA	NA	NA	TLR2	72171	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	157397521	157397868	157397695	Y	NA	NA	GRIA2,PDGFC,GLRB	IMR90	Hi-C	24141950	PDGFC	492678	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	159460257	159460327	159460293	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	ETFDH	130950	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	159731152	159732543	159732097	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	FNIP2	NA	NA	NA	NA	FNIP2	42862	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	159742407	159742876	159742571	Y	PPID,RAPGEF2,FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	54117	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	159925060	159925429	159925240	Y	FNIP2	NA	NA	NA	NA	NA	FNIP2	236770	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	165882303	165882624	165882495	Y	CPE,C4orf39	RP11-366M4.2,TRIM61	NA	NA	NA	NA	TRIM61	14196	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	170172551	170172946	170172870	Y	NA	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	17310	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	170193381	170193745	170193612	Y	SH3RF1	SH3RF1	NA	NA	NA	NA	SH3RF1	3125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	174443232	174443552	174443433	Y	HAND2	HAND2-AS1,HAND2	NA	NA	NA	NA	HAND2-AS1	2869	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	175263937	175264166	175264013	Y	CEP44,CEP44,FBXO8	NA	NA	NA	NA	NA	FBXO8	60522	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	177191849	177192202	177191988	Y	ASB5	SPCS3,RP11-87F15.2	SPATA4	IMR90	Hi-C	24141950	SPCS3	46913	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	177710943	177711419	177711262	Y	VEGFC	VEGFC	NA	NA	NA	NA	VEGFC	462	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	178112471	178112597	178112534	Y	NA	NA	VEGFC	IMR90	Hi-C	24141950	NEIL3	116393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	181844755	181844937	181844843	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AC108142.1	1219465	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	184256615	184256836	184256706	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	106908	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	184270201	184270461	184270317	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	93283	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	184270914	184271169	184271084	Y	NA	NA	CLDN24,CLDN22	IMR90	Hi-C	24141950	CDKN2AIP	92575	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr4	185321628	185321981	185321757	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	71753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	185338413	185338600	185338537	Y	ACSL1,IRF2	NA	NA	NA	NA	NA	IRF2	55134	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	186306025	186306048	186306047	Y	NA	ANKRD37,UFSP2,C4orf47	NA	NA	NA	NA	ANKRD37	9127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr4	188400076	188400296	188400188	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAT1	754200	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	399875	400445	400189	Y	EXOC3	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	400756	401055	400906	Y	NA	C5orf55,EXOC3	NA	NA	NA	NA	C5orf55	40203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	964244	964536	964396	Y	NKD2	RP11-43F13.3	SLC12A7,TRIP13,BRD9,LOC100506688	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-43F13.3	30887	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	1522529	1522699	1522639	Y	NA	LPCAT1	NA	NA	NA	NA	LPCAT1	437	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	6712873	6713977	6713364	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRD5A1	81417	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.44055563195736
chr5	8843874	8844185	8844159	Y	NA	NA	SEMA5A	IMR90	Hi-C	24141950	SEMA5A	700002	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	9544480	9544834	9544772	Y	SEMA5A	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	168	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	9547741	9548115	9547963	Y	NA	SEMA5A,SNHG18	NA	NA	NA	NA	SNHG18	3429	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	10692588	10692818	10692805	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	66566	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	10733059	10733302	10733226	Y	NA	DAP	NA	NA	NA	NA	DAP	26082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	10996392	10996605	10996573	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	237008	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	11324017	11324157	11324081	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DAP	564633	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	14154284	14154671	14154327	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	12473	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr5	14174472	14174896	14174531	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	32661	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	14185691	14186191	14185984	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	43880	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	14186205	14186627	14186374	Y	TRIO	TRIO	NA	NA	NA	NA	TRIO	44394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	14199302	14199513	14199379	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	57491	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	14264855	14265210	14264930	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	123044	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	14268390	14268821	14268476	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIO	126579	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr5	14404233	14404452	14404428	Y	TRIO	NA	NA	NA	NA	NA	FAM105A	175432	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	14666216	14666664	14666270	Y	FAM105A,FAM105B	EEF1A1P13,FAM105B	NA	NA	NA	NA	FAM105B	3443	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	21539943	21540207	21540075	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GUSBP1	200001	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	25910581	25911176	25910785	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SNORD29	1100991	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr5	32164142	32164348	32164245	Y	ZFR	GOLPH3	NA	NA	NA	NA	GOLPH3	8108	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	32391012	32391652	32391274	Y	SUB1	NA	NA	NA	NA	NA	ZFR	51215	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	33312073	33312323	33312255	Y	NA	CTD-2066L21.3	NPR3,LOC340113	IMR90	Hi-C	24141950	CTD-2066L21.3	16057	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	33442170	33442454	33442303	Y	NA	CTD-2203K17.1,TARS	NA	NA	NA	NA	TARS	3368	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	33834348	33834761	33834680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS12	55536	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	34585438	34585952	34585758	Y	RAI14,RAI14	NA	RAI14	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RAI14	68390	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	34658306	34658537	34658364	Y	RAI14,RAI14	RAI14	TTC23L	IMR90	Hi-C	24141950	RAI14	3964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	34710052	34710312	34710173	Y	RAI14,RAI14	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	55710	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	34715239	34715402	34715248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RAI14	60897	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	36119586	36119746	36119728	Y	SLC1A3,SLC1A3,C5orf33,C5orf33,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	LMBRD2	30317	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	36151218	36151404	36151252	Y	C5orf33,C5orf33,SKP2,LMBRD2	LMBRD2,SKP2	NA	NA	NA	NA	SKP2	1127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	37776965	37777327	37776998	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GDNF	60461	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	39403483	39403837	39403660	Y	NA	C9	NA	NA	NA	NA	C9	19133	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	40796420	40796758	40796693	Y	NA	TTC33,RPL37,CARD6	NA	NA	NA	NA	PRKAA1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	45793437	45793825	45793631	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS30	986410	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	53317506	53317866	53317808	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARL15	286546	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	54751142	54751459	54751301	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNF138P1	73070	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	55289605	55289989	55289924	Y	IL6ST	IL6ST	NA	NA	NA	NA	IL6ST	784	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	59492329	59492580	59492443	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PART1	288960	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	64331292	64332267	64331637	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CWC27	268535	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	64423186	64423354	64423272	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	352393	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	64486221	64486631	64486280	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	289116	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	64505244	64505511	64505327	Y	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	270236	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	64778400	64778738	64778694	Y	NA	ADAMTS6	NA	NA	NA	NA	ADAMTS6	2653	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	67294770	67295126	67294965	Y	PIK3R1	NA	NA	NA	NA	NA	PIK3R1	214422	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	71748206	71748633	71748536	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS27	133733	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	71852712	71853181	71852905	Y	TNPO1	NA	TNPO1,ZNF366,PTCD2	IMR90	Hi-C	24141950	MRPS27	238239	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	73114160	73114455	73114328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANKRA2	254649	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	73611863	73612159	73611974	Y	NA	NA	RGNEF,ENC1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HEXB	321689	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	74997783	74997822	74997793	Y	COL4A3BP,COL4A3BP	POC5	NA	NA	NA	NA	POC5	13491	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	77026226	77026494	77026313	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP2	52211	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	77830052	77831195	77830385	Y	AP3B1,ARSB	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	175713	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr5	77843471	77844086	77843723	Y	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	NA	SCAMP1	189132	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	78095218	78095295	78095257	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	31374	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	78102378	78102749	78102647	Y	NA	LHFPL2	NA	NA	NA	NA	LHFPL2	38534	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	79543086	79543324	79543242	Y	ZFYVE16,SERINC5	SERINC5	NA	NA	NA	NA	SERINC5	6574	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	79768084	79768333	79768119	Y	NA	FAM151B,CTD-2015H6.3,RPL7P24	NA	NA	NA	NA	FAM151B	13455	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	82771448	82771603	82771549	Y	NA	VCAN	NA	NA	NA	NA	VCAN	6164	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	83583813	83583994	83583988	Y	EDIL3	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	94251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	83604677	83605057	83605023	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	73188	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	83652187	83652571	83652379	Y	EDIL3	CTD-2269F5.1,EDIL3	NA	NA	NA	NA	CTD-2269F5.1	25674	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	86619148	86619498	86619336	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	57443	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	86620547	86620785	86620574	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RASA1	58842	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	90604425	90604632	90604611	Y	NA	LUCAT1	GPR98,ARRDC3,LOC100129716	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	LUCAT1	3587	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	95170754	95171173	95170855	Y	GLRX,ELL2	GLRX	RHOBTB3,GLRX,ARSK,RFESD,SPATA9	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	GLRX	14045	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	95295681	95296335	95296056	Y	ELL2	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2337A12.1,ELL2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	97445347	97445652	97445445	Y	NA	NA	FLJ35946,RGMB	IMR90	Hi-C	24141950	CH17-12M21.1	226796	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	99382569	99383254	99382906	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTD-2001C12.1	485712	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	102091646	102092087	102091846	Y	NA	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	3961	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	102121468	102121525	102121497	Y	PPIP5K2	PAM	NA	NA	NA	NA	PAM	33783	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	106967635	106967784	106967710	Y	NA	EFNA5	NA	NA	NA	NA	EFNA5	36812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	111286612	111286649	111286638	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	207574	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	111342511	111342737	111342622	Y	STARD4	NA	NREP,LOC100505678	IMR90	Hi-C	24141950	EPB41L4A-AS1	151486	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	111482049	111482383	111482271	Y	C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13,C5orf13	EPB41L4A-AS1	NA	NA	NA	NA	EPB41L4A-AS1	11840	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	112219334	112219897	112219506	Y	NA	SRP19,REEP5	NA	NA	NA	NA	SRP19	24415	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	113030376	113030581	113030479	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDC2	182996	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	114726097	114726311	114726134	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CCDC112	95569	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	114847596	114847935	114847760	Y	NA	FEM1C	NA	NA	NA	NA	FEM1C	30656	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	114913600	114913827	114913746	Y	NA	FEM1C,TMED7-TICAM2,TICAM2	NA	NA	NA	NA	FEM1C	35009	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	115236990	115237113	115237051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ATG12	61435	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	120609806	120610048	120609927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRFBP1	685608	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	121516793	121517196	121516968	Y	LOX,LOX	NA	NA	NA	NA	NA	LOX	104813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	122108155	122108524	122108401	Y	SNX24,SNX2	SNX2	NA	NA	NA	NA	SNX2	167	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	125730040	125730374	125730276	Y	C5orf48,ALDH7A1,GRAMD3,GRAMD3	GRAMD3	NA	NA	NA	NA	GRAMD3	36216	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr5	131595834	131595951	131595900	Y	KIF3A,PDLIM4	PDLIM4,SLC22A4,P4HA2	NA	NA	NA	NA	PDLIM4	4470	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	131764930	131765294	131765112	Y	NA	C5orf56	IRF1	IMR90	Hi-C	24141950	C5orf56	20602	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	132323487	132323535	132323508	Y	NA	AFF4,ZCCHC10	NA	NA	NA	NA	AFF4	26161	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr5	133863130	133863560	133863438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDKN2AIPNL	117541	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr5	133864116	133864195	133864168	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	118284	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	133891612	133892163	133891823	Y	PPP2CA,UBE2B,SEC24A	NA	NA	NA	NA	NA	SEC24A	90316	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	136450174	136450503	136450334	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTB-1I21.2	258857	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	136795919	136796307	136796181	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPOCK1	135761	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	137799770	137800154	137799916	Y	FAM13B,FAM53C,KDM3B,EGR1	REEP2,EGR1	NA	NA	NA	NA	EGR1	591	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	137827710	137828119	137827817	Y	EGR1	EGR1,ETF1	NA	NA	NA	NA	EGR1	28531	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	137870529	137870619	137870574	Y	FAM53C,KDM3B,ETF1	ETF1,HSPA9	NA	NA	NA	NA	ETF1	6370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	138127302	138127500	138127374	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTNNA1	182646	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	138897527	138897822	138897662	Y	MATR3,MATR3,DNAJC18,PSD2	TMEM173,UBE2D2	DNAJC18,UBE2D2,SLC23A1,SPATA24,PAIP2,C5orf65,TMEM173,ECSCR,CXXC5	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UBE2D2	6194	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	139046727	139046903	139046804	Y	NA	CXXC5	NA	NA	NA	NA	CXXC5	21843	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	139652898	139653497	139653234	Y	SRA1,SLC35A4,HBEGF,CD14,CD14,APBB3,ANKHD1	PFDN1	NA	NA	NA	NA	PFDN1	27209	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	140090601	140091006	140090806	Y	NA	WDR55,HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	1741	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	140098281	140098628	140098472	Y	NA	HARS2,HARS,ZMAT2,VTRNA1-1	NA	NA	NA	NA	VTRNA1-1	9421	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	140888509	140888855	140888756	Y	PCDH12,PCDHGA11,PCDHGA12	PCDHGC3,PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	21701	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	140910138	140910894	140910494	Y	NA	PCDHGC5	NA	NA	NA	NA	PCDHGC5	43330	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	141951806	141951968	141951887	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	195981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	142341115	142341252	142341163	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	193166	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	142384131	142384662	142384553	Y	NR3C1,NR3C1,ARHGAP26	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP26	236182	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	143267812	143268155	143268024	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1,YIPF5	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	280123	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	143300463	143300651	143300509	Y	NA	NA	ARHGAP26,NR3C1	IMR90	Hi-C	24141950	YIPF5	247627	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	143685934	143686297	143686110	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KCTD16	137538	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	145498086	145498488	145498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LARS	61735	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	146378574	146378711	146378699	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL3	508908	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	147266523	147266583	147266553	Y	NA	C5orf46	NA	NA	NA	NA	C5orf46	17518	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	147782971	147782994	147782983	Y	ADRB2,SPINK14,FBXO38	FBXO38	NA	NA	NA	NA	FBXO38	21473	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	148292484	148292904	148292843	Y	NA	NA	SH3TC2,ADRB2,ABLIM3,AFAP1L1	IMR90	Hi-C	24141950	ADRB2	88328	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	148788188	148788451	148788258	Y	NA	MIR143HG,MIR143,MIR145	NA	NA	NA	NA	MIR143HG	3936	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	149339062	149339484	149339111	Y	CSNK1A1,CD74,CD74,SLC26A2,HMGXB3	SLC26A2,HMGXB3,TIGD6	NA	NA	NA	NA	SLC26A2	762	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	149518246	149518623	149518550	Y	NA	PDGFRB	NA	NA	NA	NA	PDGFRB	14812	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	150474739	150475397	150475230	Y	RBM22,DCTN4,DCTN4,C5orf62,TNIP1,SLC36A1,CCDC69	TNIP1	NA	NA	NA	NA	TNIP1	3601	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	150536063	150536329	150536162	Y	ANXA6	ANXA6	NA	NA	NA	NA	ANXA6	620	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	151200780	151201112	151200835	Y	GLRA1	NA	NA	NA	NA	NA	ATOX1	50687	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	155107244	155107656	155107286	Y	NA	NA	PPP1R2P3,TIMD4,SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	SGCD	187698	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr5	155211653	155211669	155211662	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SGCD	83685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	155576717	155577053	155576732	Y	NA	NA	SGCD	IMR90	Hi-C	24141950	SGCD	281363	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	156173032	156173354	156173193	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HAVCR2	394526	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	158438022	158438330	158438136	Y	RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,RNF145,EBF1	NA	NA	NA	NA	NA	EBF1	86439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	168156426	168156708	168156567	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	115109	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	168229147	168229460	168229328	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CTC-575D19.1	187830	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	168527289	168527410	168527350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SLIT3	198723	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	169918518	169918694	169918619	Y	LCP2,KCNMB1	NA	NA	NA	NA	NA	KCNMB1	103837	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	171498342	171498743	171498483	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FBXW11	66465	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	171681735	171682053	171681977	Y	NA	UBTD2	NA	NA	NA	NA	UBTD2	27022	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	171879589	171880295	171879961	Y	SH3PXD2B	SH3PXD2B	NA	NA	NA	NA	SH3PXD2B	62	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172160417	172160946	172160788	Y	ATP6V0E1	DUSP1	ERGIC1,ATP6V0E1,C5orf41,DUSP1,NEURL1B,BNIP1	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	DUSP1	35252	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172228151	172228566	172228394	Y	DUSP1	DUSP1,ERGIC1	DUSP1,ERGIC1,LOC100268168,RPL26L1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ERGIC1	30712	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172308731	172309533	172309021	Y	DUSP1,C5orf41	ERGIC1	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	49453	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172314817	172315056	172314937	Y	DUSP1,C5orf41	NA	NA	NA	NA	NA	ERGIC1	55539	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172350033	172350394	172350214	Y	NA	RPL26L1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	33338	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	172380663	172381064	172380838	Y	ERGIC1,ATP6V0E1	RPL26L1,ATP6V0E1	NA	NA	NA	NA	RPL26L1	2668	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.05069453994669
chr5	172881373	172881649	172881564	Y	CPEB4	NA	LOC285593,STC2,BOD1,CPEB4	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	STC2	126867	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr5	172901872	172902293	172901982	Y	ATP6V0E1	NA	LOC285593,STC2,BOD1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	BOD1	139370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr5	178692524	178692976	178692825	Y	ADAMTS2	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	77455	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr5	178698075	178698460	178698284	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTS2	71971	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	3389811	3390490	3390264	Y	SERPINB6,SLC22A23,C6orf145	NA	NA	NA	NA	NA	SLC22A23	64766	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr6	3749707	3750120	3749911	Y	C6orf145	PXDC1	NA	NA	NA	NA	PXDC1	140	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	3826272	3826513	3826435	Y	C6orf145	FAM50B	SLC22A23,TUBB2B	IMR90	Hi-C	24141950	FAM50B	21107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	4358823	4359231	4358978	Y	CDYL	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	ECI2	224992	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	4582137	4582541	4582469	Y	NA	NA	CDYL,RPP40	IMR90	Hi-C	24141950	CDYL	121852	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	5031190	5031205	5031197	Y	NA	RPP40	RPP40	MCF7	ChIA-PET	22265404	RPP40	28893	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	7157997	7158379	7158000	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RREB1	52167	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	10355646	10355875	10355765	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TFAP2A	62017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	11210069	11210603	11210460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ELOVL2	167522	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	11243333	11243432	11243383	Y	MAK,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	137149	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	11318376	11319012	11318732	Y	TMEM170B,MAK,LOC221710,NEDD9,NEDD9	NA	NA	NA	NA	NA	NEDD9	61569	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	11586757	11587121	11586877	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM170B	50819	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	11921182	11921467	11921322	Y	NA	NA	ADTRP,HIVEP1	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	HIVEP1	85528	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	13302642	13303798	13303216	Y	GFOD1,GFOD1,TBC1D7	TBC1D7	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	23017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	13391107	13391478	13391293	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TBC1D7	64292	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	14211061	14211714	14211398	Y	CD83	NA	JARID2,DTNBP1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	CD83	95189	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	14735052	14735658	14735282	Y	NA	NA	DTNBP1,JARID2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	JARID2	508869	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	16320322	16320626	16320375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GMPR	83511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	16684658	16685097	16684682	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	74272	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	16687739	16687973	16687884	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	71396	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	16694939	16695287	16695185	Y	ATXN1	NA	NA	NA	NA	NA	RP1-151F17.1	64082	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	17033300	17033417	17033356	Y	RBM24	NA	ATXN1,GMPR	IMR90	Hi-C	24141950	RBM24	246160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	17418097	17418389	17418210	Y	NA	CAP2	NA	NA	NA	NA	CAP2	26650	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	17715315	17715544	17715493	Y	NUP153	NUP153	NUP153,KIF13A	IMR90	Hi-C	24141950	NUP153	10659	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	18353568	18353841	18353735	Y	RNF144B	RNF144B	NA	NA	NA	NA	RNF144B	12938	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	20444927	20445761	20445060	Y	MBOAT1	E2F3	NA	NA	NA	NA	E2F3	44529	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	25094713	25094741	25094729	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CMAHP	70052	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr6	26025834	26026125	26026038	Y	BTN2A1,BTN2A1,TRIM38	HIST1H1A,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H3B,HIST1H2AB,HIST1H2BB,HIST1H3C,HIST1H1C	NA	NA	NA	NA	HIST1H4B	354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	26126352	26126787	26126533	Y	HIST1H4H,HIST1H4F,HIST1H3F,HIST1H2BH,HIST1H2AE,HIST1H3A,HIST1H4A,HIST1H4B,HIST1H2AB,HIST1H3C,HIST1H1C,HIST1H2AC,HIST1H4E,HIST1H1E	HFE,HIST1H4C,HIST1H2BC,HIST1H2AC,HIST1H1E,HIST1H2BD	NA	NA	NA	NA	HIST1H2AC	3979	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	27145585	27145720	27145705	Y	FKSG83,ZNF184,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH	HIST1H2BJ,HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2AH,RP11-209A2.1	HIST1H2AG,HIST1H4I,HIST1H2BK,HIST1H2BJ,MIR3143,HIST1H2AH,ZNF184,LOC100131289,HIST1H2AJ,HIST1H4J,HIST1H3H,HIST1H2BM,HIST1H2AI,HIST1H2BL,HIST1H3I,HIST1H4L,HIST1H1B,HIST1H2AL,HIST1H2AM,HIST1H2BO,OR2B2,LOC100507173	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-209A2.1	31303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	27205361	27205470	27205416	Y	NA	RP11-209A2.1	OR2B2,LOC100131289,ZNF184	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-209A2.1	28338	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	28101066	28101269	28101177	Y	OR2B2,ZNF187,ZKSCAN4,ZSCAN16	ZSCAN12P1,ZSCAN16,ZNF192P1	NA	NA	NA	NA	ZSCAN16	10728	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	28710805	28711035	28710922	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM27	178731	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	28782096	28782213	28782183	Y	ZSCAN12,GPX6,SCAND3,OR2J3,OR14J1,OR2W1,OR2B3,TRIM27	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM27	107553	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	30177609	30178061	30177863	Y	NA	TRIM26,HLA-L	NA	NA	NA	NA	TRIM26	1143	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	30453844	30454132	30453996	Y	ZNRD1,TUBB	RANP1,HLA-E	HLA-E	MCF7,K562	ChIA-PET	22265404	HLA-E	1112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	30649746	30650798	30650074	Y	TRIM26,TRIM39,TRIM39,TRIM39-RPP21,HLA-E,IER3,FLOT1,PPP1R10,KIAA1949,KIAA1949	C6orf136,DHX16,PPP1R18,NRM,MDC1,TUBB	NA	NA	NA	NA	PPP1R18	2874	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	31702368	31703528	31702658	Y	HLA-C,HLA-B,TNF,LST1,LST1,LST1,AIF1,AIF1,STK19,SKIV2L,PBX2,NEU1,HSPA1L,HSPA1A,GPSM3,ATF6B,AGPAT1,C6orf47,GPANK1,LY6G5B,ABHD16A,ABHD16A,C6orf25,CLIC1	ABHD16A,DDAH2,CLIC1,MSH5,SAPCD1	NA	NA	NA	NA	CLIC1	2012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	31789672	31790268	31789876	Y	NA	VARS,LSM2,HSPA1A,HSPA1B,C6orf48,SNORD52,NEU1	NA	NA	NA	NA	HSPA1B	3244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr6	35331114	35331538	35331252	Y	PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	22779	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	35337950	35338511	35338285	Y	ZNF76,RPL10A,DEF6,PPARD	PPARD	NA	NA	NA	NA	PPARD	29615	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	36660058	36660307	36660143	Y	FGD2,PXT1,STK38,SRSF3	LAP3P2,CDKN1A	NA	NA	NA	NA	CDKN1A	17753	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	37070053	37070857	37070460	Y	CDKN1A,CDKN1A,TMEM217,TMEM217,TBC1D22B,PIM1,FTSJD2,FGD2	NA	PIM1,PPIL1,TBC1D22B,CPNE5,TMEM217,C6orf89,FGD2	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	65122	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	37093441	37093739	37093580	Y	NA	PIM1	PIM1,PPIL1,FGD2,C6orf89,TMEM217,CPNE5,MTCH1,TBC1D22B,CDKN1A	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PIM1	42240	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	37212541	37212901	37212835	Y	NA	TBC1D22B,TMEM217	NA	NA	NA	NA	TBC1D22B	10647	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	38033139	38033395	38033278	Y	ZFAND3	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND3	247864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	39787581	39787781	39787659	Y	NA	DAAM2	NA	NA	NA	NA	DAAM2	29439	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	39850347	39850811	39850571	Y	NA	MOCS1	NA	NA	NA	NA	MOCS1	49479	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	42420719	42421067	42420926	Y	NA	TRERF1	NA	NA	NA	NA	TRERF1	2930	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	44009201	44009753	44009484	Y	SLC35B2,MRPL14	NA	RSPH9,LOC100132354,POLH,GTPBP2,XPO5,MRPS18A,VEGFA	IMR90	Hi-C	24141950	TMEM63B	82898	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	45392235	45392572	45392528	Y	RUNX2	SUPT3H	NA	NA	NA	NA	SUPT3H	48545	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	52389241	52389494	52389368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	50219	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	52431726	52432083	52432005	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1	IMR90	Hi-C	24141950	TRAM2	7630	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	52438177	52438308	52438243	Y	NA	TRAM2	NA	NA	NA	NA	TRAM2	1405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	52439625	52439825	52439764	Y	TRAM2	NA	NA	NA	NA	NA	TRAM2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	52460126	52460529	52460233	Y	TRAM2	TRAM2	EFHC1,TRAM2,MCM3,ICK,LOC730101	IMR90,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TRAM2	20413	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	57313567	57313842	57313733	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PRIM2	135964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	57561032	57561048	57561040	Y	NA	NA	PRIM2	IMR90	Hi-C	24141950	PRIM2	383429	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	70808594	70808991	70808795	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LMBRD1	303591	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	72598807	72598978	72598957	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC00472	470335	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	73330314	73330844	73330342	Y	NA	KCNQ5	NA	NA	NA	NA	KCNQ5	794	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr6	79773928	79774085	79774072	Y	NA	PHIP	NA	NA	NA	NA	PHIP	11868	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	80663174	80663336	80663221	Y	NA	ELOVL4,TTK	NA	NA	NA	NA	ELOVL4	7877	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	83893224	83893469	83893362	Y	RWDD2A,PGM3,PGM3	RWDD2A,PGM3	NA	NA	NA	NA	RWDD2A	7629	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	86114496	86114829	86114663	Y	NT5E	NT5E	NT5E,SNX14	IMR90	Hi-C	24141950	NT5E	42980	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	86174491	86174911	86174693	Y	NA	NT5E	NA	NA	NA	NA	NT5E	16682	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	89315918	89316052	89315985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACTBP8	331210	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	90695509	90695956	90695679	Y	BACH2,BACH2	NA	NA	NA	NA	NA	CASP8AP2	157896	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	101211686	101211775	101211752	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASCC3	115473	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	106048262	106048533	106048347	Y	NA	NA	PRDM1,ATG5	IMR90	Hi-C	24141950	PREP	199303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	108883670	108884545	108884024	Y	OSTM1,FOXO3,FOXO3	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	4632	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	108895400	108895781	108895496	Y	NA	FOXO3	NA	NA	NA	NA	FOXO3	16362	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	109100819	109101213	109100913	Y	FOXO3	NA	NA	NA	NA	NA	ARMC2	66406	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr6	111614404	111614762	111614615	Y	NA	KIAA1919	NA	NA	NA	NA	KIAA1919	35853	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	111841823	111842197	111842010	Y	NA	TRAF3IP2-AS1,REV3L	NA	NA	NA	NA	REV3L	38905	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	121758280	121758805	121758450	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	3442	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	121759226	121759877	121759689	Y	GJA1	GJA1	NA	NA	NA	NA	GJA1	4388	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	125335634	125335813	125335724	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-510H23.1	53449	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	125420883	125421200	125421024	Y	NA	TPD52L1	NA	NA	NA	NA	TPD52L1	16995	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	125622252	125622475	125622321	Y	NA	HDDC2	NA	NA	NA	NA	HDDC2	970	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	127892310	127892704	127892511	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	229556	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	127981338	127981402	127981371	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ECHDC1	318584	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	128793943	128794334	128794205	Y	NA	PTPRK	NA	NA	NA	NA	PTPRK	45536	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	129855341	129855708	129855581	Y	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	173662	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	130030425	130030727	130030721	Y	ARHGAP18	ARHGAP18	NA	NA	NA	NA	ARHGAP18	1055	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	130342212	130342458	130342393	Y	SAMD3,SAMD3,L3MBTL3	L3MBTL3	NA	NA	NA	NA	L3MBTL3	9368	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	132474362	132474724	132474477	Y	NA	LINC01013	NA	NA	NA	NA	LINC01013	23307	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	134742048	134742399	134742278	Y	SGK1,SGK1	NA	SGK1,LOC154092,ALDH8A1	IMR90	Hi-C	24141950	SGK1	104798	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr6	135352829	135352991	135352910	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HBS1L	69203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	136336050	136336507	136336258	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	BCLAF1	272482	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	139350632	139351255	139350885	Y	NA	REPS1	NA	NA	NA	NA	REPS1	43234	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	139656661	139656994	139656829	Y	NA	CITED2	ECT2L,TXLNB,HECA,REPS1	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	36763	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	140400470	140400745	140400517	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	706713	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	140858869	140859245	140859045	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1165112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	140926275	140926589	140926526	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CITED2	1232518	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	140984884	140985153	140985121	Y	NA	NA	LOC100132735	IMR90	Hi-C	24141950	CITED2	1291127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	9.15208361984008
chr6	143130260	143130659	143130530	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	133679	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	143178456	143178847	143178800	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	85491	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	143206296	143206927	143206703	Y	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	57411	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr6	143247398	143248213	143248022	Y	HIVEP2	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	16125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	143248323	143248614	143248469	Y	NA	HIVEP2	NA	NA	NA	NA	HIVEP2	15724	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	143516746	143517148	143516792	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AIG1	137113	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	144007310	144007644	144007477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHACTR2	151328	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	144064569	144064840	144064663	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LTV1	97641	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	144283965	144283971	144283968	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	144284201	144284585	144284512	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAGL1	99150	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	146867560	146867942	146867733	Y	RAB32	RAB32	NA	NA	NA	NA	RAB32	4731	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	147235088	147235549	147235197	Y	RAB32,STXBP5	NA	NA	NA	NA	NA	STXBP5	288012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	148588961	148589218	148589102	Y	UST	NA	SASH1	IMR90	Hi-C	24141950	UST	477246	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr6	148651197	148651450	148651307	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	UST	415014	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	148776437	148776705	148776588	Y	SASH1	NA	NA	NA	NA	NA	UST	289759	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	148834877	148835159	148834957	Y	UST	NA	NA	NA	NA	NA	UST	231305	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr6	149081701	149082266	149082198	Y	UST	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15237	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	149082428	149082821	149082685	Y	NA	UST	NA	NA	NA	NA	UST	15964	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	149290876	149291114	149290995	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UST	224412	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	151178746	151179109	151178841	Y	NA	MTHFD1L	NA	NA	NA	NA	MTHFD1L	5576	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	152497154	152497169	152497162	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	459767	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	152583976	152584217	152584151	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	372719	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	152634983	152635621	152635105	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNE1	321315	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	157542479	157542718	157542566	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM242	199915	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158136804	158137189	158136890	Y	NA	NA	TMEM242,SNX9,ZDHHC14	IMR90	Hi-C	24141950	SNX9	105107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158254729	158255396	158255020	Y	NA	SNX9	NA	NA	NA	NA	SNX9	12433	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158314373	158314686	158314419	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SNX9	72077	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158452388	158452885	158452569	Y	SNX9	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	51500	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158464788	158465005	158464892	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	63900	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158472000	158472226	158472116	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	71112	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158478416	158478907	158478642	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYNJ2	77528	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	158981403	158981866	158981661	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DYNLT1	81905	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr6	166967000	166967189	166967118	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SFT2D1	212921	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	169475360	169475647	169475438	Y	THBS2	NA	WDR27,PHF10,FAM120B	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-417E7.1	85372	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr6	170054470	170055295	170054892	Y	TCTE3	WDR27,C6orf120	NA	NA	NA	NA	WDR27	44864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr6	170600439	170600921	170600644	Y	NA	FAM120B	NA	NA	NA	NA	FAM120B	2648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	1553000	1553189	1553120	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK	MICALL2,INTS1	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	INTS1	9511	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	1572262	1572844	1572636	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	3912	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr7	1573524	1573718	1573598	Y	ZFAND2A,MAFK	INTS1,MAFK,PSMG3-AS1,PSMG3	NA	NA	NA	NA	MAFK	5174	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	1970944	1971123	1971068	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	299755	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	2058424	2058871	2058630	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MAD1L1	212007	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	5596196	5596581	5596543	Y	CCZ1,ACTB	FBXL18,ACTB,FSCN1	RNF216,FBXL18,TNRC18	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ACTB	4834	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	5733172	5733453	5733321	Y	CCZ1,USP42,RNF216	NA	NA	NA	NA	NA	RNF216	85917	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	6677371	6677641	6677424	Y	DAGLB,ZNF12,C7orf26	C7orf26,ZNF316	NA	NA	NA	NA	ZNF316	2418	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	17029591	17029925	17029620	Y	NA	NA	AHR	IMR90	Hi-C	24141950	TSPAN13	238431	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	17721637	17721811	17721724	Y	NA	NA	HDAC9,AGR2,AHR	IMR90	Hi-C	24141950	SNX13	256313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	19024350	19024628	19024489	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TWIST1	130667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	19157963	19158297	19158271	Y	NA	TWIST1	NA	NA	NA	NA	TWIST1	2668	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	22484182	22484549	22484368	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EEF1A1P6	65069	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	22757674	22758207	22757934	Y	NA	IL6	NA	NA	NA	NA	IL6	5296	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	22894313	22894860	22894668	Y	STEAP1B,TOMM7	TOMM7,AC005682.5	NA	NA	NA	NA	AC005682.5	2516	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	23229571	23229876	23229614	Y	NA	NUPL2,GPNMB	NA	NA	NA	NA	NUPL2	10125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	24772828	24773057	24772934	Y	DFNA5,DFNA5	DFNA5	NA	NA	NA	NA	DFNA5	34187	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	25064852	25065012	25064919	Y	NA	OSBPL3	OSBPL3	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	OSBPL3	45599	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr7	28180762	28180941	28180859	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	37421	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	28190212	28190323	28190268	Y	NA	JAZF1	NA	NA	NA	NA	JAZF1	28039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	28450839	28451193	28451101	Y	CREB5	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	113899	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	28520361	28520389	28520375	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB5	183421	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	30005426	30005693	30005606	Y	NA	SCRN1	NA	NA	NA	NA	SCRN1	22212	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	31929944	31930221	31930100	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	406720	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	31985831	31986192	31986012	Y	PDE1C,PDE1C,PDE1C	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	350749	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	32090584	32090879	32090675	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PDE1C	246062	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	33943577	33943776	33943645	Y	NA	BMPER	NA	NA	NA	NA	BMPER	1054	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	36331807	36331936	36331811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ANLN	95479	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	36843340	36843728	36843600	Y	ELMO1	NPM1P18	NA	NA	NA	NA	NPM1P18	12836	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	40088776	40089159	40088837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	101140	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	40509167	40509371	40509279	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	521531	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	40584238	40584551	40584395	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CDK13	596602	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	40938770	40939089	40938937	Y	NA	NA	C7orf10,LOC285954,INHBA	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	801617	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	41738328	41738691	41738507	Y	INHBA	INHBA	NA	NA	NA	NA	INHBA	2015	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	41908728	41909092	41908898	Y	INHBA	NA	LOC285954,C7orf10	IMR90	Hi-C	24141950	INHBA	168022	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	43115932	43116315	43116148	Y	NA	HECW1	HECW1,MRPL32,PSMA2	IMR90	Hi-C	24141950	HECW1	33883	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr7	43654812	43655175	43654945	Y	POLM,DBNL,STK17A,URGCP	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	34455	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	43659947	43660692	43660336	Y	DBNL,STK17A	STK17A	NA	NA	NA	NA	STK17A	39590	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	44677628	44678244	44677873	Y	ZMIZ2,ZMIZ2,PURB,MYO1G,OGDH	OGDH	ZMIZ2	IMR90	Hi-C	24141950	OGDH	33457	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	44936968	44937252	44937141	Y	OGDH,MYO1G,PURB	PURB	TBRG4,OGDH	IMR90	Hi-C	24141950	PURB	14008	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	46186122	46186484	46186177	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	226649	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	46186512	46186858	46186578	Y	IGFBP3	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	227039	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	46385021	46385087	46385052	Y	NA	NA	IGFBP3	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBP3	425548	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	47514732	47515208	47514929	Y	TNS3	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	104948	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	47521562	47522093	47521877	Y	HUS1	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	98063	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	47553531	47553930	47553845	Y	C7orf65	NA	NA	NA	NA	NA	TNS3	66226	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	47611156	47611689	47611507	Y	C7orf69,TNS3	TNS3	NA	NA	NA	NA	TNS3	8467	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55132578	55133258	55132929	Y	SEC61G,EGFR	EGFR	NA	NA	NA	NA	EGFR	47864	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	55155188	55155533	55155358	Y	EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	70474	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55200352	55201043	55200686	Y	SEC61G,EGFR	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	115638	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55201472	55201858	55201601	Y	SEC61G	NA	NA	NA	NA	NA	EGFR	116758	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55529793	55530311	55530129	Y	ZNF713,VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	LANCL2	98652	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55542922	55542955	55542935	Y	VOPP1	NA	NA	NA	NA	NA	VOPP1	95726	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	55635235	55635573	55635336	Y	NA	VOPP1	NA	NA	NA	NA	VOPP1	3108	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	56013517	56013601	56013542	Y	ZNF713	GBAS,MRPS17	NA	NA	NA	NA	GBAS	3885	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	66056218	66056609	66056384	Y	NA	KCTD7	KCTD7	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	KCTD7	35259	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	66120269	66120628	66120390	Y	RABGEF1,KCTD7	KCTD7,RP4-756H11.3,RABGEF1	NA	NA	NA	NA	RP4-756H11.3	2744	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	69091011	69091330	69091153	Y	NA	AUTS2	NA	NA	NA	NA	AUTS2	29106	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	69215481	69215818	69215531	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AUTS2	153576	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	73156040	73156347	73156148	Y	NA	STX1A,ABHD11	NA	NA	NA	NA	ABHD11	4843	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	73314080	73314324	73314199	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WBSCR27	59215	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	73443567	73443942	73443908	Y	CLIP2,ELN	ELN	NA	NA	NA	NA	ELN	3448	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	73547862	73548178	73548020	Y	NA	EIF4H	NA	NA	NA	NA	EIF4H	38397	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	73694024	73694283	73694118	Y	LAT2	RFC2,CLIP2	CLIP2	IMR90	Hi-C	24141950	CLIP2	7522	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	73897037	73897256	73897156	Y	NA	GTF2IRD1	NA	NA	NA	NA	GTF2IRD1	30917	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	75291375	75291448	75291402	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIP1	74832	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	75354773	75355120	75354947	Y	NA	HIP1	NA	NA	NA	NA	HIP1	11160	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	75926781	75926853	75926816	Y	HSPB1	HSPB1	NA	NA	NA	NA	HSPB1	3008	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	77199277	77199536	77199359	Y	FGL2,PION,PTPN12,PTPN12	PTPN12	NA	NA	NA	NA	PTPN12	34685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	77908468	77908642	77908513	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PHTF2	482346	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	89872159	89872438	89872340	Y	NA	C7orf63	NA	NA	NA	NA	C7orf63	50	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	90253502	90253813	90253671	Y	NA	NA	CDK14	IMR90	Hi-C	24141950	CDK14	159764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	92463754	92464079	92463922	Y	CDK6,CDK6	NA	NA	NA	NA	NA	AC002454.1,CDK6	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	93807342	93807859	93807675	Y	NA	NA	GNG11,TFPI2,GNGT1,BET1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	157197	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	93812688	93813130	93812921	Y	NA	NA	TFPI2,BET1,GNGT1	IMR90	Hi-C	24141950	AC003092.1	162543	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	93926616	93927074	93926886	Y	SGCE,COL1A2	NA	COL1A2,GNG11	IMR90	Hi-C	24141950	COL1A2	94799	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	94004729	94005413	94005273	Y	NA	COL1A2	NA	NA	NA	NA	COL1A2	16460	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	94021237	94021945	94021560	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COL1A2	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr7	94280099	94280356	94280228	Y	NA	SGCE,PEG10	NA	NA	NA	NA	SGCE	3165	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	97915595	97916070	97915699	Y	LMTK2,BRI3	TECPR1,BRI3	NA	NA	NA	NA	BRI3	35904	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	98739351	98739615	98739543	Y	NA	SMURF1	NA	NA	NA	NA	SMURF1	108	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	98973055	98973209	98973129	Y	ZNF655,ZNF655,ZNF394,ARPC1B	ARPC1B,BUD31,PDAP1	NA	NA	NA	NA	ARPC1B	3183	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	100761754	100762006	100761835	Y	NA	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	AP1S1,VGF	MCF7	ChIA-PET	22265404	SERPINE1	6364	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	100772573	100772742	100772614	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4203	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	100772917	100773243	100773005	Y	SERPINE1	TRIM56,SERPINE1,AP1S1	NA	NA	NA	NA	SERPINE1	4547	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	101929978	101930313	101930074	Y	CUX1,CUX1,CUX1,PRKRIP1,ORAI2,LRWD1,ALKBH4,SH2B2	NA	NA	NA	NA	NA	PRKRIP1	72006	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr7	103277543	103277794	103277680	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DNAJC2	294223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	104597631	104597869	104597756	Y	MLL5	NA	NA	NA	NA	NA	LINC01004	53622	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	104907808	104907896	104907852	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SRPK2	129859	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	107109276	107109645	107109473	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	92284	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	107136125	107136576	107136361	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	65353	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	107142222	107142266	107142244	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DUS4L	59663	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	107567511	107567568	107567540	Y	NA	DLD	NA	NA	NA	NA	DLD	38096	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	107644827	107645024	107644950	Y	LAMB1	LAMB1	NA	NA	NA	NA	LAMB1	3127	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	110470494	110470759	110470627	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	258303	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	110808410	110808626	110808556	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LRRN3	79348	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	114018736	114018896	114018817	Y	FOXP2	NA	NA	NA	NA	NA	FOXP2	294354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	115849891	115849987	115849939	Y	NA	TES	NA	NA	NA	NA	TES	1344	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	116081825	116082043	116081830	Y	NA	NA	TES,CAV2,CAV1,MET	IMR90,MCF7,HELA	Hi-C,ChIA-PET,5C	24141950,22265404,22955621	CAV1	80796	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	116168216	116168790	116168273	Y	CAV2,CAV2,CAV1,CAV1,CAV1,CAV1	CAV1	NA	NA	NA	NA	CAV1	5377	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	116217100	116217359	116217210	Y	CAV1,CAV1	NA	NA	NA	NA	NA	CAV1	54261	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	116504290	116504456	116504319	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CAPZA2	55166	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	116595969	116596160	116596016	Y	NA	ST7,ST7-AS1	NA	NA	NA	NA	ST7-AS1	3581	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	123387168	123387479	123387315	Y	NA	WASL	NA	NA	NA	NA	WASL	47	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	126214480	126214602	126214539	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZNF800	855376	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	128170830	128171695	128171212	Y	NA	RP11-212P7.1	IMPDH1,HILPDA,METTL2B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-212P7.1	37047	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr7	128249599	128249637	128249625	Y	NA	RP11-212P7.1	FLJ45340,CALU,FAM71F1,IRF5	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-212P7.1	40857	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	128473236	128473666	128473355	Y	FLNC	CCDC136,FLNC,ATP6V1F	NA	NA	NA	NA	FLNC	4805	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	130575591	130576512	130576394	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	19557	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	130586004	130586434	130586371	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	9635	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	130589567	130590049	130589961	Y	NA	MIR29A	MIR29A,MIR29B1	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6020	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	130602337	130602820	130602733	Y	MKLN1,MKLN1	MIR29A	FLJ43663	IMR90	Hi-C	24141950	MIR29A	6268	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	130636331	130636776	130636707	Y	MKLN1	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	40262	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	130644314	130644883	130644570	Y	NA	MIR29A	NA	NA	NA	NA	MIR29A	48245	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	130875085	130875581	130875276	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LINC-PINT	82150	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	134247089	134247493	134247269	Y	LRGUK	NA	NA	NA	NA	NA	BPGM	82067	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	134469498	134469802	134469635	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	42495	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr7	134475089	134475514	134475151	Y	CALD1	CALD1	NA	NA	NA	NA	CALD1	48086	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	134498976	134499173	134499074	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	71973	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr7	134540961	134541304	134541061	Y	CALD1	NA	NA	NA	NA	NA	CALD1	113958	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr7	134555607	134555837	134555722	Y	CALD1,STRA8	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	113422	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	134571220	134571518	134571300	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	AGBL3	97741	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	135443440	135443607	135443468	Y	FAM180A	FAM180A	C7orf73,SLC13A4	IMR90	Hi-C	24141950	FAM180A	11846	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	136582219	136582518	136582369	Y	NA	CHRM2	NA	NA	NA	NA	CHRM2	30803	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	136900611	136900746	136900679	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PTN	125865	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	137387266	137387617	137387499	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	297196	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	137573369	137573542	137573460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CREB3L2	111271	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	139365521	139365926	139365718	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	HIPK2	109651	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	140880261	140880624	140880319	Y	LOC100131199	NA	NA	NA	NA	NA	MRPS33	167233	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	143083267	143084129	143083354	Y	TAS2R40,FAM131B,FAM131B	AC093673.5,ZYX	NA	NA	NA	NA	ZYX	7094	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	148684338	148684706	148684475	Y	NA	PDIA4	NA	NA	NA	NA	PDIA4	39027	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	148788414	148788490	148788418	Y	CUL1,ZNF786,ZNF425,ZNF398	ZNF786,ZNF425,ZNF398	NA	NA	NA	NA	ZNF786	2540	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	150944094	150944397	150944255	Y	NA	ABCF2,CHPF2,SMARCD3	NA	NA	NA	NA	CHPF2	16519	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr7	151198552	151198933	151198803	Y	AGAP3,PRKAG2,PRKAG2	RHEB	CRYGN	IMR90	Hi-C	24141950	RHEB	16273	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr7	152065077	152065428	152065152	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	XRCC2	305822	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	2418829	2418999	2418939	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARHGEF10	648687	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	11312887	11313950	11313920	Y	NA	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	16274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	11314255	11315026	11314813	Y	XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	15198	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	11322358	11322501	11322433	Y	NEIL2,XKR6,MTMR9,FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7723	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	11322764	11323135	11322939	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	7089	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	11337266	11337614	11337440	Y	FAM167A	FAM167A	C8orf12,BLK	IMR90	Hi-C	24141950	FAM167A	7042	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr8	11368445	11368737	11368558	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	38221	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	11373324	11373814	11373559	Y	FAM167A	FAM167A	NA	NA	NA	NA	FAM167A	43100	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	18585215	18585382	18585299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PSD3	354858	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	19266409	19266742	19266623	Y	CSGALNACT1	NA	NA	NA	NA	NA	SH2D4A	97281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	19436473	19436611	19436572	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CSGALNACT1	176929	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	21867707	21867918	21867811	Y	PHYHIP,LGI3,EPB49,EPB49,NPM2	NA	NA	NA	NA	NA	FAM160B2	76752	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	22048643	22048944	22048828	Y	DOK2	BMP1	NA	NA	NA	NA	BMP1	28394	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr8	22240884	22241560	22241218	Y	C8orf58	SLC39A14	NA	NA	NA	NA	SLC39A14	18122	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	23138717	23138953	23138815	Y	LOXL2	CHMP7,R3HCC1	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	13084	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	23184959	23185020	23184990	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	59326	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	23202733	23203217	23203148	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	R3HCC1	77100	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	23203813	23204244	23204131	Y	LOXL2	NA	NA	NA	NA	NA	LOXL2	76597	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	26466894	26467238	26467101	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DPYSL2	97103	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr8	26498541	26498935	26498595	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-384C12.1	128372	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr8	27076185	27076260	27076223	Y	EPHX2,ADRA1A	NA	NA	NA	NA	NA	TRIM35	90576	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	28258528	28258941	28258737	Y	HMBOX1,HMBOX1	ZNF395	ZNF395,FBXO16	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZNF395	310	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	28269273	28269920	28269515	Y	ZNF395	ZNF395	NA	NA	NA	NA	ZNF395	11055	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr8	28785346	28785716	28785529	Y	NA	INTS9,HMBOX1	NA	NA	NA	NA	HMBOX1	39435	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	29419877	29419995	29419892	Y	KIF13B	NA	DUSP4,LOC286135,C8orf75	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	DUSP4	213692	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	29533274	29533303	29533292	Y	NA	NA	DUSP4	IMR90	Hi-C	24141950	DUSP4	327089	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	33071283	33071444	33071366	Y	NA	NA	NRG1	IMR90	Hi-C	24141950	FUT10	257496	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	35382808	35383133	35382968	Y	NA	LSM12P1	NA	NA	NA	NA	LSM12P1	1527	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr8	37002327	37002551	37002443	Y	NA	NA	KCNU1,PROSC,ZNF703,ERLIN2,LOC728024,GPR124	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-150O12.1	407150	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	42053833	42054135	42053951	Y	NA	AP3M2,PLAT	NA	NA	NA	NA	PLAT	9107	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	42270426	42270603	42270558	Y	NA	VDAC3	NA	NA	NA	NA	VDAC3	23284	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	48293270	48293403	48293337	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NDUFA5P12	218777	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	48513197	48513620	48513373	Y	KIAA0146,CEBPD	NA	NA	NA	NA	NA	CEBPD	136028	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	49344700	49344905	49344800	Y	NA	RPL29P19	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	49550	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	49426952	49427328	49427172	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	131802	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	49427546	49427722	49427633	Y	SNAI2	NA	SNAI2	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	132396	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	49495721	49496077	49496032	Y	SNAI2	NA	SNAI2,EFCAB1	IMR90	Hi-C	24141950	RPL29P19	200571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	54932125	54932445	54932251	Y	NA	TCEA1	NA	NA	NA	NA	TCEA1	644	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	56744320	56744391	56744354	Y	TGS1	LYN	NA	NA	NA	NA	LYN	45981	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	58908204	58908269	58908237	Y	NA	FAM110B	NA	NA	NA	NA	FAM110B	3136	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	59470194	59470547	59470220	Y	NA	SDCBP	NA	NA	NA	NA	SDCBP	6711	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	59529081	59529390	59529262	Y	SDCBP	NSMAF	NA	NA	NA	NA	NSMAF	41013	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	64133013	64133210	64133061	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	YTHDF3	53901	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	66641187	66641625	66641410	Y	PDE7A	NA	NA	NA	NA	NA	MTFR1	86218	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	68098646	68098899	68098873	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	COPS5	104628	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	68147841	68148210	68148008	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ARFGEF1	105702	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	69672075	69672426	69672227	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C8orf34	431118	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.35576399394136
chr8	69837388	69837920	69837570	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	538939	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	69883083	69883390	69883339	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	493469	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr8	69961345	69961578	69961445	Y	SULF1	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	415281	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	69992271	69992467	69992381	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	384392	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	70033144	70033349	70033247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	343510	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	70042378	70042779	70042585	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SULF1	334080	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	71503238	71503393	71503365	Y	NA	TRAM1,RP11-382J12.1	NA	NA	NA	NA	TRAM1	15229	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	72836370	72836680	72836477	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	MSC	81667	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	77515612	77515766	77515691	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	75688	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	77731385	77731402	77731393	Y	ZFHX4	NA	NA	NA	NA	NA	ZFHX4	139931	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	82167350	82167604	82167486	Y	NA	FABP5	ZNF704,PAG1,FABP12	IMR90	Hi-C	24141950	FABP5	22994	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	97136855	97137003	97136873	Y	NA	GDF6	NA	NA	NA	NA	GDF6	34017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	97975205	97975619	97975502	Y	PGCP	NA	NA	NA	NA	NA	TSPYL5	312557	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	99225483	99225848	99225614	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NIPAL2	78773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	99411965	99412163	99412094	Y	NIPAL2,KCNS2	KCNS2	NIPAL2,STK3,POP1,KCNS2	IMR90	Hi-C	24141950	KCNS2	25087	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	99478821	99479039	99478921	Y	NA	KCNS2	NA	NA	NA	NA	KCNS2	41571	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	3.05069453994669
chr8	99952283	99952358	99952318	Y	OSR2	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	697	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	99952429	99952792	99952702	Y	NA	STK3,OSR2	NA	NA	NA	NA	STK3	263	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	101801288	101801504	101801352	Y	NA	NA	PABPC1,SNX31	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	PABPC1	68251	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	103249003	103249378	103249091	Y	UBR5,KLF10,RRM2B,RRM2B	KB-431C1.4	NA	NA	NA	NA	RRM2B	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	107870700	107870850	107870776	Y	NA	NA	ANGPT1	IMR90	Hi-C	24141950	TAGLN2P1	162459	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	109230729	109230920	109230833	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EIF3E	214642	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	111381887	111381916	111381903	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SYBU	679867	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	117476077	117476257	117476175	Y	C8orf85	NA	NA	NA	NA	NA	UTP23	300485	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	118743302	118743393	118743321	Y	NA	NA	EXT1,MED30,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	212350	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr8	118776615	118776789	118776702	Y	NA	NA	MED30,EXT1,SAMD12	IMR90	Hi-C	24141950	MED30	245663	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	118859857	118860327	118860104	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	261765	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	118894000	118894167	118894051	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	227925	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	118969079	118969407	118969255	Y	MED30	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	152685	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr8	119013126	119013396	119013387	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	108696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr8	119047899	119048328	119048216	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	73764	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	119068312	119068746	119068717	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	53346	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	119313185	119313253	119313219	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	EXT1	191093	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	119627018	119627217	119627123	Y	NA	SAMD12	NA	NA	NA	NA	SAMD12	5017	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	119808728	119809168	119808881	Y	TNFRSF11B	RPS26P35	TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	RPS26P35	36288	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	120063756	120064086	120063927	Y	NA	NA	SAMD12,SAMD12-AS1,TNFRSF11B	IMR90	Hi-C	24141950	TNFRSF11B	101317	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	123446302	123446696	123446499	Y	NA	RP11-94A24.1	HAS2	IMR90	Hi-C	24141950	RP11-94A24.1	7512	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	123908169	123908483	123908299	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	DERL1	144180	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	126232175	126232753	126232302	Y	MTSS1,KIAA0196,NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	130093	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	126238973	126239274	126239019	Y	NSMCE2,TRIB1	NA	NA	NA	NA	NA	KIAA0196	136891	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	128099457	128099542	128099514	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM84B	530819	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	128352367	128352670	128352528	Y	MYC	NA	LOC727677	IMR90	Hi-C	24141950	MYC	393010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	128822251	128823013	128822500	Y	NA	PVT1	NA	NA	NA	NA	PVT1	17472	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	128919831	128920544	128920233	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100313	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	128961875	128962320	128962073	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	58537	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	129076309	129076777	129076518	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	55452	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	129121216	129121486	129121350	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RNU4-25P	100359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	130876466	130876830	130876577	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	150545	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	130907129	130907396	130907263	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	119979	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	131218440	131218995	131218822	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FAM49B	191065	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	131271304	131271556	131271460	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	182350	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	131271729	131272058	131271952	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	181848	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	131289962	131290145	131290029	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	163761	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	131296023	131296343	131296248	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ASAP1	157563	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	134368494	134368766	134368633	Y	NDRG1	ST13P6	WISP1,NDRG1,TG,ST3GAL1	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ST13P6	49483	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	135843585	135843751	135843688	Y	ZFAT	NA	ZFAT,MIR30D,MIR30B	IMR90,MCF7,K562	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	ZFAT	120293	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	141598802	141599709	141599120	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	CHRAC1	79405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	141800912	141801386	141801027	Y	TRAPPC9,CHRAC1,EIF2C2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	208929	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	141886994	141887102	141887066	Y	PTK2	NA	NA	NA	NA	NA	PTK2	123213	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	142215999	142216277	142216212	Y	DENND3,SLC45A4	NA	NA	NA	NA	NA	DENND3	90622	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr8	144328155	144328364	144328211	Y	NA	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	ZFP41	875	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	144360422	144361034	144360946	Y	ZNF707,LY6E,ZC3H3,TSTA3,TIGD5,PYCRL,NAPRT1,EEF1D,EEF1D,ZFP41,GLI4,TOP1MT	ZFP41,GLI4,RP13-582O9.5,ZNF696	NA	NA	NA	NA	RP13-582O9.5	826	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	144948428	144948782	144948624	Y	EPPK1	PUF60,NRBP2,EPPK1	NRBP2	IMR90	Hi-C	24141950	EPPK1	1850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr8	145015768	145015971	145015849	Y	FAM83H,EPPK1,PLEC,PLEC,PLEC	PLEC,GRINA	NA	NA	NA	NA	PLEC	32931	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	4241498	4241696	4241599	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GLIS3	104696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	4340074	4340431	4340362	Y	NA	GLIS3	GLIS3,RFX3,GLIS3-AS1,KIAA0020	IMR90	Hi-C	24141950	GLIS3	5961	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	5536750	5536929	5536840	Y	CD274,PDCD1LG2,KIAA1432	PDCD1LG2	NA	NA	NA	NA	PDCD1LG2	28205	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	5587158	5587341	5587267	Y	C9orf46,CD274,KIAA1432	KIAA1432	NA	NA	NA	NA	KIAA1432	39684	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	12818643	12818927	12818803	Y	NA	RP11-3L8.3	NA	NA	NA	NA	RP11-3L8.3	6299	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	18718417	18718817	18718751	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ADAMTSL1	246525	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	20552301	20552464	20552406	Y	MLLT3	NA	NA	NA	NA	NA	MLLT3	68078	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	22040932	22041035	22040938	Y	NA	CDKN2A,CDKN2B,UBA52P6	NA	NA	NA	NA	UBA52P6	30778	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	26243860	26243998	26243927	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TUSC1	567004	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	27416206	27416570	27416389	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	PLAA	470745	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	29826048	29826378	29826215	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RPS26P2	1003845	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	34681857	34682174	34682025	Y	ARID3C,IL11RA,IL11RA	SIGMAR1,GALT,IL11RA,RP11-195F19.9,RP11-195F19.5	NA	NA	NA	NA	RP11-195F19.5	17748	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	35114116	35114547	35114222	Y	DNAJB5,KIAA1539	VCP,FANCG,PIGO,STOML2,UNC13B	NA	NA	NA	NA	FAM214B	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	35491656	35492052	35492019	Y	OR13J1,TPM2,CREB3,CCDC107,RUSC2	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	3532	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	35520478	35520852	35520494	Y	NA	RUSC2	NA	NA	NA	NA	RUSC2	32354	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	35726275	35726587	35726326	Y	NA	TPM2,CREB3,TLN1,RGP1,GBA2	NA	NA	NA	NA	CREB3	3745	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	36166552	36166755	36166690	Y	CREB3,TLN1	GLIPR2,CLTA	NA	NA	NA	NA	CLTA	22098	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	37771609	37771892	37771762	Y	NA	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	26607	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	37773119	37773290	37773253	Y	FRMPD1	DCAF10,EXOSC3	NA	NA	NA	NA	DCAF10	25209	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	37938183	37938323	37938277	Y	SHB	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-613M10.9	128361	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	38066980	38067628	38067261	Y	SHB	RP11-613M10.9	NA	NA	NA	NA	SHB	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	38388338	38388577	38388438	Y	ALDH1B1	ALDH1B1,IGFBPL1	NA	NA	NA	NA	ALDH1B1	2084	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	38437570	38437747	38437611	Y	NA	ALDH1B1,IGFBPL1	TOMM5,IGFBPL1,ALDH1B1	IMR90	Hi-C	24141950	IGFBPL1	15126	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	5.79631962589872
chr9	66455332	66455763	66455668	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1997612	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	68423908	68424365	68424207	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	29010	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	68455261	68455556	68455421	Y	NA	RP11-764K9.4	NA	NA	NA	NA	RP11-764K9.4	1886	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	72591131	72591428	72591305	Y	NA	NA	MAMDC2,LOC100507299,LOC100507244,SMC5,TRPM3,TJP2	IMR90	Hi-C	24141950	MAMDC2	65069	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	72653472	72653608	72653542	Y	NA	MAMDC2	MAMDC2	IMR90	Hi-C	24141950	MAMDC2	2889	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr9	72776297	72776502	72776400	Y	MAMDC2	NA	NA	NA	NA	NA	SMC5	95435	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	72871058	72871439	72871223	Y	NA	SMC5	NA	NA	NA	NA	SMC5	498	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	73007611	73008045	73007709	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	19495	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	73021810	73022419	73022127	Y	NA	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	5121	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	73025885	73026723	73026293	Y	KLF9	KLF9	NA	NA	NA	NA	KLF9	817	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	73033763	73035382	73035076	Y	SMC5,KLF9	KLF9	TRPM3,SMC5,LOC100507299,KLF9	MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	KLF9	6223	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.915208361984008
chr9	73178223	73178568	73178449	Y	SMC5	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	150683	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	73215942	73217043	73216172	Y	KLF9	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	188402	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr9	73538474	73538618	73538546	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	KLF9	510934	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	74318584	74318670	74318629	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TMEM2	110936	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	75172533	75172850	75172692	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ZFAND5	194370	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	84889033	84889227	84889130	Y	FAM75D1	NA	NA	NA	NA	NA	TLE1	586813	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	86051693	86051979	86051837	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FRMD3	99482	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	87370377	87370471	87370425	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NTRK2	88911	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	91146731	91147178	91146985	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	145397	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	91203331	91203480	91203406	Y	LOC286238	NA	NA	NA	NA	NA	SPIN1	201997	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	91795136	91795669	91795494	Y	C9orf47,SHC3	SHC3	NA	NA	NA	NA	SHC3	3454	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	93913194	93913593	93913428	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	LOC100129316,AUH,ROR2	IMR90	Hi-C	24141950	AUH	208602	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	93955243	93955725	93955362	Y	SYK,SYK,NFIL3	NA	NA	NA	NA	NA	AUH	166470	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	94968812	94969005	94968908	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	IARS	85033	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	96928795	96929410	96929111	Y	NA	MIRLET7D	NA	NA	NA	NA	MIRLET7D	9706	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	97684288	97685133	97684708	Y	NA	NA	FANCC	IMR90	Hi-C	24141950	C9orf3	197305	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	99132173	99132333	99132255	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367	NA	NA	NA	NA	SLC35D2	11659	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	99181547	99181719	99181643	Y	NA	SLC35D2,RP11-172F4.2,ZNF367,HABP4	NA	NA	NA	NA	ZNF367	2936	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	101557390	101557800	101557457	Y	NA	ANKS6,GALNT12	NA	NA	NA	NA	ANKS6	143	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	101871896	101872113	101872024	Y	TGFBR1	TGFBR1	NA	NA	NA	NA	TGFBR1	7576	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	102585833	102586368	102586147	Y	ERP44,NR4A3	RP11-554F20.1,NR4A3	NA	NA	NA	NA	NR4A3	3696	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	108058871	108059613	108059363	Y	ABCA1,TMEM38B,FSD1L,FSD1L	NA	NA	NA	NA	NA	SLC44A1	53968	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	112578765	112579213	112578950	Y	PALM2	RP11-406O23.2,PALM2-AKAP2,AKAP2	NA	NA	NA	NA	AKAP2	37996	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	112802389	112802506	112802448	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	214414	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	112827825	112828236	112827913	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	188684	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	112903621	112903940	112903708	Y	AKAP2	NA	NA	NA	NA	NA	TXN	112980	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	113699125	113699364	113699246	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LPAR1	99617	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	114720285	114720825	114720474	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	63239	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	114721832	114722310	114722097	Y	UGCG	NA	C9orf84,UGCG,MIR3134,SUSD1,HSDL2	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	UGCG	64786	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	114812315	114812544	114812429	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	123144	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.52534726997335
chr9	114812842	114813221	114813099	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	SUSD1	122467	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	115981344	115981857	115981657	Y	SNX30,SLC46A2,RGS3,SLC31A2,FKBP15	NA	NA	NA	NA	NA	FKBP15,SLC31A1	0	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	116304651	116305008	116304842	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	RGS3	99640	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	116918999	116919461	116919193	Y	NA	COL27A1	NA	NA	NA	NA	COL27A1	3159	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	117131457	117132230	117131898	Y	DFNB31,DFNB31,AKNA	AKNA	NA	NA	NA	NA	AKNA	22455	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	117860552	117860777	117860665	Y	NA	TNC	NA	NA	NA	NA	TNC	17759	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118353952	118354125	118354022	Y	TNC	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	475416	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118358577	118359027	118358666	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	TNC	480041	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118412488	118412760	118412588	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	501323	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118413110	118413431	118413289	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	500652	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	118430899	118431573	118430988	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	482510	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	118434933	118435213	118435118	Y	NA	NA	ASTN2,PAPPA,LOC100128505	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	478870	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	118453042	118453852	118453530	Y	NA	NA	PAPPA,ASTN2,LINC00474	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	460231	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118704303	118704501	118704353	Y	NA	NA	ASTN2,LINC00474,PAPPA	IMR90	Hi-C	24141950	PAPPA	209582	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	118917854	118918405	118917899	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	3771	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chr9	118953256	118953446	118953306	Y	PAPPA	PAPPA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	39173	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	119025545	119025710	119025628	Y	PAPPA	NA	NA	NA	NA	NA	PAPPA	111462	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	120523356	120523735	120523438	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	TLR4	58746	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	123834049	123834395	123834258	Y	TRAF1,TRAF1,CNTRL	CNTRL	CNTRL,TRAF1	IMR90	Hi-C	24141950	CNTRL	746	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	124031340	124031517	124031432	Y	GSN	RAB14	NA	NA	NA	NA	RAB14	48048	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	124383753	124383935	124383823	Y	DAB2IP	NA	NA	NA	NA	NA	GGTA1P	123447	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	124815475	124815645	124815560	Y	NA	TTLL11	NA	NA	NA	NA	TTLL11	38240	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	125109314	125109437	125109338	Y	NA	PTGS1	TTLL11,MIR4478,MORN5,NDUFA8,LHX6,RBM18,MRRF,PTGS1,OR1K1,PDCL	IMR90	Hi-C	24141950	PTGS1	21387	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	126297071	126297260	126297221	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	STRBP	268216	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	127457265	127457441	127457351	Y	NA	MIR181A2HG	NA	NA	NA	NA	MIR181A2HG	38519	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	130281582	130281994	130281773	Y	TOR2A,SH2D3C,FAM129B,CDK9	NA	NA	NA	NA	NA	FAM129B	57274	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	130834970	130835273	130835056	Y	FAM129B,TOR2A,SH2D3C,CDK9,SLC25A25	SLC25A25,NAIF1	NA	NA	NA	NA	NAIF1	6485	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	131900982	131901116	131901071	Y	ENDOG,PHYHD1,CRAT,IER5L	PPP2R4,CRAT,IER5L	NA	NA	NA	NA	CRAT	29514	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132330921	132331424	132331168	Y	IER5L,C9orf50	RP11-492E3.2	FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,C9orf50,PPP2R4,CRAT,IER5L,C9orf106,METTL11A	IMR90,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	RP11-492E3.2	4264	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	132369856	132370376	132370136	Y	CRAT,IER5L,C9orf106,PRRX2,GPR107	RP11-492E3.2,ASB6	NA	NA	NA	NA	ASB6	32068	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132385793	132386123	132385875	Y	C9orf106,TOR1B,PRRX2	ASB6,PRRX2	NA	NA	NA	NA	ASB6	16321	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132460473	132461091	132460806	Y	ASB6,PRRX2	PRRX2	NA	NA	NA	NA	PRRX2	34553	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	2.13548617796269
chr9	132464908	132465166	132465090	Y	C9orf50,PRRX2	PRRX2,PTGES	NA	NA	NA	NA	PRRX2	38988	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132539303	132540203	132539702	Y	C9orf106,FNBP1,TOR1B	PTGES,TOR1B,TOR1A	PPP2R4,PRRX2,PTGES,CRAT,IER5L,C9orf50,ASB6,METTL11A,C9orf78,USP20,TOR1B,TOR1A,FAM73B,DOLPP1,LOC100506190,GPR107	IMR90,K562,MCF7	Hi-C,ChIA-PET	24141950,22265404	TOR1B	23229	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132705367	132705623	132705495	Y	C9orf78,USP20,USP20,FNBP1	NA	NA	NA	NA	NA	FNBP1	97850	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	132758529	132758977	132758901	Y	FNBP1	FNBP1	NA	NA	NA	NA	FNBP1	44496	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	133736245	133736518	133736410	Y	ABL1	NA	NA	NA	NA	NA	FIBCD1	76155	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.83041672396802
chr9	134248752	134249121	134248943	Y	AIF1L,POMT1,PRRC2B	PRRC2B	PRRC2B,NUP214,FAM78A	IMR90	Hi-C	24141950	PRRC2B	18359	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	135994562	135994927	135994701	Y	ADAMTSL2,RALGDS	RALGDS,GBGT1	NA	NA	NA	NA	RALGDS	42374	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	136856624	136856782	136856656	Y	VAV2	VAV2,LINC00094	NA	NA	NA	NA	VAV2	898	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chr9	137221069	137221192	137221119	Y	RXRA	RXRA	NA	NA	NA	NA	RXRA	14125	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	138348639	138348707	138348673	Y	NA	MRPS2,C9orf116	NA	NA	NA	NA	MRPS2	41123	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	138915703	138915918	138915811	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	UBAC1	64477	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	140023271	140023604	140023504	Y	EHMT1,ABCA2,PNPLA7,NRARP,ANAPC2	MAN1B1,DPP7	NA	NA	NA	NA	DPP7	15642	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chr9	140023869	140024391	140024239	Y	NA	MAN1B1,DPP7	GRIN1	K562	ChIA-PET	22265404	DPP7	16240	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	7.0165974418774
chr9	140134697	140134985	140134927	Y	C9orf86,C9orf172,TRAF2,PTGDS,LCNL1,ABCA2,ENTPD2,UAP1L1,DPP7,GRIN1,TPRN,RNF208,PNPLA7,NOXA1,NELF,EXD3	TPRN,TMEM203,NDOR1,TUBB4B	NA	NA	NA	NA	TUBB4B	1032	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	1479744	1480128	1479953	Y	NA	SLC25A6	NA	NA	NA	NA	SLC25A6	29489	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	2625453	2625758	2625570	Y	ZBED1,ZBED1,DHRSX,CD99,ARSD	CD99,XG	NA	NA	NA	NA	CD99	18233	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	3732842	3733263	3733002	Y	PRKX	NA	NA	NA	NA	NA	PRKX	103193	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	9786668	9786951	9786810	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	WWC3	194651	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	13018875	13019023	13018949	Y	TLR7,TMSB4X	TMSB4X	NA	NA	NA	NA	TMSB4X	27648	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	14262210	14262757	14262259	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	GEMIN8	216198	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	18693104	18693424	18693141	Y	PHKA2,CDKL5	NA	NA	NA	NA	NA	CDKL5	251401	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	19701008	19701387	19701257	Y	SH3KBP1	NA	NA	NA	NA	NA	SH3KBP1	202332	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	23922308	23922544	23922448	Y	NA	APOO	NA	NA	NA	NA	APOO	1513	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	36981340	36981727	36981708	Y	PRRG1,PRRG1	NA	NA	NA	NA	NA	PRRG1	224801	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	39646201	39646652	39646229	Y	NA	GAPDHP1	NA	NA	NA	NA	GAPDHP1	811	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	4.27097235592537
chrX	40030956	40031200	40030978	Y	BCOR,CXorf38,ATP6AP2	BCOR	NA	NA	NA	NA	BCOR	3382	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	41759638	41759871	41759773	Y	NA	CASK	NA	NA	NA	NA	CASK	20845	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	43888590	43889088	43888779	Y	EFHC2	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	511159	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	1.22027781597868
chrX	44168721	44168911	44168853	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	FUNDC1	231336	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	44733657	44734406	44734027	Y	KDM6A	KDM6A	NA	NA	NA	NA	KDM6A	2900	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	45570603	45570921	45570704	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR221	32773	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	45617544	45618196	45618069	Y	NA	MIR221,MIR222	MIR222,MIR221	IMR90	Hi-C	24141950	MIR222	13014	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	45648299	45648762	45648585	Y	NA	MIR221,MIR222	NA	NA	NA	NA	MIR222	43769	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	46316161	46316444	46316394	Y	NA	GAPDHP65	NA	NA	NA	NA	GAPDHP65	18012	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	46989082	46989431	46989227	Y	NA	RBM10,NDUFB11	NA	NA	NA	NA	RBM10	12837	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chrX	47016809	47017199	47017004	Y	NA	RBM10,NDUFB11,UBA1	NA	NA	NA	NA	NDUFB11	13906	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	48350817	48351213	48350906	Y	WAS,RBM3,PORCN,OTUD5	SLC38A5,FTSJ1,PORCN,EBP,TBC1D25	NA	NA	NA	NA	PORCN	14137	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	52949996	52950343	52950129	Y	TSPYL2,KDM5C,FAM156A	FAM156B	NA	NA	NA	NA	FAM156B	31660	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	53468564	53468782	53468716	Y	IQSEC2	RIBC1,SMC1A,HSD17B10	NA	NA	NA	NA	HSD17B10	9244	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	62965283	62965341	62965311	Y	NA	ARHGEF9	NA	NA	NA	NA	ARHGEF9	38085	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	67291116	67291490	67291298	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	OPHN1	360265	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chrX	67905691	67905742	67905716	Y	STARD8	STARD8	NA	NA	NA	NA	STARD8	40183	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	68004355	68004677	68004478	Y	NA	EFNB1	NA	NA	NA	NA	EFNB1	42163	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	69655002	69655313	69655257	Y	DLG3	NA	NA	NA	NA	NA	PDZD11	146638	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	73340869	73341139	73340910	Y	RLIM	NA	NA	NA	NA	NA	USMG5P1	50586	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	73510244	73510542	73510484	Y	RLIM	FTX	NA	NA	NA	NA	FTX	867	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	73833460	73833840	73833652	Y	NA	RLIM	NA	NA	NA	NA	RLIM	1008	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	74960822	74961039	74960972	Y	NA	TTC3P1	NA	NA	NA	NA	TTC3P1	3710	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chrX	85196824	85197022	85197001	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	CHM	103544	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	85339971	85340972	85340615	Y	NA	CHM	NA	NA	NA	NA	CHM	39405	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	99903962	99904188	99904076	Y	SRPX2	TSPAN6,SRPX2	NA	NA	NA	NA	SRPX2	6747	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	100001357	100001522	100001440	Y	NA	SYTL4	SRPX2,SYTL4	IMR90	Hi-C	24141950	SYTL4	16247	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	106920003	106920801	106920325	Y	TSC22D3,TSC22D3	NA	TSC22D3	K562,MCF7,IMR90	ChIA-PET,Hi-C	22265404,24141950	PRPS1	50266	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	107441665	107441898	107441782	Y	COL4A5	NA	NA	NA	NA	NA	ATG4A	108767	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	108883543	108883897	108883721	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ACSL4	90735	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	120337126	120337342	120337247	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	C1GALT1C1	575121	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.610138907989339
chrX	125606277	125607115	125606755	Y	NA	MTND4P24	NA	NA	NA	NA	MTND4P24	1409	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	129218658	129218852	129218759	Y	SASH3,ELF4,ELF4	ELF4	NA	NA	NA	NA	ELF4	23839	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	129982936	129983220	129983074	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	ENOX2	51988	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	139855409	139855570	139855490	Y	NA	NA	NA	NA	NA	NA	LDOC1	413740	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	148684727	148685116	148684922	Y	NA	TMEM185A	NA	NA	NA	NA	TMEM185A	26452	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	149535049	149535581	149535391	Y	MAMLD1	MAMLD1	NA	NA	NA	NA	MAMLD1	7360	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	153308447	153308946	153308655	Y	ABCD1,ARHGAP4,RENBP,TEX28,TEX28,TAZ,MECP2,IKBKG,IKBKG,IKBKG,EMD,DNASE1L1,TMEM187,IRAK1	IRAK1	IRAK1,MIR718	MCF7	ChIA-PET	22265404	IRAK1	25016	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	153596671	153598676	153598064	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	2330	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669
chrX	153600469	153600779	153600667	Y	NA	FLNA,EMD,RPL10,TAZ,DNASE1L1	NA	NA	NA	NA	FLNA	227	CAGE	TE 354.T	hg19	FANTOM5	0.305069453994669